探索性 干货 甲基 基因
易基因：ChIP-seq等揭示热休克转录因子A1b调控植物高温胁迫响应的分子机制｜应激反应
大家好，这里是专注表观组学十余年，领跑多组学科研服务的易基因。 在拟南芥中，热休克转录因子A1b（HEAT SHOCK TRANSCRIPTION FACTORA1b，HSFA1b）通过影响种子产量来调控对环境胁迫的抗性。HSFA1b是生殖适应性的决定性因素，这种调控机制怎么形成的呢？ 2018年， ......
技术干货｜如何利用 ChunJun 实现数据实时同步？
实时同步是 ChunJun 的⼀个重要特性，指在数据同步过程中，数据源与⽬标系统之间的数据传输和更新⼏乎在同⼀时间进⾏。 在实时同步场景中我们更加关注源端，当源系统中的数据发⽣变化时，这些变化会⽴即传输并应⽤到⽬标系统，以保证两个系统中的数据保持⼀致。这个特性需要作业运⾏过程中 source 插件不 ......
【深入浅出Spring原理及实战】「源码调试分析」深入源码探索Spring底层框架的的refresh方法所出现的问题和异常
学习Spring源码的建议 阅读Spring官方文档，了解Spring框架的基本概念和使用方法。 下载Spring源码，可以从官网或者GitHub上获取。 阅读Spring源码的入口类，了解Spring框架的启动过程和核心组件的加载顺序。 阅读Spring源码中的注释和文档，了解每个类和方法的作用和 ......
拥抱Serverless释放生产力，探索华为云Serverless车联网最佳实践
华为云Serverless车联网场景解决方案，以FunctionGraph为核心的Serverless化组合方案，使用FunctionGraph、OBS、DIS等技术，可以实现架构的灵活扩展，在出行高峰期可以自动扩展满足系统的性能要求，在空闲时段则能够缩减规模，降低成本。帮助企业减少运维成本、加速业 ......
[干货满满] CIFAR10炼丹记后篇 - CS231N 番外
期中考试结束了,来填坑,因为真正接触到了玄学和银河的部分,也算是试验了几天的成果把( 在上一个文章中, 我们已经提到了, 通过本课程学到的各种技巧, 我们将准确度提升到了80%, 这已经超过了大多数CS231N博客的效果了. 但是毕竟这个是在基本的卷积网络架构去操作的, 所以后续想要再提升, 就只能 ......
干货分享：用ChatGPT调教批量出Midjourney咒语，出图效率Nice ，附资料。
Prompts就是AI绘图的核心竞争力。 您是不是觉得用Midjourney生成的图不够完美？ 又让ChatGPT去生成Prompt，然后效果还不理想？ 其实ChatGPT你给他投喂资料后，经过调教的ChatGPT，生成的Prompt效果会很不错。 文末附《一整套MidJourney指令大全》+《C ......
高通量测序的数据处理与分析(二)--宏基因组2
博客原文 宏基因组数据处理方法 数据下载 wget下载 宏基因组的数据主要分布在两个数据库：1. NCBI的SRA数据库，2. ENA。近年来也有许多研究者将数据上传到中国的数据库：NGDC 你可以直接通过网页下载数据，或者是通过各个网站提供的下载工具进行批量下载。也可以到 sra-exporter ......
10万字干货：《数字业务连续性提升最佳实践》免费领取｜TakinTalks社区
一分钟精华速览 首刊限版400本，没有电子版下载。 100本作为社区福利，免费领取，领完即止！不加印。 为什么会有这本刊物？ TakinTalks社区是由业内专家共同发起的、专注业务稳定性提升的技术交流平台。面向技术管理者和一线从业者，定期探讨行业前沿的技术，分享最新的、可参考的、可落地的实战经验。 ......
Megahit基因组装
1、背景 每一个物种的参考基因组序列（reference genome）的产生都要先通过测序的方法，获得基因组的测序读段（reads），然后再进行从头拼接或组装（英文名称为do novo genome assembly），最后还原测序物种的各条染色体的序列，即ATGC四种碱基的排列顺序。 之所以要进 ......
