基因组 基因 教授 植物
2356. 每位教师所教授的科目种类的数量
# 2356. 每位教师所教授的科目种类的数量 2023年8月14日07:54:45 [2356. 每位教师所教授的科目种类的数量](https://leetcode.cn/problems/number-of-unique-subjects-taught-by-each-teacher/) 简单 ......
基因测序技术 一二三代
开通黄钻 基因测序技术 基因测序技术 基因测序技术的发展前景非常可观，目前为止共出现了三代测序技术，第一代测序技术以Sanger为主；第二代测序是以Illumina为代表的一系列技术；第三代是以Pacific Biosciences[4]公司和 Nanopore[5]公司的单分子测序为代表的测序技术 ......
三代测序数据从碱基识别、基因组组装、变异检测和甲基化修饰检测等方面的内容
王院长的报告涵盖了针对三代测序数据从碱基识别、基因组组装、变异检测和甲基化修饰检测等方面的内容。 在基因组组装算法方面，王院长分享了其团队在二代和三代测序数据基因组组装算法设计与分析方面的成果和突破。其中，针对长读长测序的高错误率以及错误分布不均匀等问题，王院长介绍了团队设计的一系列基因组组装和po ......
关于基因组选择（GS）中准确性（accuracy）和预测能力（prediction ability）的区别？
在基因组选择领域，"准确性"（Accuracy）和"预测能力"（Prediction Ability）是两个常用的评价指标，用于衡量基因组选择模型的性能。 在学术研究中，两者都有用到，但没有明显区分，容易出现混用情况。 以下是一篇文章中的定义： https://bmcgenomics.biomedc ......
猎人基因: ADHD的另一面
我在科学的海洋中探索，期待着每一个未知的发现。然而，人类的大脑仍然是一个充满神秘和奥秘的领域。在这一次的探索之旅中，我将带你一起研究一种被称为注意力缺陷多动障碍（Attention Deficit Hyperactivity Disorder，简称ADHD）的情况。一些人称之为“猎人基因”，但这是否 ......
易基因：m5C RNA甲基转移酶及其在癌症中的潜在作用机制｜深度综述
大家好，这里是专注表观组学十余年，领跑多组学科研服务的易基因。 近年来，5-甲基胞嘧啶（m5C）RNA修饰已成为通过编码和非编码RNA调控RNA代谢和功能的关键参与者。越来越多的证据表明，m5C可以调控RNA稳定性、翻译、转录、出核和切割，以及介导细胞增殖、分化、凋亡、应激反应和其他生物学功能。人的 ......
易基因：RNA-BS揭示叶酸调控神经干细胞m5C修饰和mRNA翻译机制｜科研速递
大家好，这里是专注表观组学十余年，领跑多组学科研服务的易基因。 叶酸作为一种必需B族维生素，是一种具有重要生物学功能（包括DNA甲基化调控）的甲基供体。正常的神经发育和生理对细胞叶酸水平很敏感，而叶酸缺乏或过量都可能导致神经系统疾病。最近已有研究表明叶酸与哺乳动物线粒体中tRNA m5C修饰和翻译有 ......
P4795 [BalticOI 2018] 基因工程 题解
题目传送门：[Click](https://www.luogu.com.cn/problem/P4795)。 蒟蒻看见这道题，想了足足一个小时，过后顿有所悟，故作此篇。 首先，看到题目，光是数据就已经达到了 $\operatorname{O}(nm)$ 的级别，再看一看数据范围：$3 \leq n, ......
植物大战僵尸修改器制作--从入门到入土
[toc] # 基础准备 1. CheatEngine工具的基本使用 推荐视频[你能学会的Cheat Engine零基础入门教程](https://www.bilibili.com/video/BV1nR4y1u7PZ/?spm_id_from=333.999.0.0&vd_source=8c182 ......
易基因：单细胞DNA甲基化与转录组分析揭示猪生发泡卵母细胞成熟的关键调控机制｜项目文章
大家好，这里是专注表观组学十余年，领跑多组学科研服务的易基因。 在哺乳动物中，窦卵泡内的生发泡(germinal vesicle，GV) 卵母细胞可以保持数月或数年的静止状态。促黄体生成素(luteinizing hormone，LH)激增促进了减数分裂（meiosis）恢复，使卵母细胞获得受精后和 ......
