DNA
SnapGene - DNA序列生物分析 5.3.1 mac/win版
SnapGene 是一款用于 DNA 序列分析和生物学实验设计的专业软件。它提供了强大的功能和直观的界面，帮助科学家和研究人员在分子生物学领域进行高效的实验规划和分析。下面将为您详细介绍 SnapGene 的特点和功能。 点击获取SnapGene mac/win版 DNA 序列编辑：SnapGene ......
如何为物联网设备注入“华为云+鸿蒙DNA”?
本文分享自华为云社区《如何为物联网设备注入“华为云+鸿蒙DNA”？看华为云IoT怎么答【华为云IoT +鸿蒙】》，作者： 华为IoT云服务。 根据市场咨询机构预测，2025年全球物联网设备将达到252亿个。但各种智能设备大多都有一套自己的系统，而且互相“孤立”，无法交流。鸿蒙的到来，就是要用同一套语 ......
易基因：单细胞DNA甲基化与转录组分析揭示猪生发泡卵母细胞成熟的关键调控机制｜项目文章
大家好，这里是专注表观组学十余年，领跑多组学科研服务的易基因。 在哺乳动物中，窦卵泡内的生发泡(germinal vesicle，GV) 卵母细胞可以保持数月或数年的静止状态。促黄体生成素(luteinizing hormone，LH)激增促进了减数分裂（meiosis）恢复，使卵母细胞获得受精后和 ......
NGS实验室质控-DNA污染控制方法篇(引用)
NGS实验室质控-DNA污染控制方法篇 本篇主要和大家分享有关NGS检测体细胞突变时判断DNA污染的方法。 一、 FDA产品- MSK-IMPACT的DNA污染控制方法 1） 判断样本交叉污染(sample mix-up) 计算参考样本和待查样本间的“不一致比例”，即在参考样本中纯合基因型的位点在待 ......
DNA Assembly and Cloning | Gibson Assembly | Golden Gate Assembly
问题很简单，我有一段目标oligos（常见的就是gRNA，shRNA），如何最高效精准的克隆到我的目标质粒Plasmid里。 之前的CRISRP KO gRNA用的是Golden Gate Assembly NEBridge® Golden Gate Assembly Kit (BsmBI-v2) ......
CpG islands (CGI), CpG Shores, CpG Shelves, Open sea in DNA methylation
 >https://life-epigenetics-methylprep.readthedocs-host ......
易基因： DNA甲基化差异水平分析中的DMC、DMR、DMG鉴定 | 干货分享
大家好，这里是专注表观组学十余年，领跑多组学科研服务的易基因。 DNA甲基化（DNA methylation）为DNA化学修饰的一种形式，能够在不改变DNA序列的前提下，改变遗传表现。所谓DNA甲基化是指在DNA甲基化转移酶的作用下，在基因组CpG二核苷酸的胞嘧啶5号碳位共价键结合一个甲基基团。大量 ......
00 去宿主DNA--bowtie2
1、构建索引 bowtie2-build maizev4.fa maizev4 使用 Bowtie 2 的 bowtie2-build 命令来构建一个maizev4基因组的索引。bowtie2-build 是 Bowtie 2 中用于创建索引的工具，而 Bowtie 2 是一个用于短序列比对的快速、 ......
易基因： RRBS揭示基于DNA甲基化驱动基因的肾透明细胞癌预后模型的鉴定和验证｜项目文章
大家好，这里是专注表观组学十余年，领跑多组学科研服务的易基因。 肾细胞癌（RCC）是最常见的肾癌亚型，每年超400万例新发病例，是泌尿系统恶性肿瘤导致的第二大死因。2%-70%的RCC为透明细胞RCC（Clear cell renal cell carcinoma，ccRCC）。DNA甲基化（DNA ......
易基因｜表观遗传学与脑卒中：DNA甲基化的作用及衰老对血脑屏障修复的影响
大家好，这里是专注表观组学十余年，领跑多组学科研服务的易基因。 脑卒中（俗称中风）是导致死亡和长期残疾的主要原因，尤其是对于老龄人来说。脑卒中的平均生存时间为6-7年，许多患者存在身体残疾和晚期认知功能障碍。脑卒中后的神经功能预后取决于许多因素，包括年龄、梗死面积和部位、遗传因素以及脑修复程度。脑卒 ......
