甲基 基因ace-seq全新
吉林省农科院不同地点B73和Mo17玉米材料宏基因组分析
标题：吉林省农科院不同地点B73和Mo17玉米材料宏基因组分析 摘要： 本研究旨在通过对吉林省农科院不同地点种植的B73和Mo17玉米材料进行宏基因组分析，探究它们在不同时间点和地点的土壤微生物群落组成和功能潜力差异。通过在三个地点种植三块地，每块地一半种植B73玉米材料，另一半种植Mo17玉米材料 ......
高维数据惩罚回归方法：主成分回归PCR、岭回归、lasso、弹性网络elastic net分析基因数据|附代码数据
全文链接：http://tecdat.cn/?p=23378 最近我们被客户要求撰写关于高维数据惩罚回归方法的研究报告，包括一些图形和统计输出。 在本文中，我们将使用基因表达数据。这个数据集包含120个样本的200个基因的基因表达数据。这些数据来源于哺乳动物眼组织样本的微阵列实验 1 介绍 在本文中 ......
Mojo：LLVM&Swift之父创建的全新编程语言，比Python快35000倍
“Mojo 可能是近几十年来最大的编程语言进步。” 近日，由 LLVM 和 Swift 编程语言的联合创始人 Chris Lattner 创办的新公司 Modular AI 发布了一种名为 Mojo 的新编程语言。 Mojo 将大家喜爱的 Python 特性，同 C、C++和 CUDA 的系统编程功 ......
高维数据惩罚回归方法：主成分回归PCR、岭回归、lasso、弹性网络elastic net分析基因数据|附代码数据
全文链接：http://tecdat.cn/?p=23378 最近我们被客户要求撰写关于高维数据惩罚回归方法的研究报告，包括一些图形和统计输出。 在本文中，我们将使用基因表达数据。这个数据集包含120个样本的200个基因的基因表达数据。这些数据来源于哺乳动物眼组织样本的微阵列实验 1 介绍 在本文中 ......
全新 – Amazon EC2 R6a 实例由第三代 AMD EPYC 处理器提供支持，适用于内存密集型工作负载
我们在 Amazon re:Invent 2021 上推出了通用型 Amazon EC2 M6a 实例，并于今年 2 月推出了计算密集型 C6a 实例。这些实例由运行频率高达 3.6 GHz 的第三代 AMD EPYC 处理器提供支持，与上一代实例相比，性价比提高多达 35%。 如今，我们正在扩展产 ......
速递：易基因科技应邀在广东药科大学生物信息系讲课分享表观遗传学研究技术
2023年5月8日上午，深圳市易基因科技有限公司高级技术总监王君文应邀至广东药科大学医药信息工程学院生物信息系开展关于“基因组学时代：表观遗传学研究及DNA甲基化技术介绍”的线下讲座。讲座由生物信息系副主任任重鲁主持，众多学生积极响应参与。 表观遗传学是研究基因的核苷酸序列不发生改变的情况下，基因表 ......
界面控件DevExpress Blazor UI v22.2亮点：全新的Window组件
DevExpress拥有.NET开发需要的所有平台控件，包含600多个UI控件、报表平台、DevExpress Dashboard eXpressApp 框架、适用于 Visual Studio的CodeRush等一系列辅助工具，该组件拥有众多新产品和数十个具有高影响力的功能，可为桌面、Web和移动 ......
易基因：2023年植物表观转录组研究的最新进展（m6A+m5C）｜深度综述
大家好这里是专注表观组学十余年，领跑多组学科研服务的易基因。 被称为表观转录组（epitranscriptome）的RNA修饰正成为基因调控的广泛调控机制。由于绘制转录组范围RNA修饰测序策略的改进，以及分别对沉积、去除和识别RNA修饰的writers、erasers和readers密集表征，表观转 ......
68元工业级双核A7,全新T113核心板震撼上市!
万象奥科全新T113核心板震撼上市，仅68元、工业级品质、双核A7处理器、外设丰富，诠释极致性价比！ 参数速递 1.全志T113工业级处理器，主频1.2GHz 2.双核Cortex-A7+玄铁C906 RISC-V + HiFi4 DSP异构多核 3.内存128MB/256MB/512MB，存储25 ......
