位点 区间 基因snp
C# 获取时间区间内所有的时间以及天数
var startTime = DateTime.Parse("2023-6-25"); var endTime = DateTime.Parse("2023-6-29"); int validDay = 0; for (DateTime currentDate = startTime; curre ......
易基因：近期染色质免疫共沉淀测序（ChIP-seq）研究成果｜项目集锦
大家好，这里是专注表观组学十余年，领跑多组学科研服务的易基因。 在生物学研究中，DNA与蛋白质之间的互作（DNA-Protein Interactions，DPIs）是至关重要的，参与基因的表达、调控、复制、重组和修复以及RNA的转运、翻译和调控等多个过程，几乎涉及所有的生命活动。本期以科研内容为序 ......
根据SRA号和参考基因组统计测序的X数
以SRR1770413 为例： 001、测序的碱基数目 测序碱基数目为：387.2M。 002、参考基因组的大小 a、下载参考基因组，并统计基因组的大小 [root@PC1 test01]# ls GCF_000005845.2_ASM584v2_genomic.fna.gz [root@PC1 t ......
如何统计参考基因组的大小
以绵羊为例： 001、下载绵羊参考基因组 a、 b、 [root@PC1 test02]# wget https://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/genomes/all/GCF/016/772/045/GCF_016772045.1_ARS-UI_Ramb_v2.0/GCF_01677 ......
SNP
核苷酸： 核苷酸是构成核酸（DNA和RNA）的基本组成单位。它是由三个组成部分组成：一个含氮碱基、一个五碳糖（核糖或脱氧核糖）和一个磷酸基团。 在DNA中，四种碱基包括腺嘌呤（adenine，简称A）、鸟嘌呤（guanine，简称G）、胸腺嘧啶（thymine，简称T）和胞嘧啶（cytosine，简 ......
一类区间统计点对贡献的题目
大概形如每次给定一个区间 $[L,R]$，每对 $L\le u<v\le R$ 的 $(u,v)$ 会有一个贡献，要求所有点对的贡献（取min/max，数颜色等）。 考虑点对共有 $O(n^2)$ 个，遍历一遍所有对也会超时。考虑删除一些无用的点对（例如包含的区间里面有比它更优的），那不看它也会有贡 ......
静态区间第k小
可持久化线段树 #include <cstdio> #include <algorithm> using namespace std ; const int maxn=200010; int a[maxn],b[maxn],blen,n,CNT; int sum[maxn<<5],lc[maxn<< ......
回文质数(快速求出一个区间内的所有回文数)
题目链接：[回文质数](https://www.luogu.com.cn/problem/P1217) code: ```cpp #include using namespace std; vector constructPalindromes(int start, int end) { vecto ......
区间选点问题
## 题目描述 数轴上有$n$开区间$(a_i，b_i)$,请选择尽量多的区间，使其两两不相交。(开区间意味着，左右两个端点是不包含的） ## 输入格式 第一行$n（n \le 1000000）$ ,之后$n$行，每行两个数分别为$ai，bi$， ## 输出格式 最少需要的点的个数 ## 样例 ## ......
选择不相交区间
## 题目描述 数轴上有$n$开区间$(a_i，b_i)$,请选择尽量多的区间，使其两两不相交。(开区间意味着，左右两个端点是不包含的） ## 输入格式 第一行$n$ 之后$n$行，每行两个数分别为$a_i，b_i$ ## 输出格式 最多能选择的区间个数 ## 样例 ### 样例输入1 ``` 3 ......
代码随想录算法训练营第35天 | ● 435. 无重叠区间 ● 763.划分字母区间 ● 56. 合并区间 - 第8章 贪心算法part05
第八章 贪心算法 part05 ● 435. 无重叠区间 ● 763.划分字母区间 ● 56. 合并区间 详细布置 今天的三道题目，都算是 重叠区间 问题，大家可以好好感受一下。 都属于那种看起来好复杂，但一看贪心解法，惊呼：这么巧妙！ 还是属于那种，做过了也就会了，没做过就很难想出来。 不过大家把 ......
