基因 变异gsva
高维数据惩罚回归方法：主成分回归PCR、岭回归、lasso、弹性网络elastic net分析基因数据|附代码数据
全文链接：http://tecdat.cn/?p=23378 最近我们被客户要求撰写关于高维数据惩罚回归方法的研究报告，包括一些图形和统计输出。 在本文中，我们将使用基因表达数据。这个数据集包含120个样本的200个基因的基因表达数据。这些数据来源于哺乳动物眼组织样本的微阵列实验 1 介绍 在本文中 ......
js数组方法之数组变异方法
push、pop、unshift、shift、sort、splice、reverse 以上这些方法都会改变原数组并且 这些方法的返回值是值得注意的有时候可以提高工作效率，比如pop方法的返回值是该元素(删去的第一个) 其他的都不多说了，还有一些非变异方法 了解一下 filter() //过滤数组中某 ......
易基因：METTL3介导的m6A甲基化谱调控肌肉干细胞成肌细胞状态转换｜发育分化
2020年9月29日，《Cell Death Discovery》（IF: 7.109）杂志发表了题为“A defined N6-methyladenosine (m6A) profile conferred by METTL3 regulates muscle stem cell/myoblast ......
单细胞转录组分析新篇章：挖掘人类胚胎基因表达的神秘密码
在这份报告中，我们使用了更新的Scanpy软件包对同一数据集（GEO number GSE109555）单细胞数据进行分析。相较于鄙人2021年发表的论文《Gene expression pattern of trophoblast-specific transcription factors in ......
易基因：群体分析揭示了DNA甲基化在番茄驯化和代谢多样性中的作用｜组学研究
大家好，这里是专注表观组学十余年，领跑多组学科研服务的易基因。 2023年3月23日，海南大学三亚南繁研究院/热带作物学院博士研究生郭昊等为第一作者、王守创教授为通讯作者在《Science China Life Sciences》杂志发表题为“Population analysis reveals ......
对眼，傻是遗传与基因的问题吗
今天是4月5日，因老家旧房子翻新装修，陪我的母亲去逛石材店铺，在城中村的一家石材店铺，见到一位1米5的老板，挺着大肚子，衣衫不整，他的家中破败不堪，似窝棚搭起的房子中，用纸隔板隔离出了几个房间，他家有3个儿子，无一例外每个儿子都是对眼儿，更有甚至，其中的2个儿子明显傻乎乎的，行为举止有异于常人。 如 ......
易基因： oxRRBS+RRBS揭示炎症性肠病导致发育异常的表观遗传机制｜甲基化研究
大家好，这里是专注表观组学十余年，领跑多组学科研服务的易基因。 2020年12月31日，美国明尼苏达大学Natalia Y. Tretyakova教授团队在《Int J Mol Sci》杂志发表题为“Multi-Omics Characterization of Inflammatory Bowel ......
MATLAB计算变异函数并绘制经验半方差图
本文介绍基于MATLAB求取空间数据的变异函数，并绘制经验半方差图的方法。 由于本文所用的数据并不是我的，因此遗憾不能将数据一并展示给大家；但是依据本篇博客的思想与对代码的详细解释，大家用自己的数据，可以将空间数据变异函数计算与经验半方差图绘制的全部过程与分析方法加以完整重现。 1 数据处理 1.1 ......
易基因-单细胞甲基化测序&单细胞转录组测序
大家好，这里是专注表观组学十余年，领跑多组学科研服务的易基因。 易基因单细胞甲基化测序&单细胞转录组测序 高通量单细胞DNA甲基化测序简介 单细胞DNA甲基化组学研究很大程度上受制于建库技术，传统的文库构建方法或类似于基因组DNA的单细胞扩增技术很难应用到甲基化实验过程中。目前单细胞甲基化研究主要受 ......
转录组学：解析基因表达的新视角
摘要：转录组学是一门研究全套转录产物（包括 mRNA、非编码 RNA 和其他 RNA 类型）的科学，旨在揭示基因表达调控机制及其在生物过程和疾病中的功能。本文将对转录组学的发展历程、主要技术方法、研究领域以及面临的挑战进行概述，以期为生物和医学科研工作者提供一个全面的转录组学认识。 1.引言随着高通 ......
易基因： m6A RNA甲基化研究的前期探索性实验思路｜干货系列
大家好，这里是专注表观组学十余年，领跑多组学科研服务的易基因。 近年来，m6A RNA甲基化作为国家自然科学基金表观遗传学研究的热门领域，相关研究成果层出不穷，高分文章不断。研究方向包括疾病发生发展、发育和分化、环境暴露与响应等。 研究人员为m6A甲基化课题申请作准备以及为降低m6A甲基化实验风险， ......
易基因：m6A mRNA甲基化修饰调控CTNNB1促进肝母细胞瘤增殖的机制研究｜Mol Cancer
大家好，这里是专注表观组学十余年，领跑多组学科研服务的易基因。 2019年12月23日，国家儿童医学中心（上海）、上海交通大学医学院附属上海儿童医学中心潘秋辉教授团队在《Molecular Cancer》（IF:41.444/Q1）杂志上发表了题为“m6A mRNA methylation regu ......
易基因：肠道菌群：早产儿出生后不同时间点肠道微生物定植的动态变化｜项目文章
易基因微生物组学测序分析成果见刊《Front Microbiol》 2023年02月17日，中国农业科学院深圳农业基因组研究所Adnan Khan、云南省第一人民医院米弘瑛为共同第一作者，中山大学附属第六医院郝虎/李思涛、南方医科大学附属佛山市妇幼保健院戴怡蘅为论文共同通讯作者在《Front Mic ......
【故障公告】它（变异的百度蜘蛛）又来了，雪上加霜又添恐怖的三月
今天12点左右，它又来了，熟悉的恐怖身影（116开头IP段、山西的某个城市），不是cc攻击，是那只让人敬畏的蜘蛛。2022年4月3日，它的首次来访在园子里掀起狂风暴浪，数据库连接数过万，负载均衡带宽跑满，带宽扩容50%依然跑满，当时我们通过限制同一个IP每天的请求数侥幸躲过。 ......
SARS-Cov-2参考病毒株Wuhan-Hu-1的基因序列与基因结构
NCBI查找相关 进入查找到的内容 点击FASTA查看序列 点击Gpraphics查看基因结构 ......
易基因：PIWI/piRNA在人癌症中的表观遗传调控机制（DNA甲基化+m6A+组蛋白修饰）｜综述
大家好，这里是专注表观组学十余年，领跑多组学科研服务的易基因。 2023年03月07日，南华大学衡阳医学院李二毛团队在《Molecular Cancer》杂志发表了题为“The epigenetic regulatory mechanism of PIWI/piRNAs in human cance ......
借助Radamsa变异数据（初探）
Radamsa 介绍 Radamsa是一款测试用例生成器，通常用来测试程序对格式错误和潜在恶意输入的承受能力（对程序进行模糊测试）。它通过你的输入来返回变异后的数据。它的主要卖点是，它已经在真正重要的程序中发现了许多错误。 Radamsa 使用方法 1、可以直接喂给它字符，它就会返回变异之后的数据给 ......