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Trends in Plant Science | 王向峰老师综述数据驱动的基因组设计育种

目录摘要将生物数据和知识转化为植物的精准设计育种机器学习(ML)在植物生物学中的应用案例研究:多组学数据关联研究(MODAS)中的数据降维(DR)亮点总结 今天简单回顾下中国农业大学王向峰教授团队2023年上半年发表在Trends in Plant Sicence的综述文章。该文阐释系统全面,值得赏 ......
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由基因型-组织表达项目(GTEx)联想开去

近日,由丹麦奥胡斯大学、华南农业大学、中国农科院基因组所、美国农业部、马里兰大学、爱丁堡大学和等多家单位联合发起的猪基因型-组织表达计划(PigGTEx)取得阶段性进展,成功构建猪基因型-组织表达图谱,相关文章 “A compendium of genetic regulatory effects ......
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机器学习应用于基因组预测,以苜蓿为例

目录目的示例代码表型文件预处理基因型文件预处理机器学习建模预测绘图其他结果 利用代码复现一个机器学习应用于基因组预测的项目,张志武老师于2023年发表在《园艺研究》上的一篇文章。 目的 使用 GWAS 和 GP 结合重测序数据和从世界各地收集的 220 份紫花苜蓿种质的秋季休眠(Fall dorma ......
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关于2023分子植物育种大会随笔记录与思考

目录智能育种转基因基因编辑育种实践 2023年底分子植物育种大会在成都举行,会后要点胡乱记录之。有些来自嘉宾观点,有些是个人思考,杂糅一起,仅供参考。 智能育种 分子设计育种:形态、生理、基因、等位基因、单倍型、基因组区段、通路、网络、表观组。统言之,生物相关分子皆可设计。 科迪华玉米GP预测(Al ......
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基于无人机高通量植物表型大数据分析及应用研究综述

目录数据采集无人机系统数据预处理图像拼接颜色转换和校正图像分割数据分析图像分析关键技术作物株高提取叶面积指数提取技术植物病害检测技术 基于无人机系统的作物表型分析方法集数据采集、处理和分析于一身,大大缩短和精简了作物表型研究的时间和过程。首先,利用小型无人机在作物种植区域进行图像数据的采集;获取完毕 ......
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Omics辅助育种统计方法:基因组遗传力

此幻灯片是来自“Omics辅助育种统计方法”短期课程中的一节: Genomic heritability。作者Malachy Campbell,博后毕业于康奈尔大学,是一名计算生物学家,专注于统计基因组学和数量遗传学。热衷于从大规模、复杂且常常带有噪音的多维数据中提取生物学意义。研究目标是利用高维度 ......
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GS | Ben Hayes报告:基因型数据基础

本报告是Ben Hayes和Hans Daetwyler合著。 关于Ben Hayes,前文已经介绍。详见:https://qaafi.uq.edu.au/profile/1059/ben-hayes Ben Hayes是澳大利亚昆士兰大学教授,昆士兰州农业和食品创新联盟动物科学中心主任,也是千牛基 ......
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GS | Ben Hayes的基因组选择课程

关于Ben Hayes详见:https://qaafi.uq.edu.au/profile/1059/ben-hayes Ben Hayes是澳大利亚昆士兰大学教授,昆士兰州农业和食品创新联盟动物科学中心主任,也是千牛基因组计划的发起者。在牲畜、作物、牧场和水产养殖物种的遗传改良方面拥有丰富的研究经 ......
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GS | Julius报告:基因组预测的准确性

Julius Van der Werf是新英格兰大学(University of New England,UNE)教授,专门从事遗传评估、育种计划设计、育种目标和基因组选择方面的研究。他指导了60多名博士生。2003 年至 2019 年,他担任绵羊 CRC 遗传学项目的经理,在此期间,澳大利亚绵羊产 ......
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GS | Julius报告:利用基因组信息预测遗传变化