易基因：ChIP-seq等揭示METTL14调控哺乳动物二价结构域的表观遗传机制｜科研进展
大家好，这里是专注表观组学十余年，领跑多组学科研服务的易基因。 组蛋白及其翻译后修饰在调控基因表达和其他染色质模板化过程中起着重要作用。组蛋白H3赖氨酸4三甲基化（H3K4me3）和组蛋白H3K27me3分别在小鼠植入前胚胎的基因激活和基因抑制中发挥重要作用。H3K4me3和H3K27me3组成的染 ......
植物全基因组选择（GS）研究进展
[toc] > 徐扬老师综述得很到位，读完此文基本能对目前植物GS有个大概的了解。 
问题描述 795. 区间子数组个数 (Medium) 给你一个整数数组 nums 和两个整数： left 及 right 。找 出 nums 中连续、非空且其中最大元素在范围 [left, right] 内的子数组，并返回满足条件的子数组的个数。 生成的测试用例保证结果符合 32-bit 整数范围。 ......
Different Integers (牛客多校) (区间不同数的个数+队列加倍的妙处, 莫队)
题目大意: 给一个序列 ai , 然后 m 次 询问 L,R , 每次回答 a1 al + ar an, 这2个区间的不同数的个数 思路1: 通过队列加倍, 将2个断开的区间,合在一起, 每次询问就是 R --L+n 然后区间不同数的个数, 将每一个数第一次出现位置的权值设置为 1, 其他为 0, ......
题解 P9196【[JOI Open 2016] 销售基因链】
套路题，来讲个套路解法。 如果没有后缀的要求，答案就是 trie 树的子树内字符串数量。现在加上了后缀，尝试继续使用 trie 树解决问题。 我们建立两棵 trie 树 $T_1,T_2$，其中 $T_1$ 是正常的 trie 树，$T_2$ 是每个字符串翻转后的 trie 树。这样的话，包含给定后 ......
LeetCode/区间子数组个数
给你一个整数数组 nums 和两个整数：left 及 right 找出 nums 中连续、非空且其中最大元素在范围 [left, right] 内的子数组，并返回满足条件的子数组的个数 ###1. 遍历区间右端点 + 同时记录满足条件的左边点位 数组中不能含有大于 right的元素， 且至少含有一个 ......
区间本质不同子串个数
对于这种询问区间本质不同的元素个数，我们通常有以下两种方案： - 记 $pre_x$ 为 $x$ 之前最靠后的一个与其本质相同的元素的位置，可以转化为偏序问题。 - 扫描线，每遇到一个元素，就在该位置 $+1$，在上一个本质相同元素处 $-1$，询问区间和。 可以发现，前一种统计的是第一个元素，后一 ......
易基因：NAR：ChIP-seq等揭示蛋白质酰基化与c-di-GMP协同调控放线菌发育与抗生素合成机制｜项目文章
易基因细菌ChIP-seq测序分析结果见刊《Nucleic Acids Research》 大家好，这里是专注表观组学十余年，领跑多组学科研服务的易基因。 2023年06月07日，华东理工大学生物工程学院和生物反应器工程国家重点实验室叶邦策教授和尤迪副教授为共同通讯作者、博士生符瑜为第一作者以“A ......
比较新冠病毒与蝙蝠和穿山甲冠状病毒基因组/蛋白序列比对，更好地了解COVID-19病原体SARS-CoV-2的起源与进化
比较新冠病毒与蝙蝠和穿山甲冠状病毒基因组/蛋白序列比对，更好地了解COVID-19病原体SARS-CoV-2的起源与进化 作者：王怡然 石育 赵月馨 沈讯 摘要：在新冠病毒COVID-19大流行的时代背景下，病毒的遗传信息对于其分类和可追溯性及其致病性至关重要。在全基因组水平上，SARS-CoV-2 ......
k 倍区间(同余定理,组合数)
题目描述 给定一个长度为 N 的数列，1,2,⋯A1,A2,⋯AN，如果其中一段连续的子序列 ,+1,⋯(≤)Ai,Ai+1,⋯Aj(i≤j) 之和是 K 的倍数，我们就称这个区间 [,][i,j] 是 K 倍区间。 你能求出数列中总共有多少个 K 倍区间吗？ 输入格式 第一行包含两个整 ......
