基因组 基因gt
GSVA | 基因集变异分析 | 基因集通路打分
前作 转录相关signalling pathway活性打分 | 常见打分系统 | PROGENy 基于基因表达的打分模型 几种常见的打分方法： mean，最简单 Seurat的AddModuleScore，多了一个背景基因集，消除背景的影响，没什么意义，相当于设置了一个House keeping g ......
# 泛型 \<T>
泛型是在C++中就已经存在的功能，而C#也自然继承了这一个非常重要的功能。 泛型可以应用于完全一致类型的数据交流，但由于不能事先知道数据类型，因此只能做一些访问和相互赋值功能。 例如如下代码 ~~~C# void swap(ref T a, ref T b) { T temp = a; a = b; ......
<<代码整洁之道>> 读书笔记(1-2)
## 整洁代码 1. 人工智能永远不能完全取代程序员, 因为客户的需求总是模糊的, 程序员不只是写代码, 也会去讨论/设计需求和架构 2. 糟糕的代码会杀死项目, 通常会在项目中后期体现出来, 此时项目的生产力快速下降, 影响正常迭代和问题修复 3. 对一个成熟的项目进行重新设计和编写, 往往会分散 ......
削弱力度——自然>人为
纠结了老久的一题：感觉都可以削弱，然后选了人的自身因素B，答案给出A。记录一下这类题。 其实，如果细想，A是和自然有关；其他与人有关。选一个正确的，应该蒙A。 ，Small hairpin RNAs (shRNA) 什么是可诱导shRNA？ 该系统工作的核心原件有哪些？Dicer、Ago、RNA-Induced Silencing Complex (RISC ......
PCR Genotyping | 利用PCR来确定基因型
前面已经利用了PCR做了一些核心的实验： 目标区域扩增 实时定量mRNA 这里的目的还是目标区域扩增，不过material不再是细菌DNA，而是human cancer cell line的DNA（只需要几千细胞即可）。 Kits和protocol： 2X Phire Tissue Direct P ......
关于>>,<<,>>>运行符，你了解多少？
今晚在看hashmap源码，看到>>>，说实话，玩JAVA这么久，我还真没怎么关注过位运算符，虽然我一早就知道这个怎么用，但是三箭头的，我还真没留意过，其实这叫无符号右移位运算符。 static final int tableSizeFor(int cap) { int n = -1 >>> Int ......
【Mybatis】常用的标签积累<sql>、<where>等
一· 常用标签组示例： 二、部分标签总结1.sql片段标签<sql>： 通过该标签可定义能复用的sql语句片段，在执行sql语句标签中直接引用即可。这样既可以提高编码效率，还能有效简化代码，提高可读性， 需要配置的属性：id="" >>>表示需要改sql语句片段的唯一标识 引用：通过<include ......
易基因：近期染色质免疫共沉淀测序（ChIP-seq）研究成果｜项目集锦
大家好，这里是专注表观组学十余年，领跑多组学科研服务的易基因。 在生物学研究中，DNA与蛋白质之间的互作（DNA-Protein Interactions，DPIs）是至关重要的，参与基因的表达、调控、复制、重组和修复以及RNA的转运、翻译和调控等多个过程，几乎涉及所有的生命活动。本期以科研内容为序 ......
记一次Nacos漏洞的复现 --> 身份认证绕过漏洞（QVD-2023-6271）
前记 端午前两天，遇到公司某客户的站点是Nacos，随后就是网上搜一波漏洞，搜到 QVD-2023-6271，故做以下记录 漏洞复现 漏洞描述 漏洞原理为开源服务管理平台 Nacos在默认配置下未对 token.secret.key 进行修改，导致远程攻击者可以绕过密钥认证进入后台造成系统受控等后果 ......
abc061d <单源最短路, spfa, 判断负环>
[D - Score Attack](https://atcoder.jp/contests/abc061/tasks/abc061_d) ``` // https://atcoder.jp/contests/abc061/tasks/abc061_d // 单源最短(长)路, spfa, 判断负( ......
abc060d <dp, 背包>
[D - Simple Knapsack](https://atcoder.jp/contests/abc060/tasks/arc073_b) ``` // https://atcoder.jp/contests/abc060/tasks/arc073_b // 背包问题 // 特别在于, 背包体 ......
根据SRA号和参考基因组统计测序的X数
以SRR1770413 为例： 001、测序的碱基数目 测序碱基数目为：387.2M。 002、参考基因组的大小 a、下载参考基因组，并统计基因组的大小 [root@PC1 test01]# ls GCF_000005845.2_ASM584v2_genomic.fna.gz [root@PC1 t ......
