基因 频率hiblup
基于时间频率一致性对时间序列进行自监督对比预训练《Self-Supervised Contrastive Pre-Training for Time Series via Time-Frequency Consistency》(时序、时频一致性、对比学习)
2023年11月10日，今天看一篇论文，现在17:34，说实话，想摆烂休息，不想看，可还是要看，拴Q。 论文：Self-Supervised Contrastive Pre-Training for Time Series via Time-Frequency Consistency 或者是：Sel ......
易基因：MeRIP-seq+ChIP-seq等揭示m6A甲基化在休眠期转录休眠调控中的潜在功能
大家好，这里是专注表观组学十余年，领跑多组学科研服务的易基因。 发育通常被认为是遗传程序的顺序展开，复杂程度不断提高，并按固定轨迹随时间进行。然而，调整发育时间可以提高在不利条件下的存活率。在哺乳动物中，这表现为胚胎停育。在小鼠胚泡和胚胎干细胞中，通过抑制mTOR表达以及对Myc转录因子的抑制可诱导 ......
【树】哈夫曼树-频率大的短编码
解决问题： 对一篇电报编码：Hello world 这里面除去符号，最多的字母是o，若要转换为01二进制尽量编码短；最少的字母h，编码长。 h 1; e 1; r 1; d 1; w 1; o 2; l 3; -开始手动编码 --每次选取频次最小 左小右大 做孩子，加入一个父节点（值为孩子频次和） ......
Excel区间频率统计
有时候会使用Excel统计一下分段区间数据的频率，也就是数据在不同的区间的分布情况。下面案例就是使用Excel统计一下数据的区间分布情况。 使用frequency函数可以得到想要的结果。 公式=frequency(数据列，分界区间)，然后CTRL + SHIFT + ENTER 注意点：要全部选中要 ......
T2T组装时代的多基因组比对MGA
多基因组比对 （multiple genome alignment, MGA）首先要定义多序列比对 （multiple sequence alignment, MSA）。MSA 是将同源关系分配给 3 个或更多序列的方法（对于 2 个序列，使用“成对”而非“多个”），其中一组核苷酸是同源的，如果它们 ......
哪个才是首个（中国）大豆的T2T基因组版本？
目录主要结果主要方法数据策略工具问题来了 2023年9月29日，哈尔滨工业大学王亚东团队联合中国农科院韩天富团队在bioRxiv发表了题为“A telomere-to-telomere genome assembly of Zhonghuang 13, a widely-grown soybean ......
植物基因组学和作物改良中的深度学习
目录深度学习：概念、工具和注意事项沿着分子生物学的中心法则进行深度学习DNA和基因特性蛋白质特性模型和数据共享理解基因组变异：从关联到因果关系和分子机制深度学习育种4.0：编辑育种结论 植物基因组学取得了巨大进步，其特点是高通量技术的爆炸式增长，以低成本识别多维全基因组分子表型。更重要的是，基因组学 ......
康奈尔大学生物信息中心主任关于基因组组装报告
Dr. Qi Sun是康奈尔大学高级研究员和生物信息学中心主任，长期以来从事生物信息学工作，在大数据的管理与分析上，特别是Genotype-By-Sequence (GBS)，RNA-seq，ChIP-seq，small RNA，基因调控网络等方面积累了丰富的经验。在Science，Cell，Nat ......
基因注释软件SNAP的安装
001、下载软件包： 官网：http://korflab.ucdavis.edu/software.html 002、下载安装包、及安装 wget -c http://korflab.ucdavis.edu/Software/snap-2013-11-29.tar.gz tar -xzf snap- ......
易基因：家禽中的DNA甲基化研究应用（繁殖性状+肌肉发育+疾病+产蛋量等）
大家好，这里是专注表观组学十余年，领跑多组学科研服务的易基因。 DNA甲基化作为一种重要的表观遗传修饰，参与动物细胞分化、胚胎发育、基因组印记和性染色体失活等生物学过程。随着DNA甲基化测序变得越来越复杂，用它来解决更多的动物学问题成为可能。2023年11月5日，华南农业大学动物遗传育种与繁殖系聂庆 ......
