变异 基因 蛋白sars-cov
【高中生物必修二】第三章 基因和DNA
# 第一节 DNA是主要的遗传物质 最初20世纪20年代，人们发现蛋白质由氨基酸组成，并猜测氨基酸的多种排列组合蕴含遗传信息。因为当时没有其他大分子有类似的特征，所以大家认为蛋白质是遗传物质。 20世纪30年代，科学家发现DNA由脱氧核苷酸（磷酸，碱基和脱氧核糖）组成。四种碱基（ATGC）构成四种脱 ......
从宏基因组测序数据生成宏基因组组装基因组的计算工具
从宏基因组测序数据生成宏基因组组装基因组的计算工具 小组成员及分工 王嘉璐 22020080046：负责摘要、引言部分 王涵 22020080045：负责用于构建mag的上游分析工具部分 王婷 22020080047：负责总结，查找文献，博文整理汇总 1 摘要 微生物本质上与地球上的人类生活有着错综 ......
【高中生物必修二】第二章 基因和染色体
# 第一节 减数分裂与受精作用 减数分裂是两倍体细胞（有性繁殖）产生单倍体配子的过程，简单而言，染色体的数量变为一半。二倍体细胞中每一对染色体大小形态意义类似，一个从母方获得，一个从父方获得，故一对染色体也会有差距。有丝分裂产生复制品，往往用于常被磨损的细胞，例如皮肤。减数分裂的主要目的是增加遗传多 ......
蛋白质结构生物信息学
蛋白质结构生物信息学 参与人员：张航22020080140 白艳梅22020080001 徐旭22020080135 张章晟22020080144 摘要：蛋白质结构生物信息学有很多功能，可以进行蛋白质建模、蛋白质对接、蛋白质分子动力学和蛋白质相互作用。本博文简要介绍了蛋白质结构生物信息学的主要领域， ......
菜心bZIP基因家族分析报告
菜心bZIP基因家族分析报告 菜心（Brassica campestris L.ssp.chinensis var.utilis Tsen et Lee），又名菜薹，是十字花科芸薹属白菜亚种的变种。作为我国华南地区的特产蔬菜之一，其品质柔嫩，营养丰富，深受消费者的喜爱。菜心生长周期短，复种指数高，可 ......
硒蛋白的生物信息学
硒蛋白的生物信息学 李思思 孟琪 金伟萍 摘要：生物信息学为硒的研究领域带来了重要的启示。过去二十年来，随着基因组资源的不断增长，计算工具的发展取得了进展，为研究硒蛋白提供了新的机会。本文综述了硒蛋白基因发现和其他硒生物学研究的生物信息学方法。最近的进展完整的硒蛋白组的可用性可以评估在整个生命树中硒 ......
生物信息学在蛋白质组学中的应用
生物信息学在蛋白质组学中的应用 朱贺 何博文 朱思颖 周雨薇 1 蛋白质组学 1.1 概述 蛋白质组学（Proteomics）从整体的角度分析细胞内动态变化的蛋白质组成成分、表达水平与修饰状态，了解蛋白质之间的相互作用与联系，从而揭示蛋白质功能与细胞生命活动规律，其逐渐成为当前生物学研究的热点和突破 ......
蛋白质的结构的预测与 TCP 转录因子家族功能冗余分析
蛋白质的结构的预测与 TCP 转录因子家族功能冗余分析 生物信息学伴随着人类基因组计划的发展而产生，生物信息学是一门交叉学科，它包含了生物信息的获取、加工、储存、分配、分析、解释等在内的所有方面，它运用数学、计算机科学和生物学的各种工具来阐明和理解大量的数据所包含的生物学意义。生物信息学是生命科学领 ......
生物信息学-新型冠状病毒SARS-CoV-2 S蛋白基因的变异与进化分析
新型冠状病毒SARS-CoV-2 S蛋白基因的变异与进化分析 食硕2201班 汪睿劼 22020080043 食硕2201班 张 琦 22020080063 食硕2201班 孙 允 22020080037 食硕2201班 韩秋雨 22020080043 摘要：新型冠状病毒SARS-CoV-2 引发的 ......
易基因｜一种全新的检测DNA羟甲基化的技术：ACE-Seq
大家好，这里是专注表观组学十余年，领跑做组学科研服务的易基因。今天给大家介绍一种全新的检测DNA羟甲基化的技术：APOBEC-coupled epigenetic sequencing，简称【ACE-seq】。 前言 DNA序列中胞嘧啶（C）5’ 碳位结合一个甲基基团而转变成5mC的现象称为DNA基 ......
