基因 表观 微生物 细菌
易基因｜表观遗传学与脑卒中：DNA甲基化的作用及衰老对血脑屏障修复的影响
大家好，这里是专注表观组学十余年，领跑多组学科研服务的易基因。 脑卒中（俗称中风）是导致死亡和长期残疾的主要原因，尤其是对于老龄人来说。脑卒中的平均生存时间为6-7年，许多患者存在身体残疾和晚期认知功能障碍。脑卒中后的神经功能预后取决于许多因素，包括年龄、梗死面积和部位、遗传因素以及脑修复程度。脑卒 ......
Inducible shRNA | 可诱导的shRNA基因敲除技术
前言 什么是siRNA，什么是shRNA？Small interfering RNA (siRNA)，Small hairpin RNAs (shRNA) 什么是可诱导shRNA？ 该系统工作的核心原件有哪些？Dicer、Ago、RNA-Induced Silencing Complex (RISC ......
PCR Genotyping | 利用PCR来确定基因型
前面已经利用了PCR做了一些核心的实验： 目标区域扩增 实时定量mRNA 这里的目的还是目标区域扩增，不过material不再是细菌DNA，而是human cancer cell line的DNA（只需要几千细胞即可）。 Kits和protocol： 2X Phire Tissue Direct P ......
为什么要研究Nipponbare NRT1.1Bjaponica和Nipponbare NRT1.1Bindica的根系微生物群落差异？
研究Nipponbare NRT1.1Bjaponica和Nipponbare NRT1.1Bindica的根系微生物群落差异有助于我们更好地了解NRT1.1B基因对水稻根系微生物群落的影响。Nipponbare NRT1.1Bjaponica和Nipponbare NRT1.1Bindica是两个 ......
为什么要研究籼稻和粳稻亚种根系微生物群的差异？
研究籼稻和粳稻亚种根系微生物群的差异有助于我们更好地了解水稻根系微生物群落的组成和功能。这些微生物与水稻植株有着密切的相互作用，能够影响水稻的生长发育、养分吸收和抗病能力。通过比较不同亚种根系微生物群的差异，我们可以发现哪些微生物在不同亚种中起到重要作用，为水稻栽培和育种提供重要参考。 ......
易基因：近期染色质免疫共沉淀测序（ChIP-seq）研究成果｜项目集锦
大家好，这里是专注表观组学十余年，领跑多组学科研服务的易基因。 在生物学研究中，DNA与蛋白质之间的互作（DNA-Protein Interactions，DPIs）是至关重要的，参与基因的表达、调控、复制、重组和修复以及RNA的转运、翻译和调控等多个过程，几乎涉及所有的生命活动。本期以科研内容为序 ......
Note of Introduction to Bioorganic Chemistry and Chemical Biology: Part 1 (《化学生物学》读书笔记：第一部分)
## Chapter 1: The Fundamentals of Chemical Biology (第 1 章 化学生物学基础) ### 1.0 INTRODUCTION (引子) #### 1.0.1 Why organize a book on chemical biology around ......
根据SRA号和参考基因组统计测序的X数
以SRR1770413 为例： 001、测序的碱基数目 测序碱基数目为：387.2M。 002、参考基因组的大小 a、下载参考基因组，并统计基因组的大小 [root@PC1 test01]# ls GCF_000005845.2_ASM584v2_genomic.fna.gz [root@PC1 t ......
如何统计参考基因组的大小
以绵羊为例： 001、下载绵羊参考基因组 a、 b、 [root@PC1 test02]# wget https://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/genomes/all/GCF/016/772/045/GCF_016772045.1_ARS-UI_Ramb_v2.0/GCF_01677 ......
U-Net: 专注生物医学分割的卷积神经网络（翻译）
>原文链接：https://arxiv.org/pdf/1505.04597.pdf **摘要：**普遍认为，优秀的深度神经网络离不开数千个标注训练样本。在本文中，我们提出了一种网络和训练策略：该策略通过使用大量数据增强，从而充分利用带标注的训练样本；该网络结构包括了用于捕获上下文的收缩路径和用于实 ......
生物识别技术在安全领域中的应用：保护个人信息
[toc] 生物识别技术在安全领域中的应用：保护个人信息 随着科技的不断发展，生物识别技术逐渐成为人们日常生活中不可或缺的一部分。生物识别技术通过扫描或检测生物特征，实现身份验证、授权和管理的功能，可以有效地保护个人信息和隐私安全。本文将详细介绍生物识别技术在安全领域中的应用及其特点，旨在为读者提供 ......
机器学习算法在生物信息学中的应用
[toc] 生物信息学是一门跨学科的科学，涵盖了生物统计学、生物信息学、计算机科学、统计学和数学等多个学科，主要研究生物信息学数据库的设计、开发、维护和管理，以及生物信息学算法的实现和优化等方面的知识。随着科技的不断发展，生物信息学在科学研究和生物技术领域中的应用越来越广泛，已经成为一个非常重要的研 ......
易基因：ChIP-seq等揭示METTL14调控哺乳动物二价结构域的表观遗传机制｜科研进展
大家好，这里是专注表观组学十余年，领跑多组学科研服务的易基因。 组蛋白及其翻译后修饰在调控基因表达和其他染色质模板化过程中起着重要作用。组蛋白H3赖氨酸4三甲基化（H3K4me3）和组蛋白H3K27me3分别在小鼠植入前胚胎的基因激活和基因抑制中发挥重要作用。H3K4me3和H3K27me3组成的染 ......