P-III曲线水文频率计算程序（方法）
P-III曲线水文频率计算程序（方法） 最近遇到水文频率曲线拟合计算相关的问题，在网上查阅了一下，毕竟是专业性比较强的知识内容，好像没有比较系统全面的资料，一时兴起，做了一些研究，总结了一下所了解的一些计算方法以及能够帮助我们解决实际问题的辅助计算软件，并作了对比分析，主要情况如下： P-III曲线 ......
基因表达谱数据分析简介
基因表达谱数据分析是一种研究基因表达模式的技术，它可以帮助科学家了解基因在不同情况下的表达情况。什么是基因表达谱数据分析？基因表达谱数据分析是一种研究基因表达模式的技术，它可以帮助科学家了解基因在不同情况下的表达情况。它可以帮助科学家了解基因在不同情况下的表达情况，从而更好地理解基因如何影响生物体的 ......
宏基因组：KenKra2 注释”真菌“（自整理，详细，全网唯一 ）
(Newbase) [wz@localhost ~]$ kraken2-build -h Usage: kraken2-build [task option] [options] Task options (exactly one must be selected): --download-taxo ......
植物基因组学和作物改良中的深度学习
目录深度学习：概念、工具和注意事项沿着分子生物学的中心法则进行深度学习DNA和基因特性蛋白质特性模型和数据共享理解基因组变异：从关联到因果关系和分子机制深度学习育种4.0：编辑育种结论 植物基因组学取得了巨大进步，其特点是高通量技术的爆炸式增长，以低成本识别多维全基因组分子表型。更重要的是，基因组学 ......
植物图形泛基因组Graph-based pan-genome
目录图形泛基因组的构建图泛构建方法获取和合并PAV变异图泛的存储格式线性参考基因组坐标的恢复图泛的可视化图泛的注释基因结构注释图泛的变异注释结构变异鉴定与基因分型图泛比对软件的优势图泛的应用功能元件的鉴定现有物种中的图泛规模基于图泛的GWAS未来应用结论与未来展望 图形泛基因组（图泛）以节点和路径的 ......
公司在职第四党支部开展 “传承红色基因，发扬两弹精神”主题党日活动，金刚石刀具
成都工具研究所有限公司的前身是成都工具研究所，于1956年创建于北京，是原机械工业部的直属研究所，是我国机械工业的综合性工具科研机构。公司官网：http://www.ctri.com.cn/公司主要从事精密切削工具、精密测量仪器以及表面改性处理技术的技术研究、产品开发和应用服务。 2020年9月5日 ......
易基因：RRBS等揭示DNA甲基化-肿瘤免疫逃逸-肾上腺皮质癌侵袭的相关性｜表观研究
大家好，这里是专注表观组学十余年，领跑多组学科研服务的易基因。 肾上腺皮质癌（Adrenocortical carcinoma，ACC）是一种罕见的侵袭性肾上腺内分泌癌。在肾上腺皮质癌中，最近研究表明以CpG岛甲基化表型(CpG island methylator phenotype，CIMP)为特 ......
宏基因组测序流程及其分析步骤
测序样本信息：完成了70个根际土壤样本的宏基因组测序。 数据预处理： 使用KneadData工具进行质控和去宿主处理。 利用Trimmomatic去除接头序列并进行质量过滤。 使用Bowtie2构建宿主库和进行去宿主处理。 从头组装：采用MEGAHIT工具对原始测序数据进行从头组装，生成contig ......
dspLearning_频率响应的意义以及简单滤波器的设计
频率响应的意义 \[x(n) = sin(0.01\pi n) \\ H(z)=\frac{0.05+0.05z^{-1}}{1-0.9z^{-1}} \]n = 0.:199;%取两百个点 x = sin(0.01*pi*n); %2pi/T = omega = 0.01pi,故T=200（所以一 ......
