基因 表观 微生物 细菌
宏基因组技术及其在微生物学研究中的应用
《宏基因组技术及其在微生物学研究中的应用》 学 院： 食品与生物工程学院 小组成员：颜传永 22020080057 材料收集 尹立来 22020080059 材料收集 余文韬 22020080060 文本编写 鄢楚洋 22020080056 文本编写 二○二三年 六 月 宏基因组技术及其在微生物学研 ......
土壤微生物组——从宏基因组学到元基因组学
土壤微生物组——从宏基因组学到元基因组学 摘要：土壤微生物主导着包括植物生长和碳等其他营养物质循环在内的各种重要过程。然而，大多数土壤微生物尚未被分离出来，它们的功能在很大程度上是未知的。虽然宏基因组测序揭示了微生物的物种信息和功能基因信息，但它包含了很多具有巨大不同生理状态下的微生物DNA。因此， ......
细菌素基因在植物乳杆菌各谱系中的分布
小组成员及分工： 组长-封徐杰-选定课题组研究相关的生物信息学文献，组织讨论文献中内容以及分析工具和方法，博客的最终提交； 组员-李震-负责文献大部分的翻译工作； 组员-庹冉-负责文献中采用的生物信息学方法的介绍； 组员-江思近-负责博文初稿的进一步润色。 介绍 植物乳杆菌，以前被命名为"植物乳杆菌 ......
生物必修一
# 1. 走进细胞 ## 1.1 细胞是生命活动的基本单位 > 聚焦 - 细胞学说内容&意义 - 细胞学说建立过程 - 理解细胞是基本的生命系统 > 细胞学说 1. 细胞是一个**有机体**，一切动植物都由细胞发育而来，并由细胞和细胞产物所构成 2. 细胞是一个**相对独立的单位**，既有它自己的生 ......
易基因：全基因组DNA甲基化和小RNA分析揭示甘蓝型油菜种子的基因组不对称性
大家好，这里是专注表观组学十余年，领跑多组学科研服务的易基因。 多倍体是被子植物基因组进化中的一种持续现象，有助于现存开花植物的多样性。甘蓝型油菜（Brassica napus）是世界上最重要的被子植物油料作物品种之一，起源于Brassica rapa（An）和Brassica oleracea（C ......
生物信息学-多序列对比
多序列比对时的注意事项 序列的名字建议 多序列比对的工具 演示的在线工具是：Clustal Omega 使用在先对比工具可以对序列进行分析，使用fasta格式文件直接导入，能够自动识别。 有矩阵和关系树来了解不同序列的关系。 Tcoffee：多序列对比工具，算法上与Clustal系列类似，准确度上别 ......
人CREB蛋白的生物信息学分析
小组成员：潘情情 2010020113（文献查找、论文撰写背景介绍部分、小组展示PPT制作）杨可 2010020125（文献查找、论文撰写材料与方法部分）丁欣玥 2010020101（文献查找、论文撰写材料与方法部分）徐诺 2010020114（文献查找、论文撰写讨论与结论部分、小组展示演讲） 结合 ......
【高中生物必修二】第三章 基因和DNA
# 第一节 DNA是主要的遗传物质 最初20世纪20年代，人们发现蛋白质由氨基酸组成，并猜测氨基酸的多种排列组合蕴含遗传信息。因为当时没有其他大分子有类似的特征，所以大家认为蛋白质是遗传物质。 20世纪30年代，科学家发现DNA由脱氧核苷酸（磷酸，碱基和脱氧核糖）组成。四种碱基（ATGC）构成四种脱 ......
从宏基因组测序数据生成宏基因组组装基因组的计算工具
从宏基因组测序数据生成宏基因组组装基因组的计算工具 小组成员及分工 王嘉璐 22020080046：负责摘要、引言部分 王涵 22020080045：负责用于构建mag的上游分析工具部分 王婷 22020080047：负责总结，查找文献，博文整理汇总 1 摘要 微生物本质上与地球上的人类生活有着错综 ......
