甲基 基因 口腔 差异
8. 参考基因组
1. 背景引入 本小节开始讲述转录组测序的准备工作.因为做的是有参的基因组分析,所以首先是准备参考基因组、测序数据.当数据准备完成后,接下来是比对参考基因组,表达定量,合并成表达矩阵,差异表达分析. 上面是转录组分析的大致步骤,这节我们介绍的是参考基因组. 2. 准备参考基因组 2.1 下载参考基因 ......
生信教程：使用全基因组SNP数据进行ABBA-BABA分析
动动发财的小手，点个赞吧！ 简介 ABBA BABA 统计（也称为“D 统计”）为偏离严格的分叉进化历史提供了简单而有力的测试。因此，它们经常用于使用基因组规模的 SNP 数据（例如来自全基因组测序或 RADseq）来测试基因渗入。 在本次实践中，我们将结合使用可用软件和一些用 R 从头编写的代码来 ......
利用Python 去重聚合Excel数据并对比两份数据的差异
需求描述: 现在有两份Excel数据 数据结构一致 需要根据订单号和店铺名称去重聚合之后，再把两份数据合并对比差异，需要对比出两份数据的差异 import pandas as pd import numpy as np # 读取两个 Excel 文件 left_df = pd.read_excel( ......
易基因：ChIP-seq揭示组蛋白修饰H3K27me3调控高温下棉花的雄性不育机制｜Plant Com
大家好，这里是专注表观组学十余年，领跑多组学科研服务的易基因。 气候变化导致极端天气事件更加频繁地发生，包括反常的高温（high temperature，HT），HT胁迫对作物的生长发育和产量有严重的负面影响，如平均生长温度每升高1°C，水稻产量就会下降10%，这一下降主要是由于对生殖发育的影响。棉 ......
6. 简单基因家族分析
2023.09.24 1. 任务背景 芝麻是一种油料作物.产油比其他作物高很多,这里以基因的背景来研究芝麻产油的原因.这里我们专门研究FAD4基因,它在油脂合成中也起到重要作用.我们对比不同作物的FAD4基因的拷贝数,研究它对产油的影响. 下图是我们要得出的结论,我们发现FAD4在拟南芥中有3个拷贝 ......
焊盘与过孔差异
1.焊盘有表贴焊盘和插入焊盘，表贴焊盘只在表层。 插入焊盘贯穿。插入焊盘默认内部铜贯穿，可以选非金属化孔，需要设置plated不要勾选。 2.过孔用于连接不同层的导线的打孔。一般覆盖绿油。 ......
2023版：深度比较几种.NET Excel导出库的性能差异
引言 背景和目的 本文介绍了几个常用的电子表格处理库，包括EPPlus、NPOI、Aspose.Cells和DocumentFormat.OpenXml，我们将对这些库进行性能测评，以便为开发人员提供实际的性能指标和数据。 下表将功能/特点、开源/许可证这两列分开，以满足需求： 功能 / 特点 EP ......
20版本Camplus控制器与其它版本的差异
目录主界面隧道模式链路模板零配置开局LAN-WAN互联创建VN布局接口路由站点上网 主界面 如下所示：主界面整体为深蓝偏紫的颜色 隧道模式 如下所示，打开“EVPN”之后，在主界面上就会显示出“多分支互联”，SD-WAN的相关配置在按钮下进行配置。 链路模板 链路模板会提供两种接口服务，如下所示： ......
易基因｜ONT：三代原核甲基化在痤疮杆菌噬菌体表观遗传印迹中的工程选择性研究
大家好，这里是专注表观组学十余年，领跑多组学科研服务的易基因。 痤疮表皮杆菌（Cutibacterium acnes，C.acnes）是一种革兰氏阳性细菌，是人类皮肤微生物组成员。尽管是最丰富的皮肤共生体，但某些成员与常见的炎症性疾病（如痤疮）有关。各种C.acnes分支的完整基因组序列可以鉴定推定 ......
