基因组 大神 基因 时代
公司在职第四党支部开展 “传承红色基因，发扬两弹精神”主题党日活动，金刚石刀具
成都工具研究所有限公司的前身是成都工具研究所，于1956年创建于北京，是原机械工业部的直属研究所，是我国机械工业的综合性工具科研机构。公司官网：http://www.ctri.com.cn/公司主要从事精密切削工具、精密测量仪器以及表面改性处理技术的技术研究、产品开发和应用服务。 2020年9月5日 ......
易基因：RRBS等揭示DNA甲基化-肿瘤免疫逃逸-肾上腺皮质癌侵袭的相关性｜表观研究
大家好，这里是专注表观组学十余年，领跑多组学科研服务的易基因。 肾上腺皮质癌（Adrenocortical carcinoma，ACC）是一种罕见的侵袭性肾上腺内分泌癌。在肾上腺皮质癌中，最近研究表明以CpG岛甲基化表型(CpG island methylator phenotype，CIMP)为特 ......
宏基因组测序流程及其分析步骤
测序样本信息：完成了70个根际土壤样本的宏基因组测序。 数据预处理： 使用KneadData工具进行质控和去宿主处理。 利用Trimmomatic去除接头序列并进行质量过滤。 使用Bowtie2构建宿主库和进行去宿主处理。 从头组装：采用MEGAHIT工具对原始测序数据进行从头组装，生成contig ......
当下AIGC时代的软件开发模式——水母模式（水母式开发模式）
今天了解到一种新的软件开发模式————水母模式。 我们知道，软件开发的流程通常包括需求分析、软件设计、编码、测试、部署、维护这几个阶段。软件开发模式，指的是在软件开发过程中使用的一种组织和管理开发活动的模式和方法。它们提供了一套指导原则、最佳实践，帮助开发团队有效地开展工作，提高开发效率和质量。水母 ......
基因组选择GS应用的四个场景
目录GS应用的四个场景情景1情景2情景3情景4 本文整理自Giovanny E Covarrubias Pazaran博士的报告《Genomic Selection in R》，他是国际水稻研究所植物育种和遗传学博士，具有强大的统计学背景以及具有从事育种计划和实践研究的丰富经验，是R和SAS等不同软 ......
根据Accession id下载NCBI基因组
usage： 脚本就不注释了，会perl的都看得懂；测试了下，速度感人OTZ，淦！ #!/usr/bin/env perl use strict; use warnings; use Cwd qw/getcwd/; use Getopt::Long; use Net::FTP; use featur ......
【专题】2023科技加码国潮美妆消费新时代洞察报告PDF合集分享（附原数据表）
原文链接：https://tecdat.cn/?p=34074 近年来，随着中国消费升级的趋势，新兴消费品牌在市场上逐渐崭露头角。这些品牌以挑战者的身份进入市场，通过创新的供应链、产品和营销策略，以用户为核心满足新的消费需求，实现了短期内的强劲增长和销售规模的快速扩张。然而，经济环境、疫情冲击和激烈 ......
易基因：ChIP-seq等揭示BRWD3调控KDM5活性以维持H3K4甲基化水平的表观机制｜PNAS
大家好，这里是专注表观组学十余年，领跑多组学科研服务的易基因。 组蛋白修饰对调控染色质结构和基因表达至关重要，组蛋白修饰失调可能导致疾病状态和癌症。染色质结合蛋白BRWD3（Bromodomain and WD repeat-containing protein 3）是Cul4-DDB1 E3泛素连 ......
易基因： WGBS等从DNA甲基化揭示杀鲑气单胞菌灭活疫苗对大菱鲆的免疫力：抗性育种
大家好，这里是专注表观组学十余年，领跑多组学科研服务的易基因。 DNA甲基化是表观遗传学中最重要的修饰之一，在免疫应答中发挥着重要作用。自引进大菱鲆（Scophthalmus maximus，商品名：多宝鱼）以来，养殖规模不断扩大，其间各种细菌、病毒和寄生虫引起的疾病日益严重。因此，灭活疫苗以其独特 ......
