基因组 基因 科学家 观点

基于机器学习的基因组预测

[toc] ## 机器学习与GP 与动物育种相比,植物的基因组选择必须通过环境相互作用来考虑更大的基因型,并且需要添加适当的多环境试验数据。 机器学习 (ML) 和深度学习 (DL) 算法比线性预测模型更复杂,可以发现数据集中的非线性关系。与以前的方法相比,随机森林、支持向量机和人工神经网络由于其非 ......
基因组 基因 机器

《AB实验:科学归因与增长的利器》知识点

式中α是显著性水平,那么置信水平就是1-α,zα/2是标准整态概率分布上侧面积为a/2时的Z值。 https://weread.qq.com/web/reader/0cf32300813ab6eafg0191afk6ea321b021d6ea9ab1ba605 上面两个例子在进行假设检验的过程中有一 ......
知识点 利器 科学 知识

心理学与计算机科学 人脑与电脑

心理学与计算机科学的渊源颇深,两者之间相互启发促进由来已久。概因人脑与电脑,一碳一硅,本身就有很高的可比性。人工智能学科的奠基人之一,赫伯特·西蒙(Herbert Simon,又译司马贺)既是一位心理学家也是一位计算机科学家,并获1975年图灵奖、1978年诺贝尔经济学奖以及美国心理学会的多项至高奖 ......
人脑 心理学 心理 计算机 科学

单一个体参考基因组的局限性

001、 在种质资源的群体变异与性状挖掘研究中, 通常需要借助1个参考基因组, 通过将重测序数据比对到参考基因上来鉴定个体间的遗传变异(Huang et al.,2012)。这种变异鉴定的方法受制于参考基因组序列及其与检测个体间的相似性, 参考基因组缺失的基因组信息以及与比对个体差异较大区域的信息将 ......
基因组 局限性 基因 个体

基因组组装质量的评价

001、 。 reference 祝光涛,黄三文.360度群体遗传变异扫描——大豆泛基因组研究[J].[2023-08-16].DOI:10.11983/CBB20096. ......
基因组 基因 质量

易基因:全基因组DNA甲基化测序(WGBS)揭示儿童哮喘增强子区域的整体低甲基化|科研速递

大家好,这里是专注表观组学十余年,领跑多组学科研服务的易基因。 哮喘(asthma)是儿童期最常见的慢性炎症性疾病,患病率2.6%~30.5%,儿童哮喘是世界范围内的一个主要健康问题。儿童哮喘是遗传和环境因素复杂互作结果,可导致表观遗传和免疫失调、气道炎症和肺功能受损。先前研究利用850K芯片对哮喘 ......
甲基 基因 儿童哮喘 强子 基因组

基因组组装技术的发展

001、 注: 01、Pacific Bio-sciences (PacBio)和Oxford Nanopore):长 片 段 单 分 子 测 序 技 术 02、BioNano genome mapping:辅助组装技术 03、High-throughput chromosome conformat ......
基因组 基因 技术

数字基因表达谱(Digital Gene Expression Profiling,DGE)

数字基因表达谱(Digital Gene Expression Profiling,DGE) 利用新一代高通量测序技术和高性能计算分析技术,能够全面、经济、快速地检测某一物种特定组织在特定状态下的基因表达情况。 数字基因表达谱已被广泛应用于基础科学研究、医学研究和药物研发等领域。 楼主应该是想说RN ......
基因 Expression Profiling Digital 数字

华为开发者大会2023:云空间筑牢鸿蒙生态“云基因”

8月4日,华为开发者大会2023在东莞·松山湖举办,众多开发者及合作伙伴共赴盛会,见证鸿蒙生态的最新进展。在本届大会的HarmonyOS应用开发(端云能力)分论坛上,华为Drive Kit生态架构技术总监官宣云空间服务升级,赋能开发者高效开发,为鸿蒙生态应用注入“云基因”。 ![](https:// ......
鸿蒙 开发者 基因 生态 大会

