坐标 碱基 基因组 基因
易基因直播预告|细菌微生物基因表达调控表观研究
大家好,这里是专注表观组学十余年,领跑多组学科研服务的易基因。 DNA甲基化是在半个多世纪前在细菌中发现的。DNA碱基可以作为一个表观遗传调节因子——也就是说,它可以赋予相同的基因序列不同的和可逆的调控状态。在真核生物中,表观遗传调控可以发生在多个水平上:DNA甲基化、核小体定位、组蛋白变异和组蛋白 ......
坐标休斯顿,TDengine 受邀参与第九届石油天然气数字化大会
美国中部时间 9 月 14 日至 15 日,第九届石油天然气数字化大会在美国德克萨斯州-休斯顿-希尔顿美洲酒店举办。本次大会汇聚了数百名全球石油天然气技术高管及众多极具创新性的数据技术方案商,组织了上百场硬核演讲,技术专家与行业从业者共聚一堂,共同探讨石油天然气领域的创新技术和解决方案,全面了解整个 ......
如何计算n-frame(导航坐标系)下的定位误差?
这里介绍2种计算n-frame(导航坐标系)下的定位误差方法,两种方法计算结果一致,可根据自己定位结果是XYZ,还是BLH进行选择。 假设定位结果为:ECEF下的XYZ。 方法1: 先让自己的定位结果与参考定位结果做差,得到ECEF下的误差矢量dXYZ,然后根据此历元的位置计算出e-frame to ......
基因、基因家族和通路之间的关系
基因、基因家族和通路之间的关系如下: 基因(Gene): 基因是DNA上的一段编码信息,它指导生物体合成特定的蛋白质或RNA分子。基因是生物体遗传信息的基本单位,每个基因编码了一个或多个蛋白质或RNA的特定序列。基因具有多样性,因为同一基因可以在不同个体中存在不同的等位基因,导致生物体的遗传多样性。 ......
基因挖掘之BSA (Bulk segregation analysis)
目录BSA的发展BSA分析框架BSA流程及影响因素BSA的群体BSA的算法BSA的软件BSA遗传群体、算法和软件的对应关系 BSA作为基因组学中基因挖掘的三板斧之一,最大优点是高效、经济、简便。通过选择双亲群体分离后代中具有极端表型的个体进行混样,然后比较不同极端混样池之间的多态性并结合表型进行目标 ......
易基因: MeRIP-seq等揭示组蛋白乙酰化和m6A修饰在眼部黑色素瘤发生中的互作调控|肿瘤研究
大家好,这里是专注表观组学十余年,领跑多组学科研服务的易基因。 组蛋白去乙酰化抑制剂(HDACis)在多种恶性肿瘤中显示出令人鼓舞的结果。N6-甲基腺嘌呤(m6A)是最普遍的mRNA修饰,在肿瘤发生调控中起重要作用。然而,对组蛋白乙酰化和m6A RNA修饰之间的互作研究仍然未知。 2023年7月19 ......
Maya 无法选中坐标轴 的 解决办法
事件起因: 有项目组某同事在使用maya时,无法选中坐标轴,导致在拖动东西的时候总是无法对准坐标轴线。 解决办法: maya软件中设置: Windows -> Settings/Preferences -> Display -> Viewport2.0 Rendering engine选项 默认应该 ......
使用R语言查询某物种所有通路及通路内的基因
使用R语言查询某物种所有通路及通路内的基因,这里使用Y书的clusterProfiler包。 这里以人类为例查询所有通路及通路内的基因: library(R.utils) R.utils::setOption("clusterProfiler.download.method","auto") hsa ......
使用R语言查询某物种所有通路及通路内的基因
使用R语言查询某物种所有通路及通路内的基因,这里使用Y书的clusterProfiler包。 这里以人类为例查询所有通路及通路内的基因: library(R.utils) R.utils::setOption("clusterProfiler.download.method","auto") hsa ......