微生物测序：应用于人类肠道微生物组具有菌株分辨率的高通量单微生物基因组学
Microbe-seq: high-throughput, single-microbe genomics with strain resolution, applied to a human gut microbiome doi: https://doi.org/10.1101/2020.12.1 ......
蛋白质从头测序技术
1 引言 测序技术能够为研究学者带来大量的测序数据，而测序技术的不断优化使得测序数据更加准确。从头测序是一项不依赖于任何已知或参考序列的测序技术，它利用生物信息学分析技术将序列片段进行拼接、组装以实现整个序列的鉴定，可用于未知基因组、转录组和蛋白质的全序列分析。 在蛋白质组学中，利用串联质谱对肽段序 ......
易基因：小檗碱通过介导m6A mRNA甲基化调控斑马鱼肝细胞氧化应激、凋亡和自噬
大家好，这里是专注表观组学十余年，领跑多组学科研服务的易基因。 中药小檗碱（Berberine，BBR，化学式C20H18NO4）是从几种药用植物中分离出的一种异喹啉季生物碱，包括小檗（Berberis aristata）和黄连（Coptis chinensis）。小檗碱可改善脂质代谢紊乱诱导的细胞 ......
R：Wilcoxon秩和检验，比较两组样本中的基因表达差异
setwd("E:\\20220927宏基因组教学\\02后期分析\\05willcox")library(doBy)gene <- read.table('table.l5.relative-SE.txt', sep = '\t', row.names = 1, header = TRUE, st ......
蛋白质测序学习
蛋白质有四级结构，基本单位是氨基酸。氨基酸的分子结构通式为一个氨基-NH2、一个羧基-COOH、一个氢原子-H、一个侧链R基团连接在同一个碳原子上。根据R基团的不同，氨基酸分为20种。氨基酸之间羧基和氨基通过脱水缩合形成肽键-CO-NH-连接在一起,多个氨基酸最终形成一条肽链，肽链上氨基酸的排列顺序 ......
基于三代长读长测序数据的基因组组装算法分析
基于三代长读长测序数据的基因组组装算法分析 吕利王晓利张文娟韩芝侠 宝鸡文理学院电子电气工程学院 摘要：目的 指出当前已有的基于三代测序数据的基因组组装方法的缺陷，并提出改进措施，以提高组装的准确率与运行效率。方法 深入分析当前基于三代长读长测序技术的基因组组装方法，包括基于“校正后组装”策略的FA ......
基于第三代测序数据的结构变异检测方法研究
基于第三代测序数据的结构变异检测方法研究 白若飞 北京化工大学 摘要：第三代测序技术的飞速发展使人们能够通过少量较长的读段推测个体的完整染色体序列,同时推动了基因变异检测的发展。结构变异的准确检测对人类遗传多样性和临床疾病的研究至关重要。传统研究结构变异的方法是将手工提取的变异特征进行参数统计来判别 ......
基于第三代测序数据的基因组结构变异检测方法研究
基于第三代测序数据的基因组结构变异检测方法研究 姜涛 哈尔滨工业大学 摘要：随着测序技术的不断成熟和广泛应用,以测序技术为驱动的基因组、转录组等多组学的研究得到了跨越式发展,推动了基因组科学、遗传学、临床医学等多学科的变革。基因组变异检测作为基因组研究中最为核心和关键的环节,对于基因组注释、与疾病和 ......
基于第三代测序技术的基因组SNP和Indel变异检测关键算法研究
基于第三代测序技术的基因组SNP和Indel变异检测关键算法研究 廖小青 哈尔滨工业大学 摘要：随着生活水平的提升,人们对于自身的好奇促使人们对基因进行研究。其中,变异是人类疾病的一个重要诱因,对变异进行研究可以推动基础生物学和医学的发展。相比于大区域基因组的结构变异,SNP和Indel变异这种小区 ......
基于长读数和重比对的结构变异检测方法研究
基于长读数和重比对的结构变异检测方法研究 杜彩云 河南理工大学 摘要：人类基因中普遍存在结构变异,一些结构变异的发生会产生重大的基因型疾病,这对人类的健康来说是一个巨大的威胁。为了有效治疗这些基因型疾病,最关键的一步是准确检测相应的结构变异类型和位置。常见的结构变异有插入、缺失、倒位和串联重复。其中 ......