基因组选择GS应用的四个场景
目录GS应用的四个场景情景1情景2情景3情景4 本文整理自Giovanny E Covarrubias Pazaran博士的报告《Genomic Selection in R》，他是国际水稻研究所植物育种和遗传学博士，具有强大的统计学背景以及具有从事育种计划和实践研究的丰富经验，是R和SAS等不同软 ......
根据Accession id下载NCBI基因组
usage： 脚本就不注释了，会perl的都看得懂；测试了下，速度感人OTZ，淦！ #!/usr/bin/env perl use strict; use warnings; use Cwd qw/getcwd/; use Getopt::Long; use Net::FTP; use featur ......
易基因：ChIP-seq等揭示BRWD3调控KDM5活性以维持H3K4甲基化水平的表观机制｜PNAS
大家好，这里是专注表观组学十余年，领跑多组学科研服务的易基因。 组蛋白修饰对调控染色质结构和基因表达至关重要，组蛋白修饰失调可能导致疾病状态和癌症。染色质结合蛋白BRWD3（Bromodomain and WD repeat-containing protein 3）是Cul4-DDB1 E3泛素连 ......
查看调整cpu频率及模式
使用cpufrequtils查看调整cpu频率及模式 cpufrequtils是一个查看和修改CPU频率GHz的工具 有些物理服务器使用默认频率进行运行，这时可以使用该工具进行就该CPU的核心频率 安装: apt install cpufrequtils yum install cpufrequti ......
Node.js 版本发布的频率和间隔
Node.js 是一个流行的服务器端 JavaScript 运行时环境，由 Ryan Dahl 在2009年创建。它的版本发布频率和间隔一直是开发者们关注的话题之一。Node.js 的版本发布策略经历了多次变化，下面我将详细介绍 Node.js 的版本发布历史，包括不同阶段的发布频率和间隔。 Nod ......
直播源码开发，实现 scroll-view 自动滚动到底部，并控制触发频率
直播源码开发，实现 scroll-view 自动滚动到底部，并控制触发频率 HTML scroll-view 固定高度，允许纵向滚动，scrollTop 值通过变量动态改变。将 scroll-view 内容区域通过 view 标签进行包裹。 <scroll-view class="dialogue- ......
基于OFDM+64QAM系统的载波同步matlab仿真,输出误码率,星座图,鉴相器,锁相环频率响应以及NCO等
1.算法运行效果图预览 2.算法运行软件版本 MATLAB2022a 3.算法理论概述 正交频分复用（OFDM）是一种在现代通信系统中广泛使用的调制技术，它具有高效的频谱利用和抗多径衰落等特点。64QAM（64-ary Quadrature Amplitude Modulation）是一种调制方式， ......
易基因： WGBS等从DNA甲基化揭示杀鲑气单胞菌灭活疫苗对大菱鲆的免疫力：抗性育种
大家好，这里是专注表观组学十余年，领跑多组学科研服务的易基因。 DNA甲基化是表观遗传学中最重要的修饰之一，在免疫应答中发挥着重要作用。自引进大菱鲆（Scophthalmus maximus，商品名：多宝鱼）以来，养殖规模不断扩大，其间各种细菌、病毒和寄生虫引起的疾病日益严重。因此，灭活疫苗以其独特 ......
易基因：番茄细菌性青枯病的噬菌体联合治疗｜国人佳作
大家好，这里是专注表观组学十余年，领跑多组学科研服务的易基因。 生物防治是利用细菌接种剂来改变植物根际微生物群落的组成，但在以往研究中存在有接种的细菌在根际建立不良，与本地微生物组争夺资源，干扰本地微生物的问题。而与细菌接种剂相比，噬菌体的主要好处是它们的宿主特异性，和只要有宿主细菌存在，即便是在其 ......
17-基于NE555的信号发生与频率测量
555定时器的基本应用 1. 555定时器的简介 555定时器是美国Signetics公司1972年研制的用于取代机械式定时器的中规模集成电路，因输入端设计有三个5kΩ的电阻而得名 555定时器由于其易用性、低廉的价格和良好的可靠性，在波形的产生与变换、测量与控制、家用电器、电子玩具等领域都得到了应 ......