探索性 干货 甲基 基因
从宏基因组测序数据生成宏基因组组装基因组的计算工具
从宏基因组测序数据生成宏基因组组装基因组的计算工具 小组成员及分工 王嘉璐 22020080046：负责摘要、引言部分 王涵 22020080045：负责用于构建mag的上游分析工具部分 王婷 22020080047：负责总结，查找文献，博文整理汇总 1 摘要 微生物本质上与地球上的人类生活有着错综 ......
【高中生物必修二】第二章 基因和染色体
# 第一节 减数分裂与受精作用 减数分裂是两倍体细胞（有性繁殖）产生单倍体配子的过程，简单而言，染色体的数量变为一半。二倍体细胞中每一对染色体大小形态意义类似，一个从母方获得，一个从父方获得，故一对染色体也会有差距。有丝分裂产生复制品，往往用于常被磨损的细胞，例如皮肤。减数分裂的主要目的是增加遗传多 ......
菜心bZIP基因家族分析报告
菜心bZIP基因家族分析报告 菜心（Brassica campestris L.ssp.chinensis var.utilis Tsen et Lee），又名菜薹，是十字花科芸薹属白菜亚种的变种。作为我国华南地区的特产蔬菜之一，其品质柔嫩，营养丰富，深受消费者的喜爱。菜心生长周期短，复种指数高，可 ......
生物信息学-新型冠状病毒SARS-CoV-2 S蛋白基因的变异与进化分析
新型冠状病毒SARS-CoV-2 S蛋白基因的变异与进化分析 食硕2201班 汪睿劼 22020080043 食硕2201班 张 琦 22020080063 食硕2201班 孙 允 22020080037 食硕2201班 韩秋雨 22020080043 摘要：新型冠状病毒SARS-CoV-2 引发的 ......
易基因｜一种全新的检测DNA羟甲基化的技术：ACE-Seq
大家好，这里是专注表观组学十余年，领跑做组学科研服务的易基因。今天给大家介绍一种全新的检测DNA羟甲基化的技术：APOBEC-coupled epigenetic sequencing，简称【ACE-seq】。 前言 DNA序列中胞嘧啶（C）5’ 碳位结合一个甲基基团而转变成5mC的现象称为DNA基 ......
【Clickhouse】ReplaceingMergeTree引擎final实现合并去重探索
为了保证统计数据的准确性，比如订单金额，一个常用的方法是在查询时增加final关键字。那final关键字是如何合并数据的，以及合并的数据范围是怎样的，本文就对此做一个简单的探索。 ......
探索新常态——揭开当代代工竞争背后的规律
从消费零售全领域的实践观察来看，仅仅凭借产品赢得竞争的时代已经过去，商业模式创新体现在越来越多企业向“产品+服务”转变，向用户全生命周期需求挖掘转变。企业与消费者之间的关系从过去的一次性、断点式产品交易，转向持续性、覆盖全生命周期的收费形式。 汽车消费者的需求偏好也在悄然发生着位移。硬软件技术、 ......
微生物测序：应用于人类肠道微生物组具有菌株分辨率的高通量单微生物基因组学
Microbe-seq: high-throughput, single-microbe genomics with strain resolution, applied to a human gut microbiome doi: https://doi.org/10.1101/2020.12.1 ......
Python大数据分析揭示新冠疫情趋势——探索病例、死亡率和康复情况
一、选题背景 1.背景 自2020年初起，新冠病毒（COVID-19）迅速传播并导致全球大流行。该病毒最初在中国武汉市被确认，并随后迅速传播到全球各地。由于其高度传染性和致命性，许多国家不得不采取严格的措施来控制其传播。在此期间，许多科学家和医疗专家投入了大量时间和资源来了解这种新的冠状病毒，如何预 ......
易基因：小檗碱通过介导m6A mRNA甲基化调控斑马鱼肝细胞氧化应激、凋亡和自噬
大家好，这里是专注表观组学十余年，领跑多组学科研服务的易基因。 中药小檗碱（Berberine，BBR，化学式C20H18NO4）是从几种药用植物中分离出的一种异喹啉季生物碱，包括小檗（Berberis aristata）和黄连（Coptis chinensis）。小檗碱可改善脂质代谢紊乱诱导的细胞 ......
