位点 区间 基因snp

echarts双x轴图区分区间

![](https://img2023.cnblogs.com/blog/1950214/202308/1950214-20230822150442568-1521728055.png) ``` option = { title: { text: '行情走势图', x: 'center', alig ......
区间 echarts

论随机数据区间长度和的期望

先给出结论,在 $n$ 足够大时,期望近似于 $\frac{n}{3}$ 纯数学推导 $$2*\frac{\sum_{l=1}^n\sum_{r=l}^n(r-l+1)}{n*n}$$ 先抛开2和分母 $$\sum_{l=1}^n\sum_{r=l}^n(r-l+1)$$ $$\sum_{l=1}^ ......
区间 长度 数据

区间合并

Smiling & Weeping 我多想痛哭一场。 然而我觉得这颗心, 比沙漠还要干燥。 题目链接:Problem - 4553 (hdu.edu.cn) 题目大意:就是一道区间合并的模板 Talk is cheap , show me the code 1 #include<iostream> ......
区间

2023-08-20 裸k交易 区间突破30例

成功突破: 案例1: 案例2: 案例3: 案例4: 案例5: 案例6: 案例7: 案例8: 案例9: 案例10: 案例11: 案例12: 案例13: 案例14: 案例15: 案例16: 案例17: 案例18: 案例19: 案例20: 案例21: 案例22: 案例23: 案例24: 案例25: 案例2 ......
区间 2023 08 20

《区间最值操作与历史最值问题》(吉如一)阅读笔记

## A. 基础区间最值操作 ### 问题描述 给定一个序列 $A$,需要支持以下操作: 1. 给定区间,将内部所有元素对 $X$ 取最大值。 1. 询问区间和。 ### 解法 首先,传统的线段树区间操作时间复杂度为 $\Theta(\log n)$,这是基于任何一个区间在线段树上作拆解,最终得到的 ......
区间 笔记 问题 历史

基于机器学习的基因组预测

[toc] ## 机器学习与GP 与动物育种相比,植物的基因组选择必须通过环境相互作用来考虑更大的基因型,并且需要添加适当的多环境试验数据。 机器学习 (ML) 和深度学习 (DL) 算法比线性预测模型更复杂,可以发现数据集中的非线性关系。与以前的方法相比,随机森林、支持向量机和人工神经网络由于其非 ......
基因组 基因 机器

主席树的区间修改

因为以前搞的主席树基本都忘了,故写一篇帮助记忆。 前置芝士: [主席树](https://zhuanlan.zhihu.com/p/250565583) 我发现网上的大部分代码码风和我不同,我希望主席树的打法和线段树差不多,所以我找到了一个和线段树差不多的打法。 首先,主席树如果涉及到区间修改,会稍 ......
区间 主席

RocketMQ重置消费位点

>RocketMQ 4.9.4 ### 重置功能 在RocketMQ Dashboard的主题界面,提供了两个功能 - 重置消费位点,按照时间戳重置指定消费者组的消费位点,会按照时间戳找到最接近的消息位点,RocketMQ在存储消息时会记录消息的存入时间。 - 跳过堆积,直接跳到最大消费位点。 ## ......
位点 RocketMQ

单一个体参考基因组的局限性

001、 在种质资源的群体变异与性状挖掘研究中, 通常需要借助1个参考基因组, 通过将重测序数据比对到参考基因上来鉴定个体间的遗传变异(Huang et al.,2012)。这种变异鉴定的方法受制于参考基因组序列及其与检测个体间的相似性, 参考基因组缺失的基因组信息以及与比对个体差异较大区域的信息将 ......
基因组 局限性 基因 个体

基因组组装质量的评价

001、 。 reference 祝光涛,黄三文.360度群体遗传变异扫描——大豆泛基因组研究[J].[2023-08-16].DOI:10.11983/CBB20096. ......
基因组 基因 质量