泛基因组组装方法分类
001、迭代组装； 个体测序数据和参考基因组比对，提取未比对到参考基因组的序列，组装为contig，和参考基因组合并构成泛基因组。（依赖参考基因组） 002、map-to-pan； 个体测序数据组装成contig，然后和参考基因组比对，提取未比对到参考基因组的序列， 和参考基因组合并构成泛基因组。（ ......
使用 ARACNE 方法和合成数据集重建基因调控网络
在生物信息学中，基因调控网络的重建是一个重要的研究领域。这种网络可以揭示基因之间的相互作用，帮助我们理解生物系统的复杂性。在本文中，我将介绍如何使用 ARACNE 方法和合成数据集来重建基因调控网络。 ## ARACNE 方法 ARACNE（Algorithm for the Reconstruct ......
易基因：m6A-seq等揭示RBM33参与调控m6A去甲基化酶ALKBH5活性及其底物选择性
大家好，这里是专注表观组学十余年，领跑多组学科研服务的易基因。 RNA结合蛋白（RNA-binding protein，RBP）是一类结构和功能多样化的蛋白质，参与多种生物过程。越来越多的证据表明，RBP通过调控编码或非编码RNA的可变剪接、转运、稳定性、降解和翻译，在基因表达的转录后调控中发挥着关 ......
基于 Graviton2处理器构建容器化基因分析工作负载
概述 相对于基于传统 x86架构的处理器来说，Amazon 设计的基于 ARM 架构的 Graviton 处理器为 EC2中运行的云工作负载提供了更佳的性价比。基于 Graviton2 的实例支持广泛的通用型、突发型、计算优化型、内存优化型、存储优化型和加速计算型工作负载，包括应用程序服务器、微服务 ......
易基因8种表观转录组m6A MeRIP-seq的差异甲基化区域（DMR）分析软件比较 | 生信专区
大家好，这里是专注表观组学十余年，领跑多组学科研服务的易基因。 RNA甲基化是近年来研究基因表达调控转录后变化的重要研究领域，包括N6-甲基腺苷（m6A）在内的各种类型RNA甲基化参与人类疾病发展。MeRIP-seq作为一种新兴的在转录组范围内定量检测m6A水平的测序技术，拓展了RNA表观遗传学研究 ......
易基因：ChIP-seq等揭示H3K4me1修饰在蜜蜂级型分化中的表观遗传调控机制｜科研进展
大家好，这里是专注表观组学十余年，领跑多组学科研服务的易基因。 蜜蜂是一种真社会性昆虫，是研究社会性昆虫级型发育和级型分化的重要模式生物，其分工主要基于级型分化（蜂王(queen)和工蜂(worker)）。分化后，尽管基因组相同，但蜂王和工蜂具有不同的形态、生理、行为和寿命相关特征，级型分化的背后机 ......
生成式对抗网络在宏基因组研究中的应用
生成式对抗网络（GAN）在宏基因组研究中也有一些应用，以下是一些具体的应用领域： 宏基因组数据生成：宏基因组研究中，往往需要大规模的微生物组成和功能数据。使用GAN可以生成逼真的宏基因组数据，包括微生物的相对丰度、基因功能注释等，从而扩充数据集的规模和多样性。 数据降噪与去偏：宏基因组数据中存在大量 ......
生成式对抗网络与基因表达模拟
假设我们想要利用深度学习技术来进行基因表达模拟，主要目标是通过模型学习基因表达的规律，并生成合成的基因表达数据。以下是一个通俗易懂的举例： 假设我们有一个基因表达数据集，其中包含了许多基因的表达水平数据。我们想要训练一个深度学习模型，能够学习到这些基因表达数据的分布和规律，并且能够生成与之类似的合成 ......
胡银根：华中农业大学乡村振兴研究院胡教授《关于数字化促进乡村振兴专访》 全文
“故人具鸡黍，邀我至田家。绿树村边合，青山郭外斜。” 孟浩然笔下的这幅乡村美景让人陶醉其中，仿佛置身于一片宁静祥和的田园风光之中。 然而，时光荏苒，如今乡村振兴已然迎来新的时代。 传统的乡村景象不再局限于孟浩然时代的诗意描绘，如同一幅油画，奢靡而静态。 如今的乡村，正在逐渐插上“数字翅膀”，焕发出勃 ......
