科研进展 二价 表观 基因
易基因：MeRIP-seq等揭示m6A RNA甲基化以ABA依赖性方式调控草莓果实成熟
DNA甲基化等表观遗传标记在调控不同成熟阶段果实成熟中起着关键作用。m6A甲基化已被证明可以调控番茄成熟，但目前尚不清楚 mRNA m6A甲基化是否对不同类型水果的成熟调控具有功能保守性。 2021年6月，中国科学院植物研究所秦国政研究组在《Genome Biology》杂志发表题为“N6-meth ......
第三周进展
本周计划完成任务 最后一周了，计划完成全部任务，比如对协议的分析，对协议类型的展示 本周实际完成任务 实际完成：对握手协议的分析 local function dissectHandshake(buffer, pkt, tree) local handshakeType = buffer(5, 1) ......
第三周进展
本周计划 继续编写和完善脚本。 完成过程 学习笔记 关于lua lua是一种用c语言写的轻量级语言。当我们在wireshark上使用时是不需要安装环境的，因为wireshark继承了lua的解释器，且给用户留了API供数据包处理。这里有几点要说明的： lua语言在wireshark上使用时，你的调试 ......
生信大神李恒综述：T2T时代的基因组组装
目录影响组装的基因组特性长读长和长范围（long-range）测序技术近T2T基因组组装核心组装算法评估序列组装李恒的观点 生信领域大神李恒今年发在预印本上的一篇综述：Genome assembly in the telomere-to-telomere era，小编总结下要点。 影响组装的基因组特 ......
美国乔治亚大学李增禄教授最新报告《基因组预测加速遗传增益》
目录 这是美国乔治亚大学（University of Georgia）李增禄教授在山东农业大学做的一场最新报告。李教授主要从事大豆高产、优质、抗病虫育种，大豆遗传资源鉴定、利用及创新，目标性状基因定位，分子育种方法的开发和利用、基因组选择等研究工作。 关于李教授：https://cropsoil.u ......
又双叒叕一个大豆T2T基因组发表了
目录基本信息背景方法结果碎碎念 前不久才刚总结完大豆T2T基因组：哪个才是首个（中国）大豆的T2T基因组版本？，谁能想到最近又出来一个大豆品种Jack的T2T基因组。 基本信息 标题: A complete reference genome for the soybean cv Jack (大豆品种 ......
Mol Plant | 黄学辉等教授综述植物泛基因组及其应用
目录摘要泛基因组的重要性植物泛基因组的主要结构变异（SV）驱动力植物泛基因组的发展植物泛基因组应用育种 今日分享一篇去年底今年初发表的植物泛基因组综述，作者史俊鹏、田志喜、赖锦盛、黄学辉，全员大佬。 该文详细介绍了植物泛基因组的概念、研究进展和应用。 摘要 植物基因组高度多样化，很大一部分序列在不同 ......
NAR | 华大和上海师范大学开发的基因组选择平台CropGS-Hub
目录主要内容小编碎碎念 几个月前就听说华大万物联合上海师范大学开发了基因组选择的工具CropGS，一直比较好奇。近日文章已经发表见刊，得以一窥究竟。 主要内容 以往的作物GWAS数据库集中在表型和基因型之间的关联，只有少数数据库充分利用表型和基因型资源来构建和托管农艺性状的基因组预测模型。如NHGR ......
【科研工具使用】zotero
使用： Zotero零基础保姆级教程_哔哩哔哩_bilibili 中文文献识别： Zotero教程—中文文献识别 - 知乎 (zhihu.com) Zotero茉莉花插件，一键抓取知网文献 - 知乎 (zhihu.com) Zotero 更新知网Translator翻译器教程(😂本视频和翻译插件没 ......
第三周进展
密码套件（微软资料） 密钥交换 签名 主体加密 消息身份验证 椭圆曲线 由此小结一下 TLS_ECDHE_RSA_WITH_AES_128_GCM_SHA256的含义 1）TLS：Transport Layer Security (TLS)，表明了密钥套件的协议 2）ECHDE：Elliptic C ......
易基因：人早期胚胎发育的表观遗传调控（染色质重塑+组蛋白修饰+DNA甲基化）｜深度综述
大家好，这里是专注表观组学十余年，领跑多组学科研服务的易基因。 哺乳动物发育研究促进了对协调胚胎发生遗传、表观遗传和细胞过程的理解，并揭示了对人类胚胎发生特异性新见解。最近研究生成了人类早期胚胎发生的第一个表观遗传学图谱，激发了关于表观遗传学重编程、细胞命运调控以及支撑人类胚胎发育可塑性的潜在机制新 ......
盘点2023年度安防监控行业发展：安防监控技术取得哪些进展？
智能化的安防监控系统通过利用AI识别技术，可以实现人脸识别、人脸检测、区域入侵、车辆检测及识别、睡岗离岗、烟火检测等。 ......
盘点2023年安防监控行业技术进展与LiteCVR视频云技术应用
通过云计算技术，可以将大量的视频数据存储在云端，方便用户随时随地访问和管理。同时，云计算还可以提供强大的计算和数据处理能力，为智能视频分析等应用提供更强大的支持。（litemedia/cn，成都来特科技，专注音视频算法平台和云平台） ......