生物信息学技术在病原生物学中的应用
廉俊微 周圆 金媛悦 李冰艳 【摘要】生物信息学是在生命科学的研究中，以计算机为工具对生物信息进行储存、检索和分析的科学。它是当今生命科学和自然科学的重大前沿领域之一，同时也将是21世纪自然科学的核心领域之一。随着基因组、蛋白质组数据库的完善，生物信息学运用于医学研究的各个领域成为一种必然趋势。在病 ......
【高中生物必修二】第二章 基因和染色体
# 第一节 减数分裂与受精作用 减数分裂是两倍体细胞（有性繁殖）产生单倍体配子的过程，简单而言，染色体的数量变为一半。二倍体细胞中每一对染色体大小形态意义类似，一个从母方获得，一个从父方获得，故一对染色体也会有差距。有丝分裂产生复制品，往往用于常被磨损的细胞，例如皮肤。减数分裂的主要目的是增加遗传多 ......
生物信息学及其在乳酸菌进化和益生潜力研究中的作用
小组成员：组长丁雅瑞 董若萌22020080007：负责1.介绍 2.生物信息学在LAB适应和进化研究中的应用 3.泛核基因组分析 龚渊22020080012：负责4.新陈代谢 5.LAB的适应与进化 6.特定生态位的适应和专业化 丁雅瑞22020080006：负责7.生物信息学在潜在益生菌LAB初 ......
蛋白质结构生物信息学
蛋白质结构生物信息学 参与人员：张航22020080140 白艳梅22020080001 徐旭22020080135 张章晟22020080144 摘要：蛋白质结构生物信息学有很多功能，可以进行蛋白质建模、蛋白质对接、蛋白质分子动力学和蛋白质相互作用。本博文简要介绍了蛋白质结构生物信息学的主要领域， ......
菜心bZIP基因家族分析报告
菜心bZIP基因家族分析报告 菜心（Brassica campestris L.ssp.chinensis var.utilis Tsen et Lee），又名菜薹，是十字花科芸薹属白菜亚种的变种。作为我国华南地区的特产蔬菜之一，其品质柔嫩，营养丰富，深受消费者的喜爱。菜心生长周期短，复种指数高，可 ......
硒蛋白的生物信息学
硒蛋白的生物信息学 李思思 孟琪 金伟萍 摘要：生物信息学为硒的研究领域带来了重要的启示。过去二十年来，随着基因组资源的不断增长，计算工具的发展取得了进展，为研究硒蛋白提供了新的机会。本文综述了硒蛋白基因发现和其他硒生物学研究的生物信息学方法。最近的进展完整的硒蛋白组的可用性可以评估在整个生命树中硒 ......
猕猴桃 bHLH 转录因子家族的鉴定及生物信息学分析
猕猴桃 bHLH 转录因子家族的鉴定及生物信息学分析 参与人员：毛甲绪22020080029；陶蓉22020080040；郑慧敏22020080071；沈智峰22020080032 背景 在植物中，第一个被发现的 bHLH 超基因家族成员是玉米 R 基因，实验证明其在花青素合成中起到关键作用（Lud ......
生物信息学在蛋白质组学中的应用
生物信息学在蛋白质组学中的应用 朱贺 何博文 朱思颖 周雨薇 1 蛋白质组学 1.1 概述 蛋白质组学（Proteomics）从整体的角度分析细胞内动态变化的蛋白质组成成分、表达水平与修饰状态，了解蛋白质之间的相互作用与联系，从而揭示蛋白质功能与细胞生命活动规律，其逐渐成为当前生物学研究的热点和突破 ......
生物信息学 作业(1)
新型冠状病毒SARS-CoV-2 S蛋白基因的变异与进化分析食硕2201班 汪睿劼 22020080043食硕2201班 张 琦 22020080063食硕2201班 孙 允 22020080037食硕2201班 韩秋雨 22020080015摘要：新型冠状病毒SARS-CoV-2 引发的人类冠状病 ......
机器学习在生物信息学领域的应用与研究进展
生物2001 朱腾骞 肖义燃 伍紫来 邹智伟 一 人工智能是计算机科学领域一个重要的分支，可概括为通过计算机程序来呈现人类智能活动规律的技术系统。机器学习是人工智能领域重要的组成部分，也是实现人工智能的一个重要途径。机器学习使计算机能够模拟人类的学习行为，自发地通过学习来获得知识和生活技能，也在学习 ......
