基因组 基因 科学家 观点
为什么Python是数据科学家的首选语言
 > > 这篇文章全面探讨了Python作为数据科学领域首选语言的原因。从Python的历史、特性，到在数据科 ......
linux 中科学技术法和数值放在一起排序
sort：-g选项：按照通用数值排序，支持科学计数法 001、直接使用sort [root@PC1 test02]# ls a.txt [root@PC1 test02]# cat a.txt ## 测试数据 6.84017213908805e-10 6.27015779416403e-08 0.0 ......
POLIR: Polarization社会贫富分化的根本原因、科学的艺术化表达之客观主观与背景、以及权利的集中与社会发展
**尊重人的自主选择，人身、财产、自由**。 如果“老一套搞得通”，“要新一套干什么”？ 新老本不矛盾，**以新一代为主, 别绑架强迫**！ 你们怎么对待我和他人，有一天，你们的儿女就会被如此对待。 **Polarization社会贫富两极分化根本原因是“人为设计与压迫”政治经济斗争**。 不是客观 ......
《计算机科学导论》第五章课后作业解答（个人版）
复习题 1．计算机由哪三个子系统组成？ 计算机由输入/输出子系统、存储子系统和中央处理器（CPU）子系统组成。 2．CPU 由哪几个部分组成？ CPU 由算术逻辑单元（ALU）、控制单元和寄存器组成。 3．ALU的功能是什么？ ALU（算术逻辑单元）负责执行计算机中的所有算术运算和逻辑运算。 4．控 ......
（数据科学学习手札153）基于martin的高性能矢量切片地图服务构建
> 本文示例代码已上传至我的`Github`仓库[https://github.com/CNFeffery/DataScienceStudyNotes](https://github.com/CNFeffery/DataScienceStudyNotes) # 1 简介 大家好我是费老师，在日常研发 ......
《计算机科学导论》第四章课后作业解答（个人版）
复习题 1．算术运算和逻辑运算有什么区别？ 算术运算是指对数字进行的运算，例如加、减、乘、除等。逻辑运算是指对布尔值（真/假）进行的运算，例如与、或、非等。 2．在二进制补码格式的整数相加中，最左边一列是怎样进位的？ 在二进制补码格式的整数相加中，最左边一列的进位被忽略。这是因为补码表示中，最左边一 ......
《计算机科学导论》第三章课后作业解答（个人版）
复习题 1. 说出5种计算机可以处理的数据。 a. 数字数据：整数和浮点数等数值类型数据。 b. 文本数据：字符、字符串和文本文档等。 c. 图像数据：以像素表示的图像或照片等。 d. 音频数据：以采样点表示的音频信号或音乐等。 e. 视频数据：连续图像的序列，构成视频或动画等。 2.位模式的长度如 ......
《计算机科学导论》第二章课后作业解答（个人版）
复习题 1. 定义一个数字系统： 数字系统是一种表示和处理数字的方法，用于表示数值和进行数学运算。它由数字集合、基数（底）、符号集合和表示规则组成。在数字系统中，数值由一系列数字和符号按照一定的规则排列组合而成。 2. 辨析位置化和非位置化数字系统： - 位置化数字系统：在这种数字系统中，每个数位的 ......
《计算机科学导论》第一章课后作业解答（个人版）
复习题 1. 定义一个基于图灵模型的计算机： 基于图灵模型的计算机是指使用图灵机作为理论基础的计算机。图灵机是英国数学家阿兰·图灵在1936年提出的一种抽象的计算模型，它由一个无限长的纸带和一个能在纸带上进行读写和移动的读写头构成。图灵机可以进行一系列状态转换，根据当前的状态和读写头所读取的符号，按 ......
基于 Graviton2处理器构建容器化基因分析工作负载
概述 相对于基于传统 x86架构的处理器来说，Amazon 设计的基于 ARM 架构的 Graviton 处理器为 EC2中运行的云工作负载提供了更佳的性价比。基于 Graviton2 的实例支持广泛的通用型、突发型、计算优化型、内存优化型、存储优化型和加速计算型工作负载，包括应用程序服务器、微服务 ......