针对一套增删改查涉及到流程的解决方案（干货）
1.第一步流程节点要确保是活的，可以在数据库里面的配置字典表里面去写记录，到时候查这张表的对应的是哪个节点即可，如果没有配置字典表的话，也可以去建一个流程节点表 这样的好处是方便以后的扩展性，可以随时增加新的流程节点，以及流程。可以采用-去拼接 例：1-2-3-4-5代表这个流程完整走完需要经过这五 ......
探索FSM （有限状态机）应用
我们是袋鼠云数栈 UED 团队，致力于打造优秀的一站式数据中台产品。我们始终保持工匠精神，探索前端道路，为社区积累并传播经验价值。。 本文作者：木杪 有限状态机（FSM） 是计算机科学中的一种数学模型，可用于表示和控制系统的行为。它由一组状态以及定义在这些状态上的转换函数组成。FSM 被广泛用于计算 ......
易基因：MeRIP-seq等揭示m6A甲基化修饰对抗病毒基因表达的转录调控机制｜Cell Rep
大家好，这里是专注表观组学十余年，领跑多组学科研服务的易基因。 2021年03月02日，杜克大学医学中心的分子遗传学和微生物学系Stacy M. Horner教授团队在《Cell Reports》（IF: 9.995）杂志发表了题为“Post-transcriptional regulation o ......
基因组坐标到转录本坐标转换——单碱基模式
今天分享一个自己写的python小脚本可以实现单碱基的基因组位置转换到转录本的坐标，欢迎大家使用，并提出错误 #!/share/home/hujun/miniconda3/bin/python3 import pybedtools from pybedtools import BedTool imp ......
SRE从CMDB到SMDB的自动化探索演进——面向服务的运维
SRE和系统运维的最大区别，我认为SRE得在系统运维的基础上研究业务，研究系统架构、产品架构，SRE面向的是用户稳定性。 大型互联网系统，模块多、依赖关系和运行环境复杂，如果不了解系统架构，在出现问题时基本就是抓瞎的，不知道服务的功能，不知道到故障后对用户的影响，不知道出了问题后查哪些指标，不知道服 ......
虹科干货 | 打破传统！金融界黑科技—虹科Redis企业版数据库
许多传统金融机构面临的“老年病”问题仍在阻碍其数字化转型之路。针对这一挑战，一些具有前瞻眼光的金融初创企业开始采用高性能、高可用的虹科Redis企业版数据库来应对海量实时数据和复杂查询需求，提升服务质量和客户满意度。这不仅有助于金融机构应对数字化变革带来的挑战和压力，更能够满足客户的期望，促进金融行... ......
软件架构生态化-多角色交付的探索实践
作为一个技术架构师，不仅仅要紧跟行业技术趋势，还要结合研发团队现状及痛点，探索新的交付方案。在日常中，你是否遇到如下问题 “ 业务需求排期长研发是瓶颈；非研发角色感受不到研发技改提效的变化；引入ISV 团队又担心质量和安全，培训周期长“等等，基于此我们探索了一种新的技术体系及交付方案来解决如上问题。 ......
从国家基因组科学数据中心下载数据
001、官方网站：https://ngdc.cncb.ac.cn/ 002、入口： 003、输入数据编号： 004、 005、 06、 linux下载说明 ......
宏基因组学是如何出现的？它的出现对微生物学领域有多大的改变？
宏基因组学是在生物技术和计算机科学的帮助下发展起来的，它的出现可以追溯到上世纪90年代后期。传统微生物学侧重于使用培养方法研究单个微生物菌落，而宏基因组学则通过分析环境中的dna，可以同时研究数百万个微生物群体。这种方法能够提供关于整个微生物群落的结构、功用潜力和相互作用等信息。 宏基因组学对于微生 ......
支持多模型数据分析探索的存算分离湖仓一体架构解析（下）
当企业需要建设独立的数据仓库系统来支撑BI和分析业务时，有了“数据湖+数据仓库”的混合架构。但混合架构带来了更高的建设成本、管理成本和业务开发成本。随着大数据技术的发展，通过在数据湖层增加分布式事务、元数据管理、极致的SQL性能、SQL和数据API接口能力，企业可以基于统一的架构来同时支持数据湖和数 ......
支持多模型数据分析探索的存算分离湖仓一体架构解析（上）
当企业需要建设独立的数据仓库系统来支撑BI和业务分析业务时，有了“数据湖+数据仓库”的混合架构。但混合架构带来了更高的建设成本、管理成本和业务开发成本。随着大数据技术的发展，通过在数据湖层增加分布式事务、元数据管理、极致的SQL性能、SQL和数据API接口能力，企业可以基于统一的架构来同时支持数据湖 ......