3ds Max 建模基础教程：创建棕榈植物
在本教程中，我们将学习如何使用其花盆创建棕榈植物，首先我们将对花盆进行建模，然后设置叶子和纹理，我从谷歌搜索中找到了纹理，这是一个完美的开始，在本教程结束时，您将能够创建任何类型的基于不透明度的植物， 要开始本教程，您应该具备 3ds Max 的中级知识，并且您将需要这些纹理，或者非常欢迎您使用自己... ......
ENVI能够仅仅基于植物的外形形态特征进行高分辨率影像的精确到植株分类个数统计吗？
听上去好像跟opencv的目标识别一样？只是tif影像只有DOM地物的顶部信息。。而且还有坐标信息。 分类：地面、其它(植物) 参考：https://www.zhihu.com/question/455962599 ......
基因与基因型的关系
基因（gene）是能够编码蛋白质或者RNA等具有特定功能产物的/负载遗传信息的基本单位，即有遗传效应的DNA片段 一个基因上有很多个位点，即碱基对ATGC，有某些位点杂合或纯合会导致不同的蛋白功能，从而变现出不一样的表型或症状，杂合或纯合就是不同的基因型 ......
易基因： DNA甲基化差异水平分析中的DMC、DMR、DMG鉴定 | 干货分享
大家好，这里是专注表观组学十余年，领跑多组学科研服务的易基因。 DNA甲基化（DNA methylation）为DNA化学修饰的一种形式，能够在不改变DNA序列的前提下，改变遗传表现。所谓DNA甲基化是指在DNA甲基化转移酶的作用下，在基因组CpG二核苷酸的胞嘧啶5号碳位共价键结合一个甲基基团。大量 ......
SNP位点前后各50kb区间的基因
#!/usr/bin/perluse strict;use warnings;use Tie::File; my %genes;my @lines; tie @lines, 'Tie::File', 'D:\\Desktop\\3.txt' or die "Cannot open file: $!\ ......
去除内容多余样式php函数-文章来源 植物号 www.zhiwuhao.com
去除内容多余样式php函数-文章来源 植物号 www.zhiwuhao.com function KillStyle($content) { $content = preg_replace("/STYLE=.+?['|\"]/i",'',$content);//去除样式 $content = pre ......
分面火山图--分别展示top25的基因
点击查看代码 ``` object.markers 0.15) #所有差异基因 #View(sig_dge.all) library(dplyr) object.markers % filter(p_val_adj % mutate(Difference = pct.1 - pct.2) libra ......
易基因： RRBS揭示基于DNA甲基化驱动基因的肾透明细胞癌预后模型的鉴定和验证｜项目文章
大家好，这里是专注表观组学十余年，领跑多组学科研服务的易基因。 肾细胞癌（RCC）是最常见的肾癌亚型，每年超400万例新发病例，是泌尿系统恶性肿瘤导致的第二大死因。2%-70%的RCC为透明细胞RCC（Clear cell renal cell carcinoma，ccRCC）。DNA甲基化（DNA ......
方芳：西农大《中国式现代化与基层治理创新高端论坛》--徐勇教授讲话学习笔记划重点
“中国式现代化”是一个过程、一种路径，也是一种具有内在质的规定性的规范， 并建构人的思维方式，它引导基层治理的高质量研究。 基层治理是国家治理的基础性部分。 相对于中央决策的高层政治而言，基层治理被称之为“低政治”的范围。 “低政治”的地位并不低。自上世纪90年代末，基层治理开始成为一个热门领域， ......
会议记录——南开大学胡献刚教授：基于环境大数据分析的生物固碳作用研究
会议报告了机器学习方法在生物固碳两个方面的应用：海洋浮游植物固碳和高等植物生长，分享了在这两个方面所使用的机器学习方法和模型。 ......
GSVA | 基因集变异分析 | 基因集通路打分
前作 转录相关signalling pathway活性打分 | 常见打分系统 | PROGENy 基于基因表达的打分模型 几种常见的打分方法： mean，最简单 Seurat的AddModuleScore，多了一个背景基因集，消除背景的影响，没什么意义，相当于设置了一个House keeping g ......