云图说|ModelArts开发环境，让AI开发、探索、教学更简单
摘要：ModelArts开发环境，以云原生的资源使用和开发工具链的集成，目标为不同类型AI开发、探索、教学用户。 本文分享自华为云社区《【云图说】| 第280期 ModelArts开发环境，让AI开发、探索、教学更简单，提升云化AI开发体验~》，作者： 阅识风云 。 ModelArts开发环境，以云 ......
人工智能创新挑战赛：助力精准气象和海洋预测Baseline[2]：数据探索性分析（温度风场可视化）、CNN+LSTM模型建模
人工智能创新挑战赛：助力精准气象和海洋预测Baseline[2]：数据探索性分析（温度风场可视化）、CNN+LSTM模型建模 ......
Antv X6 + LiteFlow流程编排引擎探索
一、LiteFlow的介绍 LiteFlow官方网站和代码仓库地址 官方网站：https://yomahub.com/liteflow Gitee托管仓库：https://gitee.com/dromara/liteFlow Github托管仓库：https://github.com/dromara ......
R：Wilcoxon秩和检验，比较两组样本中的基因表达差异
setwd("E:\\20220927宏基因组教学\\02后期分析\\05willcox")library(doBy)gene <- read.table('table.l5.relative-SE.txt', sep = '\t', row.names = 1, header = TRUE, st ......
虹科干货 | 虹科Redis企业版数据库的延迟如此之小，proxy功不可没！
在Redis企业版集群的后台发生了许多事件，proxy（代理）隐藏了数据库客户端的所有活动。 大多数开发人员在构建应用程序时都会从小规模开始，使用简单的Redis开源（Redis OSS）数据库。在初期阶段，使用数据库非常直接，只需连接到单一的端点并发送请求。 然而，当Redis应用程序的需求变得更 ......
rocketmq生产环境升级（干货）
方案一： 升级 K8s pod资源 交替清空其中一组 broker(m-s) 消息，重启pod 优点：操作简单，无需新增资源，在原有资源上扩容 缺点：只完成当前升级，最大只能升级到4C 8G，后续业务量起来有可能还需要升级（升级硬件） 操作： 1. 摘除写入流量 brokerPermission=2 ......
波司登云原生微服务治理探索
在产品力和销售成绩单背后，波司登在生产、仓储、物流、销售各环节已完成数字化转型和创新改造。除生产端的智能生产工厂，波司登对仓储和物流环节也进行智能化改造，提升小单快反、拉式补货的比重，最大限度减少困扰服装企业多时的“库存”问题；为了精准分发销售端产品，波司登建立数据中台，打通全渠道数据，赋能消费者研... ......
探索 Web 管理之路，OpenYurt 社区 UI/CLI SIG 正式启动
尽管在差异化技术竞争力方面已经取得了诸多进展，在与社区用户和开发者的交流中，我们发现 OpenYurt 的使用门槛仍然相对较高，需要更加易用的工具和文档来降低这个门槛。因此，易用性会是 OpenYurt 社区接下来重点解决的问题之一。 ......
视觉盛宴：探索可视化大屏的无限魅力
可视化大屏通过直观易懂、全局把控、即时更新、数据交互等特点，为用户提供了高效、准确的数据展示和分析工具。它能够帮助用户快速洞察业务情况，做出及时决策，提升工作效率和业务竞争力，因此备受欢迎。 ......
可视化探索开源项目的 contributor 关系
作为国内外最大的代码托管平台，根据最新的 GitHub 数据，它拥有超 372,000,000 个仓库，其中有 28,000,000 是公开仓。分布式图数据库 NebulaGraph 便是其中之一，同其他开源项目一样，NebulaGrpah 也有自己的 contributor 们，他们是何时，通过哪... ......