Julius Van der Werf是新英格兰大学(University of New England,UNE)教授,专门从事遗传评估、育种计划设计、育种目标和基因组选择方面的研究。他指导了60多名博士生。2003 年至 2019 年,他担任绵羊 CRC 遗传学项目的经理,在此期间,澳大利亚绵羊产 ......
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20-有参转录组实战6-差异基因绘制火山图

#本教程仿自于B站的15天入门生物信息视频,若有疑惑请以视频为准。若侵请联。 #上一个教程我们得到了genes.counts.matrix.OE_vs_WT.DESeq2.DE_results文件,接下来对差异基因绘制火山图,我们这一步在Windows系统上的R进行即可,若需要安装Windows的R ......
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re | 植物大战僵尸年度版gdi僵尸位置画框

re | 植物大战僵尸年度版gdi僵尸位置画框 最近写的东西,随便练练手,绘制的部分上一个博客中有精简版本。 程序使用的是僵尸结构体线性数组,取僵尸的部分写的非常优雅,感兴趣的可以去逆一下看看。 效果: 代码如下: #include <Windows.h> WCHAR szTitle[] = L"m ......
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易基因|全基因组DNA甲基化测序(WGBS)揭示衰老对肝再生的表观基因组调控机制

大家好,这里是专注表观组学十余年,领跑多组学科研服务的易基因。 众所周知,衰老会对肝脏再生产生影响。随着时间的推移,肝脏再生能力显著下降。肝脏体积、血流量和代谢等肝脏生理参数,以及损伤后的再生能力在人类和模型系统中均在老年时表现出下降,其中涉及许多分子机制,包括DNA甲基化依赖性基因组重塑。那么DN ......
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易基因:DNA甲基化和转录组分析揭示番茄黄化曲叶病毒感染过程中的转录和表观遗传学变化

大家好,这里是专注表观组学十余年,领跑多组学科研服务的易基因。 双生病毒(Geminiviruses)是一种DNA植物病毒,可引起影响全球作物的高度破坏性疾病。在感染过程中,双生病毒调控细胞过程,抑制植物防御,并导致感染细胞的大量重编程,导致整个植物稳态重大变化。测序技术进步允许大规模同时分析病毒感 ......
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《计算生物学导论 : 图谱、序列和基因组》是2009年8月科学出版社出版的图书,作者是(美)Michael S. Waterman。 [1]

本书介绍分子生物学的基本常识、限制图谱和多重图谱,研究克隆和克隆图谱,讨论DNA序列相关的话题,涉及序列中模式计数的统计问题等。 [1] 图书目录 编辑 播报 《生物数学丛书》序 前言 数学符号 第0章 引言 第1章 分子生物学一些知识 第2章 限制图谱 第3章 多重图谱 第4章 求解DDP的算法 ......
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易基因2023年度DNA甲基化研究项目文章精选

大家好,这里是专注表观组学十余年,领跑多组学科研服务的易基因。 2023年,易基因参与的DNA甲基化研究成果层出不穷,小编选取其中5篇不同方向的论文与您一起来回顾。 01、易基因微量DNA甲基化测序助力中国科学家成功构建胚胎干细胞嵌合体猴,登上《细胞》封面 (cell / IF 64.5) 02、o ......

植物大战僵尸3.0

#include <iostream> #include <windows.h> using namespace std; //声明变量 DWORD ZombiesAddress; HWND hand = NULL; DWORD pid = 0; HANDLE hProcess = NULL; DW ......
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植物大战僵尸2.0

#include <iostream> #include <windows.h> using namespace std; HWND hand=NULL; DWORD pid=0; HANDLE hProcess=NULL; DWORD BaseValue=0; DWORD SunshineAddr ......
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植物大战僵尸

#include <iostream>#include <windows.h>using namespace std;/*声明变量*/HWND hand=NULL;//游戏窗口 DWORD pid=0;// 游戏进程ID HANDLE hProcess=NULL;//进程对象 DWORD BaseV ......
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【python爬虫课程设计】大数据分析——土壤、菌类、环境对乔木植物的生存影响数据的预测模型

