生殖细胞 表观 因子 基因
基于RiceQuant的期货多因子策略实现(一)
### 前言 基于多因子模型理论，介绍其在国内期货的应用，并使用米宽（RiceQuant）的RQFactor进行实现。 ### 理论基础 CAMP： 资产的预期超额收益由 市场组合的预期超额收益 与 资产对市场风险的暴露决定 ![](https://img2023.cnblogs.com/blog/ ......
单细胞分析工具集 | 持续更新
镇楼综述： Best practices for single-cell analysis across modalities - Nature Reviews Genetics - 2023 最新的主流单细胞分析