易基因:全基因组DNA甲基化测序(WGBS)揭示儿童哮喘增强子区域的整体低甲基化|科研速递

大家好,这里是专注表观组学十余年,领跑多组学科研服务的易基因。 哮喘(asthma)是儿童期最常见的慢性炎症性疾病,患病率2.6%~30.5%,儿童哮喘是世界范围内的一个主要健康问题。儿童哮喘是遗传和环境因素复杂互作结果,可导致表观遗传和免疫失调、气道炎症和肺功能受损。先前研究利用850K芯片对哮喘 ......
甲基 基因 儿童哮喘 强子 基因组

基因组组装技术的发展

001、 注: 01、Pacific Bio-sciences (PacBio)和Oxford Nanopore):长 片 段 单 分 子 测 序 技 术 02、BioNano genome mapping:辅助组装技术 03、High-throughput chromosome conformat ......
基因组 基因 技术

数字基因表达谱(Digital Gene Expression Profiling,DGE)

数字基因表达谱(Digital Gene Expression Profiling,DGE) 利用新一代高通量测序技术和高性能计算分析技术,能够全面、经济、快速地检测某一物种特定组织在特定状态下的基因表达情况。 数字基因表达谱已被广泛应用于基础科学研究、医学研究和药物研发等领域。 楼主应该是想说RN ......
基因 Expression Profiling Digital 数字

华为开发者大会2023:云空间筑牢鸿蒙生态“云基因”

8月4日,华为开发者大会2023在东莞·松山湖举办,众多开发者及合作伙伴共赴盛会,见证鸿蒙生态的最新进展。在本届大会的HarmonyOS应用开发(端云能力)分论坛上,华为Drive Kit生态架构技术总监官宣云空间服务升级,赋能开发者高效开发,为鸿蒙生态应用注入“云基因”。 ![](https:// ......
鸿蒙 开发者 基因 生态 大会

线性泛基因组和图形泛基因组

001、线性泛基因组 仅仅包含序列信息。 迭代组装、map-to-pan、个体de novo组装的泛基因组均是线性泛基因组。 002、图形泛基因组 图结构泛基因组是一个二维序列图谱,它以参考基因组为框架,以单个碱基作为图的节点,碱基间的前后关系作为图的边,存在序列差异的地方会自然形成不同的分支,呈现 ......
基因组 基因 线性 图形

基因型比值比(genotypic odds ratio)和等位基因比值比(allelic odds ratio)的计算

基因型比值比(genotypic odds ratio)和等位基因比值比(allelic odds ratio)是两个不同的概念。一般而言,通过PLINK、GCTA等工具计算得到的比值比指的是等位基因比值比。 以下是基因型比值比和等位基因比值比的各自计算公式。假设有`a/a`,`A/a`,`A/A` ......
比值 基因 ratio odds genotypic

泛基因组的概念

001、 Tettelin 等 在2005 首次在细菌的研究中提出泛 基因组(pan-genome)的概念,指整个物种基因组序列的非冗余集合,其中包括存在于该物种几乎所有个体中的核心基因组(core genome)和仅在部分个体中存在的可变基因组(accessory/variable/dispens ......
基因组 基因 概念

易基因:ChIP-seq等揭示转录因子NRF1调控原始生殖细胞发育、增殖和存活的表观遗传机制

大家好,这里是专注表观组学十余年,领跑多组学科研服务的易基因。 原始生殖细胞(Primordial germ cell,PGC)是生殖细胞前体,可以产生卵母细胞和精子,确保生命延续。尽管PGC特化(PGC specification)得到广泛研究,但PGC种群在出生前迁移到胚胎性腺后如何维持和扩大仍 ......
生殖细胞 表观 因子 基因 ChIP-seq

基因测序技术 一二三代

开通黄钻 基因测序技术 基因测序技术 基因测序技术的发展前景非常可观,目前为止共出现了三代测序技术,第一代测序技术以Sanger为主;第二代测序是以Illumina为代表的一系列技术;第三代是以Pacific Biosciences[4]公司和 Nanopore[5]公司的单分子测序为代表的测序技术 ......
基因 技术

三代测序数据从碱基识别、基因组组装、变异检测和甲基化修饰检测等方面的内容

王院长的报告涵盖了针对三代测序数据从碱基识别、基因组组装、变异检测和甲基化修饰检测等方面的内容。 在基因组组装算法方面,王院长分享了其团队在二代和三代测序数据基因组组装算法设计与分析方面的成果和突破。其中,针对长读长测序的高错误率以及错误分布不均匀等问题,王院长介绍了团队设计的一系列基因组组装和po ......
碱基 基因组 甲基 变异 基因

