基因组 序列 基因alignment
matlab使用长短期记忆(LSTM)神经网络对序列数据进行分类|附代码数据
全文下载链接:http://tecdat.cn/?p=19751 本示例说明如何使用长短期记忆(LSTM)网络对序列数据进行分类 。 最近我们被客户要求撰写关于LSTM的研究报告,包括一些图形和统计输出。 要训练深度神经网络对序列数据进行分类,可以使用LSTM网络。LSTM网络使您可以将序列数据输入 ......
P4331 [BalticOI 2004] Sequence 数字序列
[BalticOI 2004] Sequence 数字序列 Luogu P4331 题目描述 给定一个整数序列 \(a_1, a_2, \cdots , a_n\),求出一个递增序列 \(b_1 < b_2 < ··· < b_n\),使得序列 \(a_i\) 和 \(b_i\) 的各项之差的绝对值 ......
利用Python进行数据分析_Pandas_时间序列
时间序列 目录 ### [**1.日期和时间数据类型及工具**](#0) #### [**1.1 数据类型**](#1.1) - [**1.1.1 date**](#1.1.1) - [**1.1.2 time**](#1.1.2) - [**1.1.3 datetime**](#1.1.3) - ......
Postgresql中自增主键序列的使用以及数据传输时提示:错误:关系"xxx_xx_xx_seq"不存在
场景 Postgresql在Windows中使用pg_dump实现数据库(指定表)的导出与导入: https://blog.csdn.net/BADAO_LIUMANG_QIZHI/article/details/135011801 上面讲使用pg_dump进行postgresql的导出与导入。 如 ......
drf( Restful规范——序列化与反序列化——DjangoRESTframewordk用法——原生与drf实现接口)等
# Restful规范(重要-概念) ```python# API接口 》后端要提供api接口 》2000年Roy Fielding的博士论文中 ### restful是什么?REST全称是Representational State Transfer,表征性状态转移Web API接口的设计风格,尤 ......
Json序列化和反序列化(两种方式)
序列化:对象 >Json 反序列化:Json >对象 方式1:.NET3.5自带类库实现 .net3.5提供了json对象序列化与反序列化的类。位置在:System.Runtime.Serialization.Json空间下。其中如果要应用这个空间还必须添加对 System.ServiceModel ......
获取CPU序列号方法
using System.Management; private static string GetInfo() { string cpuInfo = "";//cpu序列号 ManagementClass cimobject = new ManagementClass("Win32_Process ......
python网站创建011:函数、序列化
经典函数: JS经典函数定义 function 函数名(a1,a2){ var a3 = a1+a2 return a3 } var res = 函数名(11,22) console.log(res) 那如何在浏览器中查看打印结果呢? 匿名函数: 没名字的函数,如果只有一个地方用到,则直接使用匿名函 ......
BZOJ4403 序列统计 题解
题目传送门 前置知识 排列组合 | 卢卡斯定理 解法 记 \(m=r-l+1,0 \le k \le n-1\) ,枚举长度 \(i\) ,等价于求 \(\sum\limits_{j=1}^{m}x_j=i\) 的非负整数解的数量。接着推式子就行。 \(\begin{aligned} \sum\li ......
最长公共子序列
最长公共子序列 一、什么是最长公共子序列(Longest Common Subsequence, LCS)? 最长公共子序列(LCS)是指在两个序列中,找出一个最长的子序列,使得这个子序列在这两个序列中都出现过。换句话说,就是从两个序列中删除一些元素后,剩下的最长公共子序列的长度。 二、原理 我们可 ......
Java反序列化漏洞-CC1利用链分析
@目录一、前置知识1. 反射2. Commons Collections是什么3. 环境准备二、分析利用链1. Transformer2. InvokeTransformer执行命令3. ConstantTransformer4. ChainedTransformer执行命令5. Transform ......
数字信号处理-序列的抽取与插值
0 前言 期中考好像就这里没考好呢,一看就是之前没好好听课没好好预习复习,到期中考也没弄懂这里(甚至发现作业题都忘记写了,那段时间忙比赛去了,真是得不偿失),所以才不会。 1 序列抽取 序列的$$D$$抽取 $$x_d(n)=x(Dn)$$,$$D$$为整数,叫抽取因子 意义:每个连贯的D抽样中抽一 ......
P2516 [HAOI2010] 最长公共子序列
求方案数,直接从 \(f[i-1][j]\) 和 \(f[i][j-1]\) 转移过来,如果 \(s1[i]==s2[j]\) 就加上 \(f[i-1][j-1]\) ,如果 \(s1[i]!=s2[j]\) 且 \(f[i][j]==f[i-1][j-1]\) 说明两边 转移到了 \(f[i-1] ......
基因组序列比对(read alignment)
基因组序列比对(read alignment)技术,是将测序得到的read与已有的参考基因组进行比对,找到read与参考基因组匹配的对应位置,继而得到序列比对的详细结果。 由于参考基因组碱基数极多,测序得到的read数据量极大,且测序的DNA序列中存在各种碱基变异和测序错误,因此不能直接将read与 ......
Inferring Developmental Trajectories and Causal Regulations with Single-cell Genomics用单细胞基因组学推断发育轨迹和因果规则
Inferring Developmental Trajectories and Causal Regulations with Single-cell Genomics Development is commonly regarded as a hierarchical branching pro ......