Oracle的差异增量备份和累积增量备份
在rman增量备份中，有差异增量和累积增量的概念 1、概念 差异增量：是备份上级及同级备份以来所有变化的数据块，差异增量是默认增量备份方式 累积增量：是备份上级备份以来所有变化的块 因为累积增量是备份上级备份以来所有变化的数据块，所以累积增量需要更多的备份时间，同时需要较小的恢复时间；而差异增量正好 ......
易基因直播预告｜细菌微生物基因表达调控表观研究
大家好，这里是专注表观组学十余年，领跑多组学科研服务的易基因。 DNA甲基化是在半个多世纪前在细菌中发现的。DNA碱基可以作为一个表观遗传调节因子——也就是说，它可以赋予相同的基因序列不同的和可逆的调控状态。在真核生物中，表观遗传调控可以发生在多个水平上：DNA甲基化、核小体定位、组蛋白变异和组蛋白 ......
Nodejs 命令行调用 exec 与 spawn 差异
Nodejs 命令行调用 exec 与 spawn 差异 比如在前端工程项目中 Nodejs 要调用命令行命令如： yarn electron:build exec 调用 yarn 命令，为了能使命令行能实时打印输出正在编译的命令 以异步形式调用 exec 使用 stdout.on 方式监听标准输出 ......
深度比较常见库中序列化和反序列化性能的性能差异
背景和目的 本文介绍了几个常用的序列化和反序列化库，包括System.Text.Json、Newtonsoft.Json、 Protobuf-Net、MessagePack-Net，我们将对这些库进行性能测评 库名称 介绍 Github地址 System.Text.Json .NET Core 3. ......
2-微信小程序和web前端的差异及模板与配置
上文学会了如何安装微信小程序的安装与注册，及微信小程序的使用，其实微信小程序和web前端也有异曲同工之妙 微信小程序和Web前端存在一些显著的区别和差异，这些差异主要体现在功能、性能、用户体验、开发成本和维护成本等方面。 一、相似点 语言基础：微信小程序和Web开发都使用JavaScript语言进行 ......
基因、基因家族和通路之间的关系
基因、基因家族和通路之间的关系如下： 基因（Gene）： 基因是DNA上的一段编码信息，它指导生物体合成特定的蛋白质或RNA分子。基因是生物体遗传信息的基本单位，每个基因编码了一个或多个蛋白质或RNA的特定序列。基因具有多样性，因为同一基因可以在不同个体中存在不同的等位基因，导致生物体的遗传多样性。 ......
基因挖掘之BSA (Bulk segregation analysis)
目录BSA的发展BSA分析框架BSA流程及影响因素BSA的群体BSA的算法BSA的软件BSA遗传群体、算法和软件的对应关系 BSA作为基因组学中基因挖掘的三板斧之一，最大优点是高效、经济、简便。通过选择双亲群体分离后代中具有极端表型的个体进行混样，然后比较不同极端混样池之间的多态性并结合表型进行目标 ......
linux 中 readlink、realpath、find输出软链接文件绝对路径的差异
001、 [root@pc1 test1]# ls ## 三个测试文件 a.txt b.txt testfile [root@pc1 test1]# ll -h total 4.0K lrwxrwxrwx. 1 root root 20 Sep 16 12:03 a.txt -> /home/tes ......
易基因： MeRIP-seq等揭示组蛋白乙酰化和m6A修饰在眼部黑色素瘤发生中的互作调控｜肿瘤研究
大家好，这里是专注表观组学十余年，领跑多组学科研服务的易基因。 组蛋白去乙酰化抑制剂(HDACis)在多种恶性肿瘤中显示出令人鼓舞的结果。N6-甲基腺嘌呤(m6A)是最普遍的mRNA修饰，在肿瘤发生调控中起重要作用。然而，对组蛋白乙酰化和m6A RNA修饰之间的互作研究仍然未知。 2023年7月19 ......