如何统计参考基因组的大小
以绵羊为例： 001、下载绵羊参考基因组 a、 b、 [root@PC1 test02]# wget https://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/genomes/all/GCF/016/772/045/GCF_016772045.1_ARS-UI_Ramb_v2.0/GCF_01677 ......
AtCoder Regular Contest 154 D A + B > C ?
[洛谷传送门](https://www.luogu.com.cn/problem/AT_arc154_d "洛谷传送门") [AtCoder 传送门](https://atcoder.jp/contests/arc154/tasks/arc154_d "AtCoder 传送门") **看到这种题，应 ......
abc059d <博弈, 打表找规律>
[D - Alice&Brown](https://atcoder.jp/contests/abc059/tasks/arc072_b) #### 如何打表 要善于通过打表展示视觉信息, 从而找到规律; ``` #include #include using namespace std; typed ......
abc058d <公式化简>
[D - ###](https://atcoder.jp/contests/abc058/tasks/arc071_b) 原计算公式为: $$ \sum\limits_{1\le i #include using namespace std; typedef long long LL; const ......
HTML---------页面元素标签<meta/>的使用
<meta/>标签用于定义页面的元信息(不会显示在页面中)，可重复出现在<head>头部标签中 （1） <meta name=”名称” content=”值” /> 在<meta/>标签中使用name和content属性可以为搜索引擎提供信息，其中name属性用于提供搜索内容的名字，content属 ......
【python】解决'charmap' codec can't decode byte 0x8d in position 1974: character maps to <undefined>
一、场景 使用paramiko连接ssh服务器，处理回显，然后报错 二、处理方法 问题代码 # encoding = chardet.detect(data) # if encoding.get('encoding'): # encode = encoding.get('encoding') # e ......
记录--新的HTML标签 ：<search>
这里给大家分享我在网上总结出来的一些知识，希望对大家有所帮助 本文介绍了一种新的HTML元素搜索方法，并提供了一个实用的工具来帮助开发者快速找到所需的元素。这对于那些需要处理大量HTML元素的开发者来说是非常有用的。文章还通过提供一些常见元素的用法示例，帮助开发者更好地理解和应用这些元素。在众多元素 ......
abc056d <todo>
https://atcoder.jp/contests/abc056/tasks/arc070_b ``` // https://atcoder.jp/contests/abc056/tasks/arc070_b // 查到多种做法 二分 / dp ... // 参考 https://blog.cs ......
abc055d <枚举>
https://atcoder.jp/contests/abc055/tasks/arc069_b 使用二进制枚举会更加简洁, 要有从进制角度思考问题的习惯 ``` // https://atcoder.jp/contests/abc055/tasks/arc069_b // 枚举, 尝试前两个动物 ......
abc054d <dp, 背包>
https://atcoder.jp/contests/abc054/tasks/abc054_d ``` // https://atcoder.jp/contests/abc054/tasks/abc054_d // 背包 // 这里开始的时候数据规模想错了, 所以用了map, 实际上可以用数组 ......
Springboot api的controller如何接口一个List<Object>参数
1.正常情况下，你可能会这样写： @PostMapping("/delete") @ApiOperation("Delete list data") @ResponseStatus(HttpStatus.OK) @ResponseBody public DBUpdateStatus deleteTe ......
abc051 <多源最短路>
https://atcoder.jp/contests/abc051/tasks/abc051_d ``` // https://atcoder.jp/contests/abc051/tasks/abc051_d // 一条边不含于任何一条最短路中, 当且仅当w[i][j] > dist[i][j] ......
abc050d <???>
``` #include #include #include using namespace std; typedef long long LL; map mp; const LL mod = 1e9 + 7; LL f(LL n) { if (mp[n]) return mp[n]; if (n ......
<学习笔记>组合数学
#### 插板法 问题一：现有 $n$ 个 完全相同的元素，要求将其分为 $k$ 组a，保证每组至少有一个元素，一共有多少种分法？ 考虑拿 $k-1$ 块板子插入到 $n$ 个元素两两形成的 $n-1$ 个空里面。 所以答案就是 $$\binom{n-1}{k-1}$$ 问题二：如果问题变化一下，每 ......
abc049d <并查集>
https://atcoder.jp/contests/abc049/tasks/arc065_b ``` // https://atcoder.jp/contests/abc049/tasks/arc065_b // 使用两个并查集维护连通关系 // 求并集, 使用每个并查集的祖宗节点组成的pai ......