宏基因组测序相比于16S等测序技术的优势
宏基因组测序相比于16S rRNA基因测序技术有几个主要的优势: 全面性:宏基因组测序提供了对整个微生物群落基因组的综合视角,而不仅限于16S rRNA基因。这意味着它能够捕捉到更广泛的微生物多样性,包括细菌、古菌、真菌以及病毒。 功能信息:宏基因组测序不仅能够鉴定微生物群落中的物种,还能提供关于它 ......
asp.net core 使用newtonsoft完美序列化WebApi返回的ValueTuple
https://www.cnblogs.com/kugar/p/12334210.html 由于开发功能的需要,又懒得新建太多的class,所以ValueTuple是个比较好的偷懒方法,但是,由于WebApi需要返回序列化后的json,默认的序列化只能将ValueTuple定义的各个属性序列化成It ......
基因组变异分析
基因组变异分析 基因组变异是指与参考序列相比,基因组中发生的单碱基变异、DNA序列片段插入、缺失、扩增和复杂结构变异等。 目前基于测序方法进行单核苷酸多态性(Single Nucleotide Polymorphism, SNP)、短的插入缺失(Insertion-Deletion, InDel)等 ......
128. 最长连续序列
1.题目介绍 给定一个未排序的整数数组 \(nums\) ,找出数字连续的最长序列(不要求序列元素在原数组中连续)的长度。 请你设计并实现时间复杂度为 \(O(n)\) 的算法解决此问题。 示例 1: 输入:nums = [100,4,200,1,3,2] 输出:4 解释:最长数字连续序列是 [1, ......
易基因:动脉粥样硬化中的DNA甲基化和组蛋白修饰及其表观遗传治疗视角|综述
动脉粥样硬化(Atherosclerosis, as)是一种以动脉血管壁炎症和斑块积聚为特征的血管病变,是大多数心血管疾病的重要病因。除了脂质沉积和慢性炎症外,越来越多的证据表明表观遗传修饰与动脉粥样硬化越来越相关,并从治疗和生物标志物的角度都很有意义。本文就DNA甲基化和组蛋白翻译后修饰在动脉粥样 ......
最长不下降子序列
/* */ /* */ #include<cstdio> #include<iostream> #include<algorithm> #include<cmath> #include<string.h> #include<queue> #include<vector> #include<bits/ ......
AcWing 848. 有向图的拓扑序列
#include<iostream> #include<algorithm> #include<cstring> #include<queue> using namespace std; const int N=1e5+10; int e[N],ne[N],h[N],idx; int d[N],n, ......
Hadoop 数据类型及序列化
1.Hadoop数据类型 Java类型 Hadoop Writable类型 Boolean BooleanWritable Writable Writable Writable Writable Writable Writable Writable Writable Writable 2.为何Had ......
Aapche Dubbo Java反序列化漏洞(CVE-2019-17564)
Aapche Dubbo Java反序列化漏洞(CVE-2019-17564) 漏洞描述 Apache Dubbo是一款高性能、轻量级的开源Java RPC服务框架。Dubbo可以使用不同协议通信,当使用http协议时,Apache Dubbo直接使用了Spring框架的org.springfram ......
D. 相似基因 - 2023HBUCM程序设计竞赛
题面 p哥作为一名湖中医信息工程学院的同学,不仅对信息有兴趣,同时对生物也很有兴趣。相信大家从初高中生生物基本知识都知道,DNA基因可以看作一个碱基对序列。它包含了 \(4\) 种核苷酸,简记作 \(A,C,G,T\)。现在假设想计算两个基因的相似程度,相似度的计算方法如下: 对于两个已知基因,例如 ......
关于c++序列化
对于一个复杂数据对象的存储和装载有很多方式,比如自定义的文本或者2进制格式,以及对应的读取和写入程序。 也有一些适应力较强比较通用的方式,文本的有xml和json。尤其是xml文件查看起来比较方便。 但是xml的最大问题就是装载和保存都比较慢。装载1个大文件足以把头发等白:) 在c++里面也有一些2 ......
NOIP2023 T3 双序列扩展
强制 \(X_1 < Y_1\)(若不满足,交换 \(X\) 和 \(Y\) 即可)。 把问题抽象为在一个 \(n \times m\) 的 八连通 网格图上,满足 \(X_i \ge Y_j\) 的点 \((i, j)\) 处有障碍,问 \((1, 1)\) 和 \((n, m)\) 是否连通。 ......
基于机器学习的时间序列温度预测
本次研究是使用GRU模型和GRU-Attention模型对长时间序列温度数据进行预测拟合,对于这两个模型有兴趣的可以去网上了解一下, 首先是日数据预测,由于日数据存在缺失值需要对缺失值进行填补, 在对存在缺失值的数据中我使用三次样方插值对数据进行处理,其代码如下: import pandas as ......
易基因:MeRIP-seq等揭示m6A RNA甲基化以ABA依赖性方式调控草莓果实成熟
DNA甲基化等表观遗传标记在调控不同成熟阶段果实成熟中起着关键作用。m6A甲基化已被证明可以调控番茄成熟,但目前尚不清楚 mRNA m6A甲基化是否对不同类型水果的成熟调控具有功能保守性。 2021年6月,中国科学院植物研究所秦国政研究组在《Genome Biology》杂志发表题为“N6-meth ......
【算法】【线性表】最长连续序列
1 题目 给定一个未排序的整数数组num,找出最长连续序列的长度。 样例 1: 输入: num = [100, 4, 200, 1, 3, 2] 输出: 4 解释:这个最长的连续序列是 [1, 2, 3, 4]. 返回所求长度 4 2 解答 public class Solution { /** * ......