洛谷P9533 区间翻转区间异或和 题解

原题:[洛谷P9533](https://www.luogu.com.cn/problem/P9533) ## 一道性质题 #### 不难发现,区间翻转操作是没有用的*(虽然比赛的时候想了好久www)* 首先,区间翻转要想对答案有贡献,一定是下边这种情况: **三个连续的区间:$A~|~B~|~C$ ......
区间 题解 P9533 9533

华为OD机试-区间叠加

import java.util.ArrayList; import java.util.TreeMap; import java.util.stream.IntStream; public class Main { public static void main(String[] args) { ......
区间

为什么会变成这样呢? #3(并查集维护区间)

给定长度为 $n$ 的字符串 $S$ 以及 $m$ 个区间 $[l_i, r_i]$,记 $T=S[l_1,r_1]+\cdots+S[l_m,r_m]$,其中 $S[x,y]$ 表示从第 $x$ 个字符到第 $y$ 个字符的子串。求如何重新排列 $S$ 中字符的顺序使得 $T$ 的字典序尽可能大。 ......
区间

区间半群查询与 Ackermann 函数

最近在思考半在线卷积的复杂度有没有可能进一步优化, 决定先理清类似的问题以寻求经验. ## 一区间合并 如果询问的时候不能进行半群运算, 显然我们需要在预处理阶段处理所有答案, 必须进行 $O(n^2)$ 次计算. ## 二区间合并 如果询问的时候可以进行一次半群运算, 则可以把序列每次在中点处折开 ......
半群 区间 函数 Ackermann

区间DP详细解析

## 1.定义与性质 区间类动态规划是线性动态规划的扩展,它在分阶段地划分问题时,与阶段中元素出现的顺序和由前一阶段的哪些元素合并而来有很大的关系。 令状态 $dp_{(i,j)}$ 表示将下标位置 $i$ 到 $j$ 的所有元素合并能获得的价值的最大值,那么 $dp_{(i,j)}=max\{dp ......
区间

并查集处理区间跳跃

在网上胡乱找的一些关于并查集处理区间跳跃(也有叫区间覆盖/序列联通性,这类问题有没有什么统一叫法存疑?)的题目,或许能学习后成为一种套路 参考: [区间跳跃问题](https://www.cnblogs.com/TYH-TYH/p/10747781.html) ## [Knight Tourname ......
区间

区间 dp

## [模板区间 dp](https://vjudge.net/problem/%E6%B4%9B%E8%B0%B7-P3146) - 一个长 $n(n \le 248)$ 的序列,选择数列中两个相邻且相等的元素,删去其中一个元素并使另一个元素的值 $+1$,求数次操作后数列中的最大值 - 将这看做 ......
区间 dp

Codeforces 1857E:Power of Points 区间?

# [1857E.Power of Points](https://codeforces.com/contest/1857/problem/E "Codeforces 1857E") ## Description: - $n$ 个数:$x_1,···,x_n$,从左向右扫,当 $s=x_i$ 时,可 ......
区间 Codeforces Points 1857E Power

关于基因组选择(GS)中准确性(accuracy)和预测能力(prediction ability)的区别?

在基因组选择领域,"准确性"(Accuracy)和"预测能力"(Prediction Ability)是两个常用的评价指标,用于衡量基因组选择模型的性能。 在学术研究中,两者都有用到,但没有明显区分,容易出现混用情况。 以下是一篇文章中的定义: https://bmcgenomics.biomedc ......

猎人基因: ADHD的另一面

我在科学的海洋中探索,期待着每一个未知的发现。然而,人类的大脑仍然是一个充满神秘和奥秘的领域。在这一次的探索之旅中,我将带你一起研究一种被称为注意力缺陷多动障碍(Attention Deficit Hyperactivity Disorder,简称ADHD)的情况。一些人称之为“猎人基因”,但这是否 ......
猎人 基因 一面 ADHD