易基因：番茄细菌性青枯病的噬菌体联合治疗｜国人佳作
大家好，这里是专注表观组学十余年，领跑多组学科研服务的易基因。 生物防治是利用细菌接种剂来改变植物根际微生物群落的组成，但在以往研究中存在有接种的细菌在根际建立不良，与本地微生物组争夺资源，干扰本地微生物的问题。而与细菌接种剂相比，噬菌体的主要好处是它们的宿主特异性，和只要有宿主细菌存在，即便是在其 ......
贺丰盈：网络创业时代已至，如何跟随互联网的步伐赚钱？
个人网络创业，由于势单力薄，力量和能力有限，因此有其自身的特点。针对这些特点，个人网络创业应该遵循下列基本原则：1.以自己的兴趣为主，做自己最感兴趣的事情。2.从自己最擅长的地方切入。扬己之长，避己之短。3.从简单做起，起步越简单越好。4.坚定自己的信念，增强自己的信心，切忌妄自菲薄，总觉得自己的东 ......
关于AI时代的程序架构的变化
以ChatGPT为代表的AI出现，表示着AI的零点时刻已经突破。现在AI的使用已经不用再多说了，实际上是已经侵入到各行各业。所有人都在疯狂寻找本行业AI的使用场景，这样的盛景只在互联网刚出现的时候能感受到。 马化腾说，这个AI有可能像电一样是重要的未来的基础元素。我感觉还是很有可能。原来波士顿动力的 ......
小红书疫情时代消费心理研究--小红书研究院
https://kdocs.cn/l/cc0b1U9MpYsc 报告阅读说明 研究对象：过去一年内在美妆、服饰、母婴、家电/数码、家居/家装、食品饮料、奢侈品品类中有过消费或目前拥有汽车产品的小红书用户；样本覆盖国内1-6线城市，总有效样本共2036个。研究数据：本次报告基于2023年1月收集的调研 ......
数控刀具加工厂，公司在职第四党支部开展 “重走长征路，建功新时代”主题党日活动
成都工具研究所有限公司的前身是成都工具研究所，于1956年创建于北京，是原机械工业部的直属研究所，是我国机械工业的综合性工具科研机构。公司官网：http://www.ctri.com.cn/公司主要从事精密切削工具、精密测量仪器以及表面改性处理技术的技术研究、产品开发和应用服务。 2021年6月26 ......
【专题】快消市场进入重塑期全渠道布局智胜消费重启时代报告PDF合集分享（附原数据表）
原文链接：https://tecdat.cn/?p=33907 越来越多的消费者通过社交媒体、朋友、家人和网络了解产品的真实情况，例如产品的成分和好处等。根据调查数据显示，有41%和21%的受访者表示经历疫情后更看重产品的实用性和简单性，而28%的受访者认为不再看重潮流。此外，高于看重的比例，有55 ......
数据的新维度：可视化地理信息的时代已来
倾斜摄影与可视化的结合正在改变我们对地理信息的认知方式。它使地理数据更加生动、易于理解，同时为各行各业的专业人员提供了更多可能性。 ......
易基因：WGBS等揭示植物基因体动态DNA甲基化与基因表达可塑性相关｜Genome Biol
大家好，这里是专注表观组学十余年，领跑多组学科研服务的易基因。 在一些真核生物中，DNA甲基化发生在基因编码区，称为基因体甲基化(gene body methylation，GbM)。尽管DNA甲基化在转座子和重复DNA沉默中的作用已得到很好的表征，但基因体甲基化与转录抑制无关，其生物学重要性尚不清 ......
智能化煤矿运输：数字孪生的崭新时代
煤矿是我国能源工业的重要支柱，然而，煤矿运输过程中一直存在着诸多问题，如安全隐患、能源浪费、效率低下等，这不仅对煤矿行业的可持续发展构成威胁，也对环境造成负面影响。因此，数字孪生技术应运而生，为煤矿运输领域带来了前所未有的改变。 ......
易基因：细菌微生物基因表达调控表观研究方案｜原核三代甲基化+转录组
1、原核甲基化 原核生物中的DNA甲基化 原核生物甲基化为什么基于三代测序？ 第三代DNA测序为原核细菌的甲基化和表观遗传的研究开辟了一条新的途径，能够在基因组的水平上获取整个表观遗传的序列信息，绘制全基因组甲基化组。 细菌中DNA甲基化研究意义 Matthew J. Blow等人通过对200多种不 ......