易基因8种表观转录组m6A MeRIP-seq的差异甲基化区域（DMR）分析软件比较 | 生信专区
大家好，这里是专注表观组学十余年，领跑多组学科研服务的易基因。 RNA甲基化是近年来研究基因表达调控转录后变化的重要研究领域，包括N6-甲基腺苷（m6A）在内的各种类型RNA甲基化参与人类疾病发展。MeRIP-seq作为一种新兴的在转录组范围内定量检测m6A水平的测序技术，拓展了RNA表观遗传学研究 ......
行行AI人才直播第11期：墨尔本大学数据科学高级讲师-宫明明《机器学习：从统计到因果，人工智能的发展之路》
> 行行AI人才是博客园和顺顺智慧共同运营的AI行业人才全生命周期服务平台。 马克斯·普朗克智能系统中心主任曾在国际数学家大会进行了题为 From Statistical to Causal Learning 的报告，建立和理解人工智能系统的基本研究思路：从通过统计学习的符号方法到依靠因果关系概念的 ......
易基因：ChIP-seq等揭示H3K4me1修饰在蜜蜂级型分化中的表观遗传调控机制｜科研进展
大家好，这里是专注表观组学十余年，领跑多组学科研服务的易基因。 蜜蜂是一种真社会性昆虫，是研究社会性昆虫级型发育和级型分化的重要模式生物，其分工主要基于级型分化（蜂王(queen)和工蜂(worker)）。分化后，尽管基因组相同，但蜂王和工蜂具有不同的形态、生理、行为和寿命相关特征，级型分化的背后机 ......
"Management" by Stephen P. Robbins and Mary Coulter现代管理科学理论
现代管理科学理论： **Major Approaches to Management** 3000 BC – 1776: Early Management 1911 – 1947 Late: Classical Approach 1700s – 1950s: Behavioral Approach ......
生成式对抗网络在宏基因组研究中的应用
生成式对抗网络（GAN）在宏基因组研究中也有一些应用，以下是一些具体的应用领域： 宏基因组数据生成：宏基因组研究中，往往需要大规模的微生物组成和功能数据。使用GAN可以生成逼真的宏基因组数据，包括微生物的相对丰度、基因功能注释等，从而扩充数据集的规模和多样性。 数据降噪与去偏：宏基因组数据中存在大量 ......
生成式对抗网络与基因表达模拟
假设我们想要利用深度学习技术来进行基因表达模拟，主要目标是通过模型学习基因表达的规律，并生成合成的基因表达数据。以下是一个通俗易懂的举例： 假设我们有一个基因表达数据集，其中包含了许多基因的表达水平数据。我们想要训练一个深度学习模型，能够学习到这些基因表达数据的分布和规律，并且能够生成与之类似的合成 ......
如何科学的拍摄星空？ by VEmatches
架好三脚架，调整参数，对准星空，按下快门键。20秒后，一张星空图片就拍摄完成了。 如何拍摄星空？准备工作有哪些？  ......
DataSpell mac中文版专业数据科学家的IDE
DataSpell是一款专业的数据分析与挖掘工具(置顶文获取)，它基于 Spark平台，其功能非常强大。DataSpell是专业数据科学家的 IDE，可以让你轻松地创建、分析和编辑数据，并通过分析来创建各种各样的可视化图表和报告。 →→↓↓载DataSpell mac 1.专业的数据可视化 Data ......
基因与基因型的关系
基因（gene）是能够编码蛋白质或者RNA等具有特定功能产物的/负载遗传信息的基本单位，即有遗传效应的DNA片段 一个基因上有很多个位点，即碱基对ATGC，有某些位点杂合或纯合会导致不同的蛋白功能，从而变现出不一样的表型或症状，杂合或纯合就是不同的基因型 ......
统计的系统客观性与动态进化性•Freq频率与Bayes两大学派及争论•统计推断•Bayes学派及其基本观点与Bayes估计
**统计的系统客观性**： 统计数据及其活动不是片面的，而是系统客观反映客观现象。 周期的做“总体统计” + 随机/按需/周期做“抽样统计”； **统计的动态进化**性: 统计数据及其活动不是静止的，持续的更新(量变)与进化(质变)。 先验信息的收集挖掘和加工, 数量化, 形成"先验分布"并持续进化 ......