浓盐法提取DNA
原理 核酸和蛋白质在生物体中常以核蛋白(DNP/RNP)的形式存在 DNP 能溶于水及高浓度盐溶液，但在 0.14 M 的盐液中解度很低， RNP 则可溶于低盐溶液，因此可利用不同浓度的 NaCl溶液将其从样品中分别抽提出来DNA 和蛋白质，用将抽提得到的 DNP 用 SDS 处理可将其分离DNA ......
易基因：组学研究揭示不同牛品种的DNA甲基化、染色质和基因表达互作机制｜科研进展
大家好，这里是专注表观组学十余年，领跑多组学科研服务的易基因。 在全球范围内，牛为60多亿人提供了重要的营养来源。传染病是养牛生产的主要限制因素，且许多疾病人畜共患，因此与人类健康直接相关。近年来牛的许多复杂性状遗传基础得到了广泛研究，但不同动物的大量重要表型变化仍无法解释，人们越来越关注非遗传变异 ......
DNA组成
DNA（脱氧核糖核酸）是一种生物分子，它存储了生物体的遗传信息。 DNA分子由核苷酸组成，每个核苷酸由三个部分组成：一个磷酸基团、一个五碳糖（脱氧核糖）、以及一个氮碱基。 DNA中存在四种不同的氮碱基：腺嘌呤（adenine，简称A）、鸟嘌呤（guanine，简称G）、胸腺嘧啶（thymine，简称 ......
如何提取DNA【原理】
DNA提取是一种将DNA从生物样本中分离和纯化的过程。下面是一般的DNA提取步骤： 选择样本：选择包含DNA的样本，可以是细胞、组织、血液、唾液、植物材料等。 细胞破碎：使用物理或化学方法将细胞破碎，以释放DNA。常见的方法包括机械破碎、冻融、酶解或化学溶解。 溶解蛋白质：加入蛋白酶等酶类，将细胞中 ......
易基因：全基因组DNA甲基化和小RNA分析揭示甘蓝型油菜种子的基因组不对称性
大家好，这里是专注表观组学十余年，领跑多组学科研服务的易基因。 多倍体是被子植物基因组进化中的一种持续现象，有助于现存开花植物的多样性。甘蓝型油菜（Brassica napus）是世界上最重要的被子植物油料作物品种之一，起源于Brassica rapa（An）和Brassica oleracea（C ......
【高中生物必修二】第三章 基因和DNA
# 第一节 DNA是主要的遗传物质 最初20世纪20年代，人们发现蛋白质由氨基酸组成，并猜测氨基酸的多种排列组合蕴含遗传信息。因为当时没有其他大分子有类似的特征，所以大家认为蛋白质是遗传物质。 20世纪30年代，科学家发现DNA由脱氧核苷酸（磷酸，碱基和脱氧核糖）组成。四种碱基（ATGC）构成四种脱 ......
易基因｜一种全新的检测DNA羟甲基化的技术：ACE-Seq
大家好，这里是专注表观组学十余年，领跑做组学科研服务的易基因。今天给大家介绍一种全新的检测DNA羟甲基化的技术：APOBEC-coupled epigenetic sequencing，简称【ACE-seq】。 前言 DNA序列中胞嘧啶（C）5’ 碳位结合一个甲基基团而转变成5mC的现象称为DNA基 ......
非对称纳米通道的整流特性研究及其在DNA检测中的应用
非对称纳米通道的整流特性研究及其在DNA检测中的应用 石晓雨 西北大学 摘要：纳米通道单分子检测技术具有方法简单、无需标签、实时监测的优点,在生物、化学领域受到广泛关注。与生物纳米通道相比,固态纳米通道孔径尺寸和形状可调,在各种条件(p H值、温度、浓度等)下均具有出色的热稳定性和化学稳定性,因此, ......
第三代DNA测序数据压缩方法研究
第三代DNA测序数据压缩方法研究 崔浩翔 深圳大学 摘要：第三代测序技术自问世以来在临床分子诊断中扮演着越来越重要的角色,尤其在基因组测序、甲基化研究、突变鉴定(SNP检测)等方面。测序技术的不断发展使得测序成本逐年下降,测序数据量急剧增加,如何存储和传输庞大的测序数据是当前亟需解决的问题。数据压缩 ......