基于三代长读长测序数据的基因组组装算法分析
基于三代长读长测序数据的基因组组装算法分析 吕利王晓利张文娟韩芝侠 宝鸡文理学院电子电气工程学院 摘要：目的 指出当前已有的基于三代测序数据的基因组组装方法的缺陷，并提出改进措施，以提高组装的准确率与运行效率。方法 深入分析当前基于三代长读长测序技术的基因组组装方法，包括基于“校正后组装”策略的FA ......
基于长读的基因组重复序列查找技术研究
基于长读的基因组重复序列查找技术研究 郭睿 深圳大学 摘要：基因组中出现两次或者两次以上基本相同的序列称为重复序列。重复序列信息可以用来可以分析物种的进化,减少基因比对歧义,降低序列拼接数据缺失。与标准重复序列库对比,基于短读序列数据的重复序列查找技术得到的结果并不完整,平均长度较短。长读数据平均长 ......
面向第三代测序技术的基因组长序列片段比对算法研究
面向第三代测序技术的基因组长序列片段比对算法研究 周佩霞 湖南师范大学 摘要：随着测序技术不断发展和改进,测得的基因组序列片段数据的特征也在不断变化。为适应当前第三代测序技术,基因组序列比对算法需要进行深入的研究和改进,以便更适合于处理第三代测序技术测得的长序列片段数据。本文重点研究分析了基于哈希和 ......
基于第三代测序数据的基因组结构变异检测方法研究
基于第三代测序数据的基因组结构变异检测方法研究 姜涛 哈尔滨工业大学 摘要：随着测序技术的不断成熟和广泛应用,以测序技术为驱动的基因组、转录组等多组学的研究得到了跨越式发展,推动了基因组科学、遗传学、临床医学等多学科的变革。基因组变异检测作为基因组研究中最为核心和关键的环节,对于基因组注释、与疾病和 ......
基于MECAT的长读长对相似基因组比对算法的研究与实现
基于MECAT的长读长对相似基因组比对算法的研究与实现 何欣雨 北京交通大学 摘要：基因测序的意义是使人类从根本上认知疾病发生的原因,做到正确的治疗疾病、尽早的预防疾病。例如肿瘤和红斑狼疮等疾病都是和基因变异有关,如果能过通过测序技术知道变异点,对精准治疗,攻克难题有重大意义。第三代测序技术是Pac ......
基于第三代测序技术的基因组SNP和Indel变异检测关键算法研究
基于第三代测序技术的基因组SNP和Indel变异检测关键算法研究 廖小青 哈尔滨工业大学 摘要：随着生活水平的提升,人们对于自身的好奇促使人们对基因进行研究。其中,变异是人类疾病的一个重要诱因,对变异进行研究可以推动基础生物学和医学的发展。相比于大区域基因组的结构变异,SNP和Indel变异这种小区 ......
AI入门纯干货系列课程目录
第一课、AI导论 第二课、机器学习导论 第三课、特征工程 第四课、KNN最近邻算法 第五课、朴素贝叶斯算法 第六课、决策树/随机森林 第七课、常用机器学习算法性能对比 第八课、SVD分解及PCA 第九课、集成学习 第十课、深度学习导论 第十一课、计算机视觉概述 第十二课、CNN卷积神经网络 第十三课 ......
易基因：全基因组ChIP-seq分析揭示细菌转录因子PhoB的基因内结合位点｜mBio
大家好，这里是专注表观组学十余年，领跑多组学科研服务的易基因。 细菌编码许多转录因子（transcription factor，TF），这些转录因子通过与启动子周围的DNA结合并调控RNA聚合酶（RNAP）全酶以结合启动子DNA或异构化为主动转录构象的能力来调节转录起始。目前对TF功能的研究几乎集中 ......
【lwip】14-TCP协议分析之TCP协议之可靠传输的实现（TCP干货）
# lwip_14_TCP协议之可靠传输的实现 ## 前言 前面章节太长了，不得不分开。 这里已源码为主，默认读者已知晓概念或原理，概念或原理可以参考前面章节，有分析。 参考：李柱明博客：[https://www.cnblogs.com/lizhuming/p/17438743.html](ht ......