易基因： DNA甲基化差异水平分析中的DMC、DMR、DMG鉴定 | 干货分享
大家好，这里是专注表观组学十余年，领跑多组学科研服务的易基因。 DNA甲基化（DNA methylation）为DNA化学修饰的一种形式，能够在不改变DNA序列的前提下，改变遗传表现。所谓DNA甲基化是指在DNA甲基化转移酶的作用下，在基因组CpG二核苷酸的胞嘧啶5号碳位共价键结合一个甲基基团。大量 ......
SNP位点前后各50kb区间的基因
#!/usr/bin/perluse strict;use warnings;use Tie::File; my %genes;my @lines; tie @lines, 'Tie::File', 'D:\\Desktop\\3.txt' or die "Cannot open file: $!\ ......
关于沧一信竞发展的观点
Q.沧一的现状如何 A.高一（2022级）的生源貌似不太好，上回五校联考被泊头一中吊打，比如数学被甩了十几分，当然也可能是泊头一中太厉害了，泊头一中新高一已经打过邯郸一中了。所以现在的不等式链条为 沧一<邯郸一中<泊头一中。所以这次五校联考高一只让北大班参加，贻笑大方。 Q.如何看待河北中考 A.H ......
分面火山图--分别展示top25的基因
点击查看代码 ``` object.markers 0.15) #所有差异基因 #View(sig_dge.all) library(dplyr) object.markers % filter(p_val_adj % mutate(Difference = pct.1 - pct.2) libra ......
易基因： RRBS揭示基于DNA甲基化驱动基因的肾透明细胞癌预后模型的鉴定和验证｜项目文章
大家好，这里是专注表观组学十余年，领跑多组学科研服务的易基因。 肾细胞癌（RCC）是最常见的肾癌亚型，每年超400万例新发病例，是泌尿系统恶性肿瘤导致的第二大死因。2%-70%的RCC为透明细胞RCC（Clear cell renal cell carcinoma，ccRCC）。DNA甲基化（DNA ......
Scipy -- 科学计算库
## Scipy -- 科学计算库 目录： - **文件输入/输出： scipy.io** - **特殊函数： scipy.special** - **线性代数运算： scipy.linalg** - **插值： scipy.interpolate** - **优化和拟合： scipy.optimi ......
GSVA | 基因集变异分析 | 基因集通路打分
前作 转录相关signalling pathway活性打分 | 常见打分系统 | PROGENy 基于基因表达的打分模型 几种常见的打分方法： mean，最简单 Seurat的AddModuleScore，多了一个背景基因集，消除背景的影响，没什么意义，相当于设置了一个House keeping g ......
易基因｜表观遗传学与脑卒中：DNA甲基化的作用及衰老对血脑屏障修复的影响
大家好，这里是专注表观组学十余年，领跑多组学科研服务的易基因。 脑卒中（俗称中风）是导致死亡和长期残疾的主要原因，尤其是对于老龄人来说。脑卒中的平均生存时间为6-7年，许多患者存在身体残疾和晚期认知功能障碍。脑卒中后的神经功能预后取决于许多因素，包括年龄、梗死面积和部位、遗传因素以及脑修复程度。脑卒 ......
Inducible shRNA | 可诱导的shRNA基因敲除技术
前言 什么是siRNA，什么是shRNA？Small interfering RNA (siRNA)，Small hairpin RNAs (shRNA) 什么是可诱导shRNA？ 该系统工作的核心原件有哪些？Dicer、Ago、RNA-Induced Silencing Complex (RISC ......
PCR Genotyping | 利用PCR来确定基因型
前面已经利用了PCR做了一些核心的实验： 目标区域扩增 实时定量mRNA 这里的目的还是目标区域扩增，不过material不再是细菌DNA，而是human cancer cell line的DNA（只需要几千细胞即可）。 Kits和protocol： 2X Phire Tissue Direct P ......