易基因：全基因组CpG密度和DNA甲基化分析方法比较（MeDIP、RRBS和WGBS）| 研究综述
大家好，这里是专注表观组学十余年，领跑多组学科研服务的易基因。 CpG密度（CpG density）与各种组织中的DNA甲基化相关。基因组按CpG密度分为：CpG岛（CpG island，CGI）、CpG岛上下游2kb以内的区域（CpG shore ，CpG岛岸）、CpG岛岸上下游2kb以内的区域（ ......
使用Sentieon加速甲基化(WGBS)分析
全基因组甲基化测序(WGBS)是一种研究DNA甲基化的方法，以全面了解在基因组水平上的表观遗传变化。在进行WGBS数据分析时，通常需要使用专门的比对工具，因为这些工具需要能够处理亚硫酸盐转化后的数据。 以下是四个不同的WGBS比对分析流程： Bismark：Bismark是一个基于Bowtie2或H ......
高通量测序的数据处理与分析指北(二)-宏基因组篇
宏基因组篇 前言 之前的一篇文章已经从生物实验的角度讲述了高通量测序的原理，这篇文章旨在介绍宏基因组二代测序数据的处理方式及其原理。在正文开始之前，我们先来认识一下什么是宏基因组。以我的理解，宏基因组就是某环境中所有生物的基因组的合集，这个环境可以是下水道，河流等自然环境，也可以是人体内肠道，口腔等 ......
实时分布式低延迟OLAP数据库Apache Pinot探索实操
一个适合工业物联网实时采集传感器数据实时分析工业设备的数据实现更好的预测性感知的分布式NoSQL数据库Apache Pinot，先了解其特性和使用场景，然后通过Local和Docker两种方式部署Apache Pinot和验证环境，最后通过实操其批和流式导入数据和利用其控制台端点查询数据。 ......
企业内部培训网站为例，探索云上成本优化
摘要：本文就以一个企业内部培训网站为例，拆解云上成本优化方案需要注意的点，抛砖引玉，帮助大家参考业务架构，合理节省费用。 本文分享自华为云社区《云上成本优化方案——以一个企业内部培训网站为例》，作者：云存储开发者支持团队。 越来越多的企业选择将服务搭建在云上，业务初期访问量、数据量都较小，成本问题还 ......
干货 | 自动驾驶领域各大顶会顶刊集合梳理（附名单） 曼孚科技
自动驾驶是近年来备受关注的热门领域之一，无论是Google、特斯拉、百度等知名企业，还是各大学术机构，都在积极探索自动驾驶的技术与应用。为了促进该领域的交流与发展，一些重要的顶级会议和期刊应运而生。 这些国际学术会议与期刊不仅为自动驾驶技术的研究提供了平台，同时也为企业和机构们提供了更好的交流机会， ......
Java集成工作流审批机制，多个项目实际运用优化版本（干货）
前言 activiti工作流引擎项目，企业erp、oa、hr、crm等企事业办公系统轻松落地，一套完整并且实际运用在多套项目中的案例，满足日常业务流程审批需求。 一、项目形式 springboot+vue+activiti集成了activiti在线编辑器，流行的前后端分离部署开发模式，快速开发平台， ......
精通 Pandas 探索性分析：1~4 全
原文：Mastering Exploratory Analysis with Pandas 协议：CC BY-NC-SA 4.0 译者：飞龙 一、处理不同种类的数据集 在本章中，我们将学习如何在 Pandas 中使用不同种类的数据集格式。 我们将学习如何使用 Pandas 导入的 CSV 文件提供的 ......
【机器学习入门与实践】数据挖掘-二手车价格交易预测（含EDA探索、特征工程、特征优化、模型融合等）
【机器学习入门与实践】数据挖掘-二手车价格交易预测（含EDA探索、特征工程、特征优化、模型融合等） note：项目链接以及码源见文末 1.赛题简介 了解赛题 赛题概况 数据概况 预测指标 分析赛题 数据读取pandas 分类指标评价计算示例 回归指标评价计算示例 EDA探索 载入各种数据科学以及可视 ......