02Prodigal基因预测
1、简介 Prodigal是为细菌和古菌基因组进行蛋白编码基因预测的软件 ,其缩写源于PROkaryotic DYnamic Programming Genefinding ALgorithm,表示原核生物基因预测的动态规划算法。 最早在2007年，在美国能源部联合基因组研究所(DOE)的支持下，由 ......
利用snpEff对基因型VCF文件进行变异注释的详细方法
利用snpEff对VCF文件进行变异注释 群体遗传研究中，在获得SNP位点后,我们需要对SNP位点进行注释，对这些SNP位点进行更深的了解。 snpEff是一个用于对基因组单核苷酸多态性(SNP)进行注释的软件，snpEff软件可以用于对VCF文件进行变异注释，使用时需要先进行安装，然后构建参考基因 ......
数栈V6.0全新产品矩阵发布，数据底座 EasyMR 焕新升级
4月20日，袋鼠云成功举行了以“数实融合，韧性生长”为主题的2023春季生长大会。会上，袋鼠云自主研发的一站式大数据基础软件——数栈V6.0产品矩阵全新发布。对旗下大数据基础平台、大数据开发与治理、数据智能分析与洞察三大模块的全线产品进行全新升级，并重点发布了企业级数据计算与存储平台——自研大数据引 ......
重磅！阿里云云原生合作伙伴计划全新升级：加码核心权益，与伙伴共赢新未来
云原生致力于帮助企业客户最大限度的减轻运维工作，更好的实现敏捷创新，全面释放生产力，实现数字化创新升级。本次云原生合作伙伴计划全新升级，将与伙伴共拓市场空间，做大云市场，做深行业数字化。 ......
易基因：禾本科植物群落的病毒组丰度/组成与人为管理/植物多样性变化的相关性 | 宏病毒组
大家好，这里是专注表观组学十余年，领跑多组学科研服务的易基因。 现代农业通过简化生态系统、引入新宿主物种和减少作物遗传多样性来影响植物病毒的出现。因此，更好理解农业生态中种植和未种植群落中的病毒分布，以及它们之间的病毒交换至关重要。2023年03月14日，《Microbiol Spectr》杂志发表 ......
还在玩传统终端，不妨来试试全新 AI 终端 Warp
壹 ❀ 引 最近一段时间，AI领域如同雨后春笋般开始猛烈生长，processon，sentry，一些日常使用的工具都在积极接入AI，那么正好借着AI的风头，今天给大家推荐一款非常不错的智能终端 warp（目前仅限macOS，Windows or Linux还需要等等），如果你还在用传统终端，那么你更 ......
易基因：ChIP-seq等揭示热休克转录因子A1b调控植物高温胁迫响应的分子机制｜应激反应
大家好，这里是专注表观组学十余年，领跑多组学科研服务的易基因。 在拟南芥中，热休克转录因子A1b（HEAT SHOCK TRANSCRIPTION FACTORA1b，HSFA1b）通过影响种子产量来调控对环境胁迫的抗性。HSFA1b是生殖适应性的决定性因素，这种调控机制怎么形成的呢？ 2018年， ......
Caesar一个全新的敏感文件发现工具
https://github.com/0ps/Caesar 一 支持主流平台: 得益于golang的跨平台优势。一次编译，到处运行。 二 强大的并发: golang的并发独树一帜。12线程下能实现每秒千级请求。为了安全性，默认只设置了3线程。 三 路径记忆功能: Caesar可以记忆路径的击中次数， ......
高通量测序的数据处理与分析(二)--宏基因组2
博客原文 宏基因组数据处理方法 数据下载 wget下载 宏基因组的数据主要分布在两个数据库：1. NCBI的SRA数据库，2. ENA。近年来也有许多研究者将数据上传到中国的数据库：NGDC 你可以直接通过网页下载数据，或者是通过各个网站提供的下载工具进行批量下载。也可以到 sra-exporter ......
Megahit基因组装
1、背景 每一个物种的参考基因组序列（reference genome）的产生都要先通过测序的方法，获得基因组的测序读段（reads），然后再进行从头拼接或组装（英文名称为do novo genome assembly），最后还原测序物种的各条染色体的序列，即ATGC四种碱基的排列顺序。 之所以要进 ......