如何在短时间内完成MongoDB差异数据对比
NineData提供高效、安全、准确的MongoDB数据对比解决方案。它支持多种使用场景下的对比功能，包括一次性对比、周期性对比、全量数据对比和快速对比。NineData还提供简单易用的SaaS平台和可视化界面，以直观的图表和报告呈现对比结果。此外，NineData具备强劲的性能和稳定性，通过智能数... ......
使用R语言查询某物种所有通路及通路内的基因
使用R语言查询某物种所有通路及通路内的基因，这里使用Y书的clusterProfiler包。 这里以人类为例查询所有通路及通路内的基因： library(R.utils) R.utils::setOption("clusterProfiler.download.method","auto") hsa ......
使用R语言查询某物种所有通路及通路内的基因
使用R语言查询某物种所有通路及通路内的基因，这里使用Y书的clusterProfiler包。 这里以人类为例查询所有通路及通路内的基因： library(R.utils) R.utils::setOption("clusterProfiler.download.method","auto") hsa ......
易基因： WGBS等揭示DNA甲基化调控林地草莓植株高度和果实大小的分子机制｜植物发育
大家好，这里是专注表观组学十余年，领跑多组学科研服务的易基因。 DNA甲基化影响基因组稳定性、转座子沉默和基因表达；它主要发生在对称CG和CHG以及不对称CHH (H = A, C或T)中的胞嘧啶上。RNA介导的DNA甲基化(RNA-directed DNA methylation，RdDM)通路调 ......
Windows bat脚本的for语句差异
在cmd窗口中，for之后的形式变量I必须使用单百分号引用，即%I；而在批处理文件中，引用形式变量I必须使用双百分号，即%%I。在cmd窗口中：for %I in (command1) do command2 在批处理文件中：for %%I in (command1) do command2 ......
泛基因组助力作物育种改良
目录结构变异SV基于单个参考基因组鉴定SV通过构建泛基因组来鉴定SV转座元件与作物改良的相关性利用pan-genome进行QTL定位和GWAS利用pan-genome进行基因组预测泛基因组应用育种的挑战与机遇多倍体基因组的复杂性研究不足的作物基因组资源快速驯化新物种 结构变异SV 基于单个参考基因组 ......
蓝屏与绿屏差异解释
如果您对电影制作感兴趣，那么您无疑听说过“绿屏”一词，但您听说过“蓝屏”吗？蓝屏与绿屏有许多差异，我们将在这篇文章中分解所有这些差异。 蓝屏背景的用途可能略低于绿屏，但两者都在行业中广泛使用。如果您不知道蓝屏或绿屏技术的工作原理，蓝屏和绿屏之间的区别是什么，或者为什么要使用蓝屏或绿屏背景，那么您来对 ......
enum和enum class的差异详解
在C++中，有两种方式可以定义枚举类型：enum 和 enum class。它们在以下几个方面有所不同： 作用域限定性： enum：枚举值的名称在相同作用域下是可见的，可能会导致名称冲突。 enum class：枚举值的名称在枚举类的作用域内是局部的，不会与其他作用域中的名称冲突。 2. 隐式转换： ......
wright-fisher模型下遗传漂变基因固定的证明
# background 最近我导兴致大起准备进行组间交流开展群体遗传学的读书交流会，为了贪图内容的简易我先选了遗传漂变的部分 但并不是说要水过，多少要有点b格。 在遗传漂变的部分里有一个重要的模型Wright-Fisher 模型，很多群体遗传学教科书都会提到这个模型，但是关于该模型中的一个细节 假 ......
在方差分析摘要中，”F“、”P值“、”P值摘要“、 ”除手段非常显著性差异 (P < 0.00) 吗？“、”R平方“分别代表什么？有什么意义？
在方差分析摘要中，“F”、“P值”、“P值摘要”、“除手段非常显著性差异 (P < 0.00) 吗？”、"R平方"分别代表以下内容： “F”：F值是用来衡量组间差异与组内差异之比的统计量。F值越大，说明组间差异相对于组内差异越大，也就意味着不同组之间的差异更加显著。 “P值”：P值是用来衡量观察到的 ......