生物信息学-新型冠状病毒SARS-CoV-2 S蛋白基因的变异与进化分析
新型冠状病毒SARS-CoV-2 S蛋白基因的变异与进化分析 食硕2201班 汪睿劼 22020080043 食硕2201班 张 琦 22020080063 食硕2201班 孙 允 22020080037 食硕2201班 韩秋雨 22020080043 摘要：新型冠状病毒SARS-CoV-2 引发的 ......
易基因｜一种全新的检测DNA羟甲基化的技术：ACE-Seq
大家好，这里是专注表观组学十余年，领跑做组学科研服务的易基因。今天给大家介绍一种全新的检测DNA羟甲基化的技术：APOBEC-coupled epigenetic sequencing，简称【ACE-seq】。 前言 DNA序列中胞嘧啶（C）5’ 碳位结合一个甲基基团而转变成5mC的现象称为DNA基 ......
【高中生物必修二】
# 第一章 遗传因子 ## 1.1 孟德尔豌豆杂交实验和单一性状 融合遗传指双亲的遗传物质在子代内产生混合，使子代表现出介于双亲之间的性状（特征），双亲遗传物质融合至子代且无法还原。 孟德尔反对融合遗传理论，认为"融合"过程并不是随机混乱，而是有所规律的。孟德尔希望用简单明了的方法证明遗传中的规律， ......
ChatGPT在生物医学领域的应用
目前，人工智能在生物医学领域的应用已经取得了令人瞩目的进展，ChatGPT作为一种基于人工智能的聊天机器人模型，因其具有强大的自然语言处理和生成能力，在生物医学领域有着广泛的应用潜力。在本研究中探索了ChatGPT在生物医学领域的三个分支中的应用潜力，包括医疗设备、生物信息学、医学成像，并提出了一个... ......
微生物测序：应用于人类肠道微生物组具有菌株分辨率的高通量单微生物基因组学
Microbe-seq: high-throughput, single-microbe genomics with strain resolution, applied to a human gut microbiome doi: https://doi.org/10.1101/2020.12.1 ......
易基因：小檗碱通过介导m6A mRNA甲基化调控斑马鱼肝细胞氧化应激、凋亡和自噬
大家好，这里是专注表观组学十余年，领跑多组学科研服务的易基因。 中药小檗碱（Berberine，BBR，化学式C20H18NO4）是从几种药用植物中分离出的一种异喹啉季生物碱，包括小檗（Berberis aristata）和黄连（Coptis chinensis）。小檗碱可改善脂质代谢紊乱诱导的细胞 ......
网络隔离的生物制药企业，如何实现安全的跨网数据交换？
在数字时代，生物制药企业结合现代技术追求和实现生物科技领域上的突破，研发及生产出更多满足人体健康需求的药物及医疗技术。由于生物制药企业，在进行某一领域的科研时通常周期较长、且涉及很多创新性成果，因此，科研数据就显得尤为重要。 为保护企业的核心研发成果、保障企业数字资产安全，国内很多领先的生物制药企业 ......
R：Wilcoxon秩和检验，比较两组样本中的基因表达差异
setwd("E:\\20220927宏基因组教学\\02后期分析\\05willcox")library(doBy)gene <- read.table('table.l5.relative-SE.txt', sep = '\t', row.names = 1, header = TRUE, st ......
生物医学相关的国际学术会议
生物医学是一门涉及到医学、工程学、物理学和计算机科学等多个领域的交叉学科，其研究范围广泛，相关的学术会议也比较多。以下是一些生物医学相关的国际学术会议： IEEE Engineering in Medicine and Biology Society (EMBS) Annual Internatio ......
BioinformaticsMeeting以下是一些生物信息学领域的会议和期刊：
# BioinformaticsMeeting生物信息学学术会议 以下是一些生物信息学领域的会议和期刊： 会议： 国际基因组学和基因组医学会议（International Conference on Genomics and Genomic Medicine, ICGGM）ACM Conferenc ......