地图坐标系转换
/** * 各地图API坐标系统比较与转换; * * WGS84坐标系:即地球坐标系,国际上通用的坐标系。设备一般包含GPS芯片或者北斗芯片获取的经纬度为WGS84地理坐标系, * 谷歌地图采用的是WGS84地理坐标系(中国范围除外); * * GCJ02坐标系:即火星坐标系,是由中国国家测绘局制订 ......
易基因: WGBS等揭示DNA甲基化调控林地草莓植株高度和果实大小的分子机制|植物发育
大家好,这里是专注表观组学十余年,领跑多组学科研服务的易基因。 DNA甲基化影响基因组稳定性、转座子沉默和基因表达;它主要发生在对称CG和CHG以及不对称CHH (H = A, C或T)中的胞嘧啶上。RNA介导的DNA甲基化(RNA-directed DNA methylation,RdDM)通路调 ......
WebGL坐标系介绍
一、认识坐标系 1.面对屏幕向上为y轴的正方向,向左为正x轴的正方向,垂直于屏幕向外的为z轴的正方向。如下图所示: 2.在webgl和threejs中使用的是右手坐标系,入下图所示: 二、围绕某个轴旋转 左手大拇指,指向该轴的正方向,四指弯曲指向的方向,为该旋转方向的正方向。 三、世界坐标系与本地坐 ......
泛基因组助力作物育种改良
目录结构变异SV基于单个参考基因组鉴定SV通过构建泛基因组来鉴定SV转座元件与作物改良的相关性利用pan-genome进行QTL定位和GWAS利用pan-genome进行基因组预测泛基因组应用育种的挑战与机遇多倍体基因组的复杂性研究不足的作物基因组资源快速驯化新物种 结构变异SV 基于单个参考基因组 ......
pyqt折线图设置坐标轴刻度
在PyQt中,可以使用matplotlib库来绘制折线图并设置y轴的最大最小值。 import sys from PyQt5.QtWidgets import QApplication, QMainWindow, QVBoxLayout, QWidget from matplotlib.figure ......
【Python】坐标系转换wgs84 -> bd09
#### 坐标系转换 ```python """ 坐标转换工具类 xll >2021-05-19 developer """ import math import pandas as pd import numpy as np from pyproj import Proj, transform, ......
【Python&GIS】矢量数据投影转换(坐标转换)
之前跟大家分享过面矢量数据投影转换和点矢量数据投影转换,但博主在日常工作的过程中发现之前分享的面矢量数据投影转换有时候会出现错误,或者转换后的效果不好。再一次偶然的过程中发现了新的坐标转换(投影转换)函数,所以今天和大家分享一下,大家在进行坐标转换时可以两种方法都试试,哪个效果好用哪个。 ......
wright-fisher模型下遗传漂变基因固定的证明
# background 最近我导兴致大起准备进行组间交流开展群体遗传学的读书交流会,为了贪图内容的简易我先选了遗传漂变的部分 但并不是说要水过,多少要有点b格。 在遗传漂变的部分里有一个重要的模型Wright-Fisher 模型,很多群体遗传学教科书都会提到这个模型,但是关于该模型中的一个细节 假 ......
QGraphicsView图形视图框架使用(一)坐标变换
文章目录图形视图框架的组成图形视图框架的坐标系Item坐标系Scene坐标系View坐标系图形视图框架的坐标原点使用组合对象图元坐标变换 在设计静态用户交互界面的时候常见的QWidget控件已经够用了。但是如果用户想同时使用多个自绘控件并与其进行交互,常见的静态控件实现起来就比较困难了。比如在一些平 ......
QGraphicsScene和QGraphicsView坐标系统
Graphics View中有三个坐标系统,即场景坐标、视图坐标、图形项坐标。 场景坐标场景坐标等价于QPainter的逻辑坐标,一般以场景中心为原点;视图坐标与设备坐标相同,是物理坐标,默认为左上角为原点;图形项的坐标是局部逻辑坐标,一般以图形项的中心为原点。 一个图形项的位置是其中心点在父坐标中 ......