【高中生物必修二】第四章 基因的表达
#第一节 基因指导蛋白质的合成 细胞核的DNA可以帮助合成细胞质的蛋白质，这一过程收到中间物质RNA的帮助。 RNA是由核苷酸组成（脱氧核糖的2号H变为OH），碱基从T变为U。RNA一般是单链，比DNA短，因此可以通过核孔从细胞核转移到细胞质。 RNA主要分为三种 - 信使（messenger）RN ......
宏基因组技术及其在微生物学研究中的应用
《宏基因组技术及其在微生物学研究中的应用》 学 院： 食品与生物工程学院 小组成员：颜传永 22020080057 材料收集 尹立来 22020080059 材料收集 余文韬 22020080060 文本编写 鄢楚洋 22020080056 文本编写 二○二三年 六 月 宏基因组技术及其在微生物学研 ......
土壤微生物组——从宏基因组学到元基因组学
土壤微生物组——从宏基因组学到元基因组学 摘要：土壤微生物主导着包括植物生长和碳等其他营养物质循环在内的各种重要过程。然而，大多数土壤微生物尚未被分离出来，它们的功能在很大程度上是未知的。虽然宏基因组测序揭示了微生物的物种信息和功能基因信息，但它包含了很多具有巨大不同生理状态下的微生物DNA。因此， ......
细菌素基因在植物乳杆菌各谱系中的分布
小组成员及分工： 组长-封徐杰-选定课题组研究相关的生物信息学文献，组织讨论文献中内容以及分析工具和方法，博客的最终提交； 组员-李震-负责文献大部分的翻译工作； 组员-庹冉-负责文献中采用的生物信息学方法的介绍； 组员-江思近-负责博文初稿的进一步润色。 介绍 植物乳杆菌，以前被命名为"植物乳杆菌 ......
易基因：全基因组DNA甲基化和小RNA分析揭示甘蓝型油菜种子的基因组不对称性
大家好，这里是专注表观组学十余年，领跑多组学科研服务的易基因。 多倍体是被子植物基因组进化中的一种持续现象，有助于现存开花植物的多样性。甘蓝型油菜（Brassica napus）是世界上最重要的被子植物油料作物品种之一，起源于Brassica rapa（An）和Brassica oleracea（C ......
【高中生物必修二】第三章 基因和DNA
# 第一节 DNA是主要的遗传物质 最初20世纪20年代，人们发现蛋白质由氨基酸组成，并猜测氨基酸的多种排列组合蕴含遗传信息。因为当时没有其他大分子有类似的特征，所以大家认为蛋白质是遗传物质。 20世纪30年代，科学家发现DNA由脱氧核苷酸（磷酸，碱基和脱氧核糖）组成。四种碱基（ATGC）构成四种脱 ......
R语言无套利区间模型期货期现研究：正向套利和反向套利次数、收益率分析华泰柏瑞300ETF可视化|附代码数据
全文链接：http://tecdat.cn/?p=31973 最近我们被客户要求撰写关于无套利区间模型的研究报告，包括一些图形和统计输出。 股指期货的套利交易有助于股指期货实现其价格发现以及风险规避的功能，因此提高套利交易的效率,对于发挥股指期货在经济发展中的作用有着重要的意义 本文帮助客户对期货期 ......
从宏基因组测序数据生成宏基因组组装基因组的计算工具
从宏基因组测序数据生成宏基因组组装基因组的计算工具 小组成员及分工 王嘉璐 22020080046：负责摘要、引言部分 王涵 22020080045：负责用于构建mag的上游分析工具部分 王婷 22020080047：负责总结，查找文献，博文整理汇总 1 摘要 微生物本质上与地球上的人类生活有着错综 ......