基于长读的基因组重复序列查找技术研究
基于长读的基因组重复序列查找技术研究 郭睿 深圳大学 摘要：基因组中出现两次或者两次以上基本相同的序列称为重复序列。重复序列信息可以用来可以分析物种的进化,减少基因比对歧义,降低序列拼接数据缺失。与标准重复序列库对比,基于短读序列数据的重复序列查找技术得到的结果并不完整,平均长度较短。长读数据平均长 ......
面向第三代测序技术的基因组长序列片段比对算法研究
面向第三代测序技术的基因组长序列片段比对算法研究 周佩霞 湖南师范大学 摘要：随着测序技术不断发展和改进,测得的基因组序列片段数据的特征也在不断变化。为适应当前第三代测序技术,基因组序列比对算法需要进行深入的研究和改进,以便更适合于处理第三代测序技术测得的长序列片段数据。本文重点研究分析了基于哈希和 ......
基于MECAT的长读长对相似基因组比对算法的研究与实现
基于MECAT的长读长对相似基因组比对算法的研究与实现 何欣雨 北京交通大学 摘要：基因测序的意义是使人类从根本上认知疾病发生的原因,做到正确的治疗疾病、尽早的预防疾病。例如肿瘤和红斑狼疮等疾病都是和基因变异有关,如果能过通过测序技术知道变异点,对精准治疗,攻克难题有重大意义。第三代测序技术是Pac ......
易基因：全基因组ChIP-seq分析揭示细菌转录因子PhoB的基因内结合位点｜mBio
大家好，这里是专注表观组学十余年，领跑多组学科研服务的易基因。 细菌编码许多转录因子（transcription factor，TF），这些转录因子通过与启动子周围的DNA结合并调控RNA聚合酶（RNAP）全酶以结合启动子DNA或异构化为主动转录构象的能力来调节转录起始。目前对TF功能的研究几乎集中 ......
贝叶斯分位数回归、lasso和自适应lasso贝叶斯分位数回归分析免疫球蛋白、前列腺癌数据|附代码数据
原文链接：http://tecdat.cn/?p=22702 最近我们被客户要求撰写关于贝叶斯分位数回归的研究报告，包括一些图形和统计输出。 贝叶斯回归分位数在最近的文献中受到广泛关注，本文实现了贝叶斯系数估计和回归分位数（RQ）中的变量选择，带有lasso和自适应lasso惩罚的贝叶斯 摘要 还包 ......
速递：惠州学院生科院副院长谢海伟一行莅临易基因科技参观交流
2023年05月26日上午，惠州学院生命科学学院副院长谢海伟教授、陈兆贵教授、陈勇智博士、龚浩博士及生科院本科毕业生陈佳良一行5人莅临深圳市易基因科技有限公司参观交流，并举行“惠州学院实践教学基地“挂牌仪式。易基因总经理王君文、副总经理丁振东等公司领导出席。 交流会现场 “惠州学院实践教学基地“挂牌 ......
使用hiblup计算基因频率和基因型频率
001、测试数据 (base) [root@PC1 test]# ls ## 测试数据， plink格式 outcome.map outcome.ped (base) [root@PC1 test]# cat outcome.map 1 snp1 0 55910 1 snp2 0 85204 1 s ......
2023-05-27 量学基础 十八个涨停基因（转）
涨停基因（十四）——大阳双休（双阴洗盘） 涨停基因（十五）——双剑霸天地 涨停基因（十六）——梯四变异 涨停基因（十七）——现场直憋 涨停基因（十八）——咬住峰顶线 涨停基因（十五）——双剑霸天地 一、双剑霸天地的形态。 双剑霸天地的形态是指：首先出现一根带有长上影线的价柱，长上影线的长度大于价柱总 ......
01.GATK人种系变异最佳实践SnakeMake流程：WorkFlow简介
<~生~信~交~流~与~合~作~请~关~注~公~众~号@生信探索> 学习的第一个GATK找变异流程，人的种系变异的短序列变异，包括SNP和INDEL。写了一个SnakeMake分析流程，从fastq文件到最后的vep注释后的VCF文件，关于VCF的介绍可以参考上一篇推文基因序列变异信息VCF (Va ......