探索神秘学的世界:塔罗牌、炼金术与现代科学的交汇

## 引言:塔罗牌的启示 作为一个探索人类心灵奥秘的心理学爱好者,我始终被塔罗牌的神秘引力所吸引。我的塔罗老师,一位在英国学习心理学的知识渊博者,引导我走进了这个充满符号与暗示的世界。 ## 第一章节:塔罗牌与心理学的融合 ### 心理分析的工具 塔罗牌,这一套富有象征意义的卡片,通常用于心理分析和 ......
炼金术 科学 世界

线性泛基因组和图形泛基因组

001、线性泛基因组 仅仅包含序列信息。 迭代组装、map-to-pan、个体de novo组装的泛基因组均是线性泛基因组。 002、图形泛基因组 图结构泛基因组是一个二维序列图谱,它以参考基因组为框架,以单个碱基作为图的节点,碱基间的前后关系作为图的边,存在序列差异的地方会自然形成不同的分支,呈现 ......
基因组 基因 线性 图形

基因型比值比(genotypic odds ratio)和等位基因比值比(allelic odds ratio)的计算

基因型比值比(genotypic odds ratio)和等位基因比值比(allelic odds ratio)是两个不同的概念。一般而言,通过PLINK、GCTA等工具计算得到的比值比指的是等位基因比值比。 以下是基因型比值比和等位基因比值比的各自计算公式。假设有`a/a`,`A/a`,`A/A` ......
比值 基因 ratio odds genotypic

泛基因组的概念

001、 Tettelin 等 在2005 首次在细菌的研究中提出泛 基因组(pan-genome)的概念,指整个物种基因组序列的非冗余集合,其中包括存在于该物种几乎所有个体中的核心基因组(core genome)和仅在部分个体中存在的可变基因组(accessory/variable/dispens ......
基因组 基因 概念

易基因:ChIP-seq等揭示转录因子NRF1调控原始生殖细胞发育、增殖和存活的表观遗传机制

大家好,这里是专注表观组学十余年,领跑多组学科研服务的易基因。 原始生殖细胞(Primordial germ cell,PGC)是生殖细胞前体,可以产生卵母细胞和精子,确保生命延续。尽管PGC特化(PGC specification)得到广泛研究,但PGC种群在出生前迁移到胚胎性腺后如何维持和扩大仍 ......
生殖细胞 表观 因子 基因 ChIP-seq

软件测试|Python科学计算神器numpy教程(七)

![在这里插入图片描述](https://img-blog.csdnimg.cn/d712ed4f2b38417181e983b1457931be.png) ## Numpy遍历数组 当处理大量数据时,Python中的NumPy(Numerical Python)库是一个非常强大和高效的工具。它提供 ......
软件测试 神器 科学 教程 Python

软件测试|Python科学计算神器numpy教程(八)

![在这里插入图片描述](https://img-blog.csdnimg.cn/933c1217347449d6a32466ed60d37c7e.png) ## NumPy相关数组操作 ### 前言 NumPy是Python中用于数值计算和数据处理的强大库。本文将介绍如何使用NumPy进行数组操作 ......
软件测试 神器 科学 教程 Python

软件测试|Python科学计算神器numpy教程(九)

![在这里插入图片描述](https://img-blog.csdnimg.cn/ccac068bb27742f5ab1a8a9cadfec6e0.png) ## NumPy实现数组元素的增删改查 ### 前言 NumPy是Python中最常用的科学计算库之一,它提供了高性能的多维数组对象和各种用于 ......
软件测试 神器 科学 教程 Python

软件测试|Python科学计算神器numpy教程(五)

![在这里插入图片描述](https://img-blog.csdnimg.cn/355dc961da8e4a149f2c1a8c96abda3a.png) ## NumPy的高级索引功能 ### 前言 NumPy是Python中最受欢迎的科学计算库之一,它提供了丰富的功能来处理和操作数组数据。在本 ......
软件测试 神器 科学 教程 Python

软件测试|Python科学计算神器numpy教程(六)

![在这里插入图片描述](https://img-blog.csdnimg.cn/13a0e0c654c4419f946d2fa8b7686f40.png) ## NumPy的广播机制 ### 前言 NumPy是Python中最受欢迎的科学计算库之一,它提供了高性能的多维数组对象和丰富的数组操作功能 ......
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软件测试|Python科学计算神器numpy教程(三)