易基因：细菌微生物基因表达调控表观研究方案 | 原核三代甲基化+转录组
1、原核甲基化 原核生物中的DNA甲基化 原核生物甲基化为什么基于三代测序？ 第三代DNA测序为原核细菌的甲基化和表观遗传的研究开辟了一条新的途径，能够在基因组的水平上获取整个表观遗传的序列信息，绘制全基因组甲基化组。 细菌中DNA甲基化研究意义 Matthew J. Blow等人通过对200多种不 ......
Unity RectTransform中使用stretch模式时代码动态控制Left、Top、Right、Bottom
Unity RectTransform中使用stretch模式时代码动态控制Left、Top、Right、Bottom 对于屏幕进行适应的代码： var rect = panelObj.AddComponent<RectTransform>(); rect.anchorMin = Vector2.z ......
基于深度学习框架的基因组预测新模型SoyDNGP
目录简介材料方法数据集SoyDNGP的模型结构比对模型的处理主要结果SoyDNGP在大豆基因组预测中展现了出色的能力大豆基因组预测中SoyDNGP与其他算法的性能比较SoyDNGP模型在不同大豆群体中的多功能预测能力SoyDNGP 在大豆之外的广泛应用SoyDNGP是一个面向大豆基因组预测的开放友好 ......
基因组选择中的SVM
支持向量机（Support Vector Machines, SVM）是一种广泛应用于分类和回归问题的监督学习方法。在基因组选择（Genomic Selection, GS）的背景下，SVM主要用于二分类或回归问题，目的是预测个体的遗传潜力。 SVM的基本原理： SVM试图找到一个超平面，这个超平面 ......
全基因组选择中的p>n
当独立变量（或特征）的数量超过样本（或观察值）的数量时，会遇到所谓的“p > n”问题。在此，"p"指的是特征数量，而"n"指的是观察或样本数量。这里的特征可以是基因型数据中的单核苷酸多态性(SNPs)等。 以下是“p > n”问题的几个关键点： 过拟合: 当特征数量超过样本数量时，模型更容易过拟合 ......
深度学习模型在基因组选择中的预测能力（统计、总结）
Gianola et al. [61]: 应用：基因组选择。 比较：多层感知器（MLP）与贝叶斯线性回归（BRR）。 结果：在小麦数据集中，随着隐藏层神经元数量的增加，MLP的预测能力提高。MLP对BRR的性能提高了11.2%至18.6%。在Jersey数据集中，MLP也超越了BRR，特别是在脂肪产 ......
阿里云易立：以云原生之力，实现大模型时代基础设施能力跃升 | KubeCon 主论坛分享
今天，由云原生计算基金会 CNCF 主办的 KubeCon+CloudNativeCon+OpenSourceSummit China 2023 主论坛在上海举办。阿里云容器服务负责人易立在主论坛发表演讲，介绍阿里云为大模型提供的基础设施能力，以及通过云原生 AI 的方式助力大模型普惠提效。 ......
基因组数据的缺失数据的处理和标准化或归一化
基因组数据的预处理和整合至关重要，特别是当考虑到数据的不完整性、不规则性和大尺度。以下是一个全基因组选择中，如何处理基因组数据并将其输入神经网络的步骤： 1. 缺失数据处理 在基因分型过程中，可能会产生缺失数据。处理这些缺失数据的方法有很多，其中一些常见的方法是： 均值填充：使用该基因标记在所有样本 ......
基因分型数据与碱基序列的输入
基因分型数据和碱基序列的输入都是对DNA信息的编码，但它们的表达方式和所提供的信息不同。为了理解它们之间的联系，让我们首先明确这两者的定义： 基因分型数据： 基因分型数据通常是在特定的单核苷酸位置上（即SNP位置）对个体的DNA的描述。每个SNP位置可以有三种情况：两种纯合子和一种杂合子。例如，考虑 ......
基因分型数据
基因分型数据是对一个个体在特定的DNA位点或基因座的等位基因组成的记录。换句话说，基因分型是描述特定位置上DNA变化的方法。 DNA和变异: DNA由四种碱基：腺嘌呤(A)、胸腺嘧啶(T)、鸟嘌呤(C)和鸟苷酸(G)组成。大部分人类的DNA序列是相同的，但某些位置上存在变异。这些变异点上的不同版本被 ......