Qt 图形视图框架<三>——<坐标系统>
Qt 图形视图框架<三>——<坐标系统> 一 基础知识 图形视图框架是基于笛卡尔坐标系统的,一个图形项在场景中的位置和几何形状由x坐标和y坐标来表示。当使用一个没有变换的视图来观察场景时,场景中的一个单元代表屏幕上的一个像素。图形视图框架的三个坐标系分别是视图坐标系、场景坐标系和图元坐标系。三个坐标 ......
Qt中QGraphics类坐标映射关系详解
1、Item(图元)坐标:属于局部坐标,通常以图元中心为原点(中心对称),非中心对称类,比如dialog类,一般以左上角为原点,正方向x朝右,y朝下。 2、setPos的坐标是父类坐标系的坐标,一般对于item位于scene中的应用场景。 3、scene(场景)坐标:属于逻辑坐标 logical c ......
天文坐标系
银道坐标系:Galactic Coordinate System ![image](https://img2023.cnblogs.com/blog/2122825/202309/2122825-20230907141907068-1208127161.png) > 图片来源: https://as ......
易基因:MLL1/DNA低甲基化介导子宫肌层干细胞发育重编程的表观遗传机制|组学研究
大家好,这里是专注表观组学十余年,领跑多组学科研服务的易基因。 子宫肌瘤(uterine fibroids,UF)是生殖系统最常见的良性肿瘤,也是子宫切除手术最常见的指征。尽管患病率很高,但子宫肌瘤的确切发病机制在很大程度上仍未知。有证据表明,发育期间暴露于激素可能与子宫肌层易感UF发育有关,当发育 ......
ElasticSearch系列——查询、Python使用、Django/Flask集成、集群搭建,数据分片、位置坐标实现附近的人搜索
@[toc] # Elasticsearch之-查询 ``` 查询分类: 基本查询:使用es内置查询条件进行查询 组合查询:把多个查询组合在一起进行复合查询 过滤:查询的同时,通过filter条件在不影响打分的情况下筛选数据 ``` ## 一 基本查询 ```python #添加映射 PUT lag ......
基因芯片数据分析一般可以执行哪些程序
基因芯片数据分析通常包括以下程序: 1. 数据预处理:对原始芯片数据进行质控、去噪和归一化处理,确保数据的准确性和可比性。 2. 差异表达分析:通过比较不同条件下的基因表达水平,找出在不同条件下显著差异表达的基因。 3. 功能富集分析:将差异表达的基因进行功能注释和分类,然后使用统计方法判断哪些功能 ......
参考基因组准备
> 参考:https://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzAxMDkxODM1Ng==&mid=2247483738&idx=1&sn=bd57965cf960293837671b315b35c4d4&chksm=9b4841e1ac3fc8f7d4102f1b07abce8d ......
易基因:MeRIP-seq等揭示mRNA m6A甲基化调控拟南芥的抗寒性分子机制|植物抗逆
大家好,这里是专注表观组学十余年,领跑多组学科研服务的易基因。 植物通过改变数千个基因的mRNA丰度以促进其生理和代谢过程,从而对低温应激进行响应。在转录后水平上,这些冷应激应答转录本经历可变剪接、microRNA介导的调控和可变多腺苷酸化等。最近研究表明,m6A、m5C等RNA修饰可以影响RNA调 ......
视觉SLAM十四讲 3.6.2实际的坐标转换的例子
在这一讲中,作者没有给出详细的过程,作为初学者还是有点懵。 这道题是有两种解法的 - 四元数解法 - 欧拉矩阵解法 ### 四元数解法 假设一个目标点 $p$在世界坐标系下的坐标是 $$ P_W $$ 利用四元数表示旋转,两个小萝卜坐标系下 $p$ 点坐标有如下公式: $$ p_1 = q_1 * ......