![在这里插入图片描述](https://img-blog.csdnimg.cn/bedd9fc3121e4c6d84205c3e076e16f1.png) ## NumPy创建区间数组的强大功能 ### 前言 NumPy是Python中最受欢迎的科学计算库之一,它提供了许多强大的功能来处理和操作数 ......
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软件测试|Python科学计算神器numpy教程(四)

![在这里插入图片描述](https://img-blog.csdnimg.cn/2de34b7817d24df2b55931a17498d2db.png) ## NumPy的索引和切片 ### 前言 NumPy是Python中最受欢迎的科学计算库之一,它提供了强大的多维数组对象和灵活的数据操作功能 ......
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基因测序技术 一二三代

开通黄钻 基因测序技术 基因测序技术 基因测序技术的发展前景非常可观,目前为止共出现了三代测序技术,第一代测序技术以Sanger为主;第二代测序是以Illumina为代表的一系列技术;第三代是以Pacific Biosciences[4]公司和 Nanopore[5]公司的单分子测序为代表的测序技术 ......
基因 技术

三代测序数据从碱基识别、基因组组装、变异检测和甲基化修饰检测等方面的内容

王院长的报告涵盖了针对三代测序数据从碱基识别、基因组组装、变异检测和甲基化修饰检测等方面的内容。 在基因组组装算法方面,王院长分享了其团队在二代和三代测序数据基因组组装算法设计与分析方面的成果和突破。其中,针对长读长测序的高错误率以及错误分布不均匀等问题,王院长介绍了团队设计的一系列基因组组装和po ......
碱基 基因组 甲基 变异 基因

计算机科学与技术专业

计算机科学与技术专业本专业核心课程包括:高等数学、数字电子技术、C语言程序设计、面向对象程序设计、计算机网络、数据结构、计算机组成原理、数据库原理、操作系统、UML统一建模、软件工程等等。高等数学高等数学是由微积分学,较深入的代数学、几何学以及它们之间的交叉内容所形成的一门基础学科。主要内容包括:数 ......
计算机 科学 专业 技术

科学家精神

科学家精神的主要内涵包括六个方面:胸怀祖国、服务人民的爱国精神,勇攀高峰、敢为人先的创新精神,追求真理、严谨治学的求实精神,淡泊名利、潜心研究的奉献精神,集智攻关、团结协作的协同精神,甘为人梯、奖掖后学的育人精神。 ​​​ ......
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科学史上一个著名的梦境,就是门捷列夫的元素周期表之梦

科学史上一个著名的梦境,就是门捷列夫的元素周期表之梦,当化学家门捷列夫苦苦追恋元素规律的时候,披在各种元素之上的那层薄纱始终不能够摘下,日复一日,冥思苦想,绞尽脑汁想着如何能够真正触摸那些神秘的元素,抓住它们规律,让单纯的暗恋呈现明确的规律。就在门捷列夫于疲倦中进入了梦乡。在梦里他看到一张表,元素们 ......
周期表 科学史 梦境 周期 元素

SigmaPlot 15(科学绘图软件) v15.0.0.13 英文版

SigmaPlot 15 是一款功能强大的科学绘图软件,可用于数据可视化、统计分析和报告生成。以下是对 SigmaPlot 15 的详细介绍。 点击获取SigmaPlot 15 数据导入与整理:SigmaPlot 15 支持导入多种数据格式,包括Excel、CSV、文本文件等。用户可以轻松导入实验数 ......
英文版 SigmaPlot 科学 软件 15

@物空必能 的 反相观点

@物空必能 的 反相观点 见 《GPS应用相对论的说法纯属搞笑》 https://tieba.baidu.com/p/8515773857 26 楼, 转贴如下 。 “ 物空必能: 不是,本质完全不同。老李是站在荒唐的相对运动论的粪坑里反相的,我是站在牛顿正确的空间绝对静止观及其绝对静止及绝对运动论 ......
观点

关于基因组选择(GS)中准确性(accuracy)和预测能力(prediction ability)的区别?

在基因组选择领域,"准确性"(Accuracy)和"预测能力"(Prediction Ability)是两个常用的评价指标,用于衡量基因组选择模型的性能。 在学术研究中,两者都有用到,但没有明显区分,容易出现混用情况。 以下是一篇文章中的定义: https://bmcgenomics.biomedc ......