选题方向:2.大数据分析 一、选题背景介绍 新华社北京7月18日电 全国生态环境保护大会17日至18日在北京召开。今后5年是美丽中国建设的重要时期,要深入贯彻新时代中国特色社会主义生态文明思想,坚持以人民为中心,牢固树立和践行绿水青山就是金山银山的理念,把建设美丽中国摆在强国建设、民族复兴的突出位置 ......
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易基因: RNA m7G甲基化修饰的生物学功能及其在癌症中的作用|综述

大家好,这里是专注表观组学十余年,领跑多组学科研服务的易基因。 m7G修饰是RNA转录后修饰之一,存在于许多不同类型的RNA中。通过对RNA中m7G修饰的准确鉴定,揭示了m7G在基因表达调控和不同生理功能中的作用。越来越多的证据表明,m7G修饰在癌症发生中至关重要。本文综述了m7G的检测技术、分布、 ......
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高维数据惩罚回归方法:主成分回归PCR、岭回归、lasso、弹性网络elastic net分析基因数据|附代码数据

全文链接:http://tecdat.cn/?p=23378 最近我们被客户要求撰写关于高维数据惩罚回归方法的研究报告,包括一些图形和统计输出。 在本文中,我们将使用基因表达数据。这个数据集包含120个样本的200个基因的基因表达数据。这些数据来源于哺乳动物眼组织样本的微阵列实验 1 介绍 在本文中 ......
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写实风格3D植物模型纹理贴图

GLTF 编辑器 -NSDT 不仅可以设置3D模型纹理贴图,还可以设置模型的几何原点、以及对有相同材质属性的mesh进行合并,实现模型轻量化,是一款不可多得的实用型在线模型编辑工具。 ......
纹理 模型 植物 风格 贴图

低多边形3D卡通植物模型纹理贴图

GLTF 编辑器 -NSDT 不仅可以设置3D模型纹理贴图,还可以设置模型的几何原点、以及对有相同材质属性的mesh进行合并,实现模型轻量化,是一款不可多得的实用型在线模型编辑工具。 ......
多边形 纹理 模型 卡通 植物

植物大战僵尸

#include <iostream>#include <windows.h>using namespace std;HWND hand=NULL;DWORD pid=0;HANDLE hProcess=NULL;DWORD BaseValue=0;DWORD SunshineAddress;boo ......
僵尸 大战 植物

植物大战僵尸外挂2

#include <iostream> #include <windows.h> using namespace std; /*声明变量*/ HWND hand=NULL; DWORD pid=0; HANDLE hProcess=NULL; DWORD BaseValue=0; /*声明方法/函数 ......
僵尸 大战 植物

植物大战僵尸外挂1

#include <iostream> #include <windows.h> using namespace std; /*声明变量*/ HWND hand=NULL;//游戏窗口 DWORD pid=0;//游戏进程ID HANDLE hProcess=NULL;//进程对象 DWORD Ba ......
僵尸 大战 植物

植物大战僵尸0.1

#include <iostream> #include <windows.h> using namespace std; HWND hand=NULL; DWORD pid=0; HANDLE hProcess=NULL; DWORD BaseValue=0; bool startGame(); ......
僵尸 大战 植物 0.1

植物大战僵尸

#include <iostream> #include <windows.h> using namespace std; //声明变量 HWND hand = NULL;//游戏窗口 DWORD pid = 0;//游戏进程ID HANDLE hProcess = NULL;//进程对象 DWOR ......
僵尸 大战 植物

植物大战僵尸(初始化游戏数据 )

#include <iostream> #include <windows.h> using namespace std; /*声明变量 */ HWND hand=NULL; //游戏窗口 DWORD pid=0;//游戏进程ID HANDLE hProcess=NULL;//进程对象 DWORD ......
僵尸 大战 植物 数据
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