植物全基因组选择（GS）研究进展
[toc] > 徐扬老师综述得很到位，读完此文基本能对目前植物GS有个大概的了解。  类似，做一个 trie 上的二维 dp，复杂度 ......
易基因：组学研究揭示不同牛品种的DNA甲基化、染色质和基因表达互作机制｜科研进展
大家好，这里是专注表观组学十余年，领跑多组学科研服务的易基因。 在全球范围内，牛为60多亿人提供了重要的营养来源。传染病是养牛生产的主要限制因素，且许多疾病人畜共患，因此与人类健康直接相关。近年来牛的许多复杂性状遗传基础得到了广泛研究，但不同动物的大量重要表型变化仍无法解释，人们越来越关注非遗传变异 ......
生物信息
生物信息 2020-10-30 14:27 张晓堃 生物信息学是研究生物信息的采集、处理、存储、传播，分析和解释等各方面的学科，它通过综合利用生物学、计算机科学和信息技术而揭示大量而复杂的生物数据所赋有的生物学奥秘。 我们研究生物信息学的角度是从生物医学领域文献的检索、分析和挖掘发现生物医学的隐含知 ......
题解 P9196【[JOI Open 2016] 销售基因链】
套路题，来讲个套路解法。 如果没有后缀的要求，答案就是 trie 树的子树内字符串数量。现在加上了后缀，尝试继续使用 trie 树解决问题。 我们建立两棵 trie 树 $T_1,T_2$，其中 $T_1$ 是正常的 trie 树，$T_2$ 是每个字符串翻转后的 trie 树。这样的话，包含给定后 ......
生物押题，从入门到放弃
**今天是国际生物多样性日，祝中考顺利** 顺便押题： 26.（6分）2023年国际生物多样性日全球主场活动在昆明举行。今年国际生物多样性日的主题是“从协议到协力：复元生物多样性”。下表显示了昆明部分生物类群的初步调查结果。 $, **状态转移模型** $\mathrm{Result}(S,a)$, **目标状态** $T$, **路径花费** $\mathrm{Cost}:\mathrm{Pat ......
比较新冠病毒与蝙蝠和穿山甲冠状病毒基因组/蛋白序列比对，更好地了解COVID-19病原体SARS-CoV-2的起源与进化
比较新冠病毒与蝙蝠和穿山甲冠状病毒基因组/蛋白序列比对，更好地了解COVID-19病原体SARS-CoV-2的起源与进化 作者：王怡然 石育 赵月馨 沈讯 摘要：在新冠病毒COVID-19大流行的时代背景下，病毒的遗传信息对于其分类和可追溯性及其致病性至关重要。在全基因组水平上，SARS-CoV-2 ......
基于多源生物信息发现新蛋白并对E18分析
摘要：挖掘必要的蛋白质对于发现细胞的组织和生存过程至关重要。目前，检测必需蛋白质的计算方法很多。然而，这些现有的方法只关注网络的拓扑信息，而忽略了蛋白质的生物信息，导致对必需蛋白质的识别准确率较低。因此，本文提出了一种新的关键蛋白质预测策略，称为DEP-MSB，它综合了多种生物信息，包括基因表达谱、 ......
基于过敏反应的生物信息学相关文献学习报告
基于过敏反应的生物信息学相关文献学习报告 小组成员及分工： 童佩22020080041 基于过敏反应的生物信息学预测方法的文本编辑 赵昕22020080069 资料搜集及前言，结论的文本编辑 赵妍22020080070基于过敏反应的生物信息学预测方法的文本编辑 周荣咪22020080073基于生物信 ......
潘毅 美国医学与生物工程院院士、欧洲科学与艺术院院士、乌克兰国家工程院外籍院士、生物信息学领域专家
美国医学与生物工程院院士、欧洲科学与艺术院院士、乌克兰国家工程院外籍院士、生物信息学领域专家 潘毅，1960年5月出生于江苏吴江，汉族，生物信息学领域专家，美国医学与生物工程院院士，欧洲科学与艺术院院士，乌克兰国家工程院外籍院士，英国皇家公共卫生学院院士，中国科学院深圳理工大学计算机科学与控制工程学 ......
20年前“AI先生”李彦宏差点去当生物学家？真相令人惊讶
20年前“AI先生”李彦宏差点去当生物学家？真相令人惊讶 中国青年网 2019-11-26 09:56中国青年网官方帐号 关注 众所周知，从1999年至今是中国互联网快速发展的20年，同时也是孕育无数企业家的20年。作为中国最成功的企业之一，百度成立20年来在互联网发展中功不可没。但你一定不知道，百 ......
【高中生物必修二】第四章 基因的表达
#第一节 基因指导蛋白质的合成 细胞核的DNA可以帮助合成细胞质的蛋白质，这一过程收到中间物质RNA的帮助。 RNA是由核苷酸组成（脱氧核糖的2号H变为OH），碱基从T变为U。RNA一般是单链，比DNA短，因此可以通过核孔从细胞核转移到细胞质。 RNA主要分为三种 - 信使（messenger）RN ......