Seurat

安装seurat-wrappers包时报错,需要Seurat >= 5.0.0

报错 安装 seurat-wrappers包时报错,需要Seurat >= 5.0.0 加载seurat-wrappers包时 namespace ‘Seurat’ 4.4.0 is already loaded, but >= 5.0.0 is required library(SeuratWra ......

Seurat Tutorial 7:整合 scRNA-seq 和 scATAC-seq 数据

写在前面 学习一个软件最好的方法就是啃它的官方文档。本着自己学习、分享他人的态度,分享官方文档的中文教程。软件可能随时更新,建议配合官方文档一起阅读。推荐先按顺序阅读往期内容: 文献篇: 1.文献阅读:(Seurat V1) 单细胞基因表达数据的空间重建 2.文献阅读:(Seurat V2) 整合跨 ......
scATAC-seq scRNA-seq seq Tutorial 数据

Seurat Tutorial 6:整合大型数据集的技巧

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Seurat Tutorial 5:使用 reciprocal PCA (RPCA) 快速整合

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Seurat Tutorial 4:映射和注释查询数据集

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Seurat-Scanpy互通 | R-Python互通

单细胞数据分析发展到现在,已经分化为两大阵营,Seurat和Scanpy,一个代表了R,有丰富的多组学package支持,一个代表了Python,为大数据和AI而生,都有其各自独特的优势,不可被取代。 作为资深用户就很烦了,懂一个是不行的,必须两个都用,所以R和Python语言你必须都精通,否则非常 ......
Seurat-Scanpy R-Python Seurat Scanpy Python

单细胞实战(1)数据下载-数据读取-seurat对象创建

这篇文章我们将介绍从geo数据库下载单细胞测序数据后,多种数据格式多样本情况下,如何读取数据并创建seurat对象。 本文主要结构: 一、数据下载 二、数据读取与seurat对象创建 - 单样本情况下各种格式数据的读取,读取后seurat对象的创建 - 多样本情况下各种格式数据的读取,读取后seur ......
数据 单细胞 实战 对象 seurat
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