得到差异表达基因后怎么做
不管芯片数据还是测序数据，得到的差异表达基因DEGs都是独立的基因，如果直接对这些基因分析叫单基因分析，这种分析会有很多弊端，比如： 因为噪音的存在，结果本身就是不可靠的 因为对DEGs个人取舍条件的不同，也会造成结果不可靠 工作量增大 只关注单个基因而忽视基因之间的相互作用，这就很难揭示具体生物学 ......
易基因：ChIP-seq等揭示SETD2介导H3K36me3调控结直肠癌进展的表观遗传机制｜CTM研究
大家好，这里是专注表观组学十余年，领跑多组学科研服务的易基因。 结直肠癌(Colorectal cancer，CRC)是一种复杂的多阶段疾病，由基因突变和表观遗传改变相互作用引起。组蛋白H3K36三甲基转移酶SET结构域2 (SETD2)是一种表观遗传信号分子，在结直肠癌中突变率为5%。SETD2在 ......
科研小记——画箱型图
数据： a 1000*1 表示1000个脑区各自的值 b 1000*1cell 表示1000个脑区各自属于的脑网络 c 1*7cell Color=[219 2 10;231 95 27;238 146 43;246 191 65;246 236 84;202 222 169;147 205 137 ......
易基因：人精子H3K4me3 ChIP-seq和DNA甲基化WGBS揭示与生育和发育相关重叠区域
大家好，这里是专注表观组学十余年，领跑多组学科研服务的易基因。 目前，六分之一的夫妇患有不孕不育，其中多达一半的病例由男性因素引起，在过去的40年中，精子数量下降了50%。尽管导致精子质量和数量下降的因素知之甚少，但环境-表观基因组相互作用是可能的。暴露于有毒物质、饮食和 BMI 升高与精子表观基因 ......
科研方法论，持续更新
参考资料： 自己总结 1. 重写代码是愚蠢的，别人造过的轮子在理解的前提下拿来用即可。重要的是清楚自己需要改写哪些部分。 2. 一定不要眼光太高，想一次性解决所有问题。要去复现前人的研究成果，找到其中的缺陷。 3. 看待问题不要从神经网络的角度，要从公式的角度，从原理的角度，神经网络只是工具 ... ......
16-有参转录组实战2-将批量转录组比对到基因组上
#1，我们先下载毛果杨的基因组文件和GFF注释文件，自己去NCBI下：（https://www.ncbi.nlm.nih.gov/datasets/genome/GCF_000002775.5/），选Genbank的。 #2，我们将GFF文件和genomic.fna文件上传到服务器，并重命名下，Pt ......
易基因： MeRIP-seq等从m6A RNA甲基化角度揭示NFATc1对破骨细胞的调控机制｜研究速递
双膦酸盐类药物是强效骨吸收抑制剂，是治疗骨质疏松症、多发性骨髓瘤、骨转移等疾病的首选药物。这些药物通过抑制甲羟戊酸通路和促进破骨细胞凋亡来促进骨吸收。双膦酸盐类药物是治疗骨质疏松症和肿瘤相关骨病的标志性药物。然而，在几十年的临床应用中，双膦酸盐类药物已经引起了严重的副作用。 m6A甲基化在骨代谢疾病 ......
易基因： MeRIP-seq等从m6A RNA甲基化角度揭示NFATc1对破骨细胞的调控机制
大家好，这里是专注表观组学十余年，领跑多组学科研服务的易基因。 双膦酸盐类药物是强效骨吸收抑制剂，是治疗骨质疏松症、多发性骨髓瘤、骨转移等疾病的首选药物。这些药物通过抑制甲羟戊酸通路和促进破骨细胞凋亡来促进骨吸收。双膦酸盐类药物是治疗骨质疏松症和肿瘤相关骨病的标志性药物。然而，在几十年的临床应用中， ......
第二周进展
本周计划 完成自己的部分 实际完成情况 还在调试代码，目前代码运行后没有预期效果。 未完成计划的原因：对lua语言的学习不足，对wireshark抓包不够熟悉。 改进：在接下来的一周中，加强对lua的学习以及熟悉wireshark的使用，对待吗进行改善，调试和运行。 代码： do -- 创建一个新的 ......
进展
 local version_num = version_str an ......
第二周进展
Wireshark lua插件开发第二周进展 本周在Wireshark lua插件开发方面取得了以下进展： 1. Lua简介 Lua是一种轻量级的脚本语言，它不需要编译器等额外的工具，可以直接进行解释执行。Lua的基本语法可以参考官网或者菜鸟教程。Wireshark内置对Lua脚本的支持，无需额外的 ......
第二周进展
一、本周计划完成的任务 云班课资源和lua编写插件的学习 二、本周实际完成情况 练习微信读书中的示例， foo协议 代码： -- Define the "foo" protocol foo_proto = Proto("foo", "Foo Protocol") -- Define protocol ......
Wireshark lua插件开发第二周进展
1. Lua简介 Lua是一种轻量级的脚本语言，解释执行，不需要编译器之类的。 Lua的基本语法可以参考 官网 或者 菜鸟教程。 Wireshark内置了对Lua脚本的支持，可以直接编写Lua脚本，无需配置额外的环境，使用起来还是非常方便的。 [Wireshark Developer's Guide ......
第二周进展
本周计划：完成自己的部分 遇到了许多的问题，比如插件载入后每次报错： Lua: Error during loading: C:\Program Files\Wireshark\plugins\RSA.lua:42: bad argument #1 to 'add' (DissectorTable_ ......