易基因：全基因组DNA甲基化分析揭示DNMT1在斑马鱼模型听觉系统发育中的作用 | 胚胎发育
大家好，这里是专注表观组学十余年，领跑多组学科研服务的易基因。 听力障碍通常与内耳发育不全或损伤有关，是影响生活质量的严重健康问题。因此研究听觉器官发生过程中的关键基因对于探索听力损伤的潜在策略至关重要。斑马鱼模型在理解内耳发育不良和相关疾病的分子遗传学原理方面得到了越来越多的应用，内耳发育包括遗传 ......
DNA纳米孔测序技术
DNA测序技术迄今为止经历了三代的发展。第三代测序技术是纳米孔测序技术。 （文中内容出处作者：小灏纸 链接：https://zhuanlan.zhihu.com/p/432535702 来源：知乎） 一、Nanopore Sequencing技术重要发展阶段 1993年，科学家第一次实现了利用DNA ......
DNA测序检测软件
1. Nanocall：一款适用于牛津纳米孔测序数据的开源基因序列分析软件，由David M, Dursi L J, Yao D等人于2017年发表在"生物信息学"期刊上。 2. DeepNano：一种基于深度递归神经网络的基因序列分析软件，适用于MinION纳米孔测序数据，由Boža V, Bre ......
基于DNA序列的图像加解密算法仿真
1.算法仿真效果 matlab2022a仿真结果如下： 2.算法涉及理论知识概要 随着互联网和通信行业的快速发展，信息安全也越来越受关注，由此很多数据加密算法被提出，并被大量使用，例如AES算法，DES算法等，由于人在生活中所获得的信息大部分来自于视觉，图像就成为了人类生活活动中最常见的信息载体.高 ......
机器学习预测给定生物DNA序列是编码序列还是非编码序列
在生物学中，DNA序列通常指非编码序列，因为DNA是生物体内存储基因信息的一种生物大分子，具有一定的生物学特性和结构。然而，基于DNA序列的机器学习预测可以包括编码和非编码序列的任务。以下是一些基于DNA序列的机器学习应用： 应用于非编码DNA序列的机器学习模型： 基因预测：使用机器学习算法预测非编 ......
通过fastaread读取DNA序列并进行检测matlab仿真
1.算法描述 fastaread fastaread函数是matlab生物信息学工具箱内置的一个函数，给我们的使用上带来了巨大的方便。对于基因DNA序列，转录RNA序列和表达蛋白序列的读取非常方便。 使用语法为： p53nt = fastaread('p53nt.txt') % p53nt.txt ......
DNA序列数据处理
dna序列数据处理通常包括以下步骤： 数据预处理：首先，需要对原始dna序列数据进行预处理。其中包括测序错误的纠正、碱基质量过滤和去除低质量序列等。这个阶段是非常重要的，因为数据预处理的质量直接影响后续的特征提取和模型学习。 特征提取：在dna序列分析中，会涉及到许多不同的特征提取方法。例如，可以从 ......
如何将DNA序列输入到神经网络中
dna序列是由四个不同的核苷酸（腺嘌呤，胞嘧啶，鸟嘌呤和鳙嘌呤）组成的字符串，在神经网络中输入dna序列通常需要进行编码转换。以下是一些将dna序列输入到神经网络的方法： one-hot编码: one-hot编码是将dna序列中每个核苷酸表示成一个固定长度为4的二进制序列。例如： a: [1, 0, ......
易基因：全基因组CpG密度和DNA甲基化分析方法比较（MeDIP、RRBS和WGBS）| 研究综述
大家好，这里是专注表观组学十余年，领跑多组学科研服务的易基因。 CpG密度（CpG density）与各种组织中的DNA甲基化相关。基因组按CpG密度分为：CpG岛（CpG island，CGI）、CpG岛上下游2kb以内的区域（CpG shore ，CpG岛岸）、CpG岛岸上下游2kb以内的区域（ ......
UVA1392 DNA Regions
https://www.luogu.com.cn/problem/UVA1392 给定两个长度为 n 的字符串 A 和 B，满足 A 和 B 都只由大写字母 A、C、G、T 组成。 求一个长度最长的闭区间 [L,R]，满足对于 i∈[L,R] , 有不超过 p% 的 i 满足 Ai≠Bi ......