易基因：MeRIP-seq等揭示m6A甲基化修饰对抗病毒基因表达的转录调控机制｜Cell Rep
大家好，这里是专注表观组学十余年，领跑多组学科研服务的易基因。 2021年03月02日，杜克大学医学中心的分子遗传学和微生物学系Stacy M. Horner教授团队在《Cell Reports》（IF: 9.995）杂志发表了题为“Post-transcriptional regulation o ......
基因组坐标到转录本坐标转换——单碱基模式
今天分享一个自己写的python小脚本可以实现单碱基的基因组位置转换到转录本的坐标，欢迎大家使用，并提出错误 #!/share/home/hujun/miniconda3/bin/python3 import pybedtools from pybedtools import BedTool imp ......
华为云新一代iPaaS全域融合集成平台全新升级
摘要：基于华为十多年的数字化转型实践，华为云通过组装式交付、数智驱动、DevOps、服务化架构、安全可信、韧性6大关键技术助力客户实现应用现代化和高质量增长，华为云新一代iPaaS全域融合集成平台ROMA Connect也应运而生。 本文分享自华为云社区《华为云新一代iPaaS全域融合集成平台全新升 ......
从国家基因组科学数据中心下载数据
001、官方网站：https://ngdc.cncb.ac.cn/ 002、入口： 003、输入数据编号： 004、 005、 06、 linux下载说明 ......
宏基因组学是如何出现的？它的出现对微生物学领域有多大的改变？
宏基因组学是在生物技术和计算机科学的帮助下发展起来的，它的出现可以追溯到上世纪90年代后期。传统微生物学侧重于使用培养方法研究单个微生物菌落，而宏基因组学则通过分析环境中的dna，可以同时研究数百万个微生物群体。这种方法能够提供关于整个微生物群落的结构、功用潜力和相互作用等信息。 宏基因组学对于微生 ......
新服开启 全新《梦想世界》新内容“游园叙梦”今日上线
全新《梦想世界》新内容“游园叙梦”今日重磅上线。全新140级装备震撼亮相，助少侠实力再攀高峰！庭院搭建超高自由度，打造专属于你的梦想家园！子女新增技能，为你带来更多的战斗惊喜！同时主题新服同步开启，两大精彩活动助力新服冲级，更有神兽奖励等你来拿！ 全新《梦想世界》官网 全新《梦想世界》品牌站 全新《 ......
易基因：全基因组CpG密度和DNA甲基化分析方法比较（MeDIP、RRBS和WGBS）| 研究综述
大家好，这里是专注表观组学十余年，领跑多组学科研服务的易基因。 CpG密度（CpG density）与各种组织中的DNA甲基化相关。基因组按CpG密度分为：CpG岛（CpG island，CGI）、CpG岛上下游2kb以内的区域（CpG shore ，CpG岛岸）、CpG岛岸上下游2kb以内的区域（ ......
电脑安全新突破：全球首款基于人工智能的网络安全系统上线
近年来，随着互联网的普及和信息化的发展，网络安全问题越来越受到人们的关注。为了保护个人隐私和企业机密，各种网络安全系统层出不穷。而今天，我们迎来了一款全球首款基于人工智能的网络安全系统——电脑安全新突破。 这款网络安全系统采用了最先进的人工智能技术，能够自动识别和分析网络攻击行为，并及时采取相应的防 ......
使用Sentieon加速甲基化(WGBS)分析
全基因组甲基化测序(WGBS)是一种研究DNA甲基化的方法，以全面了解在基因组水平上的表观遗传变化。在进行WGBS数据分析时，通常需要使用专门的比对工具，因为这些工具需要能够处理亚硫酸盐转化后的数据。 以下是四个不同的WGBS比对分析流程： Bismark：Bismark是一个基于Bowtie2或H ......
高通量测序的数据处理与分析指北(二)-宏基因组篇
宏基因组篇 前言 之前的一篇文章已经从生物实验的角度讲述了高通量测序的原理，这篇文章旨在介绍宏基因组二代测序数据的处理方式及其原理。在正文开始之前，我们先来认识一下什么是宏基因组。以我的理解，宏基因组就是某环境中所有生物的基因组的合集，这个环境可以是下水道，河流等自然环境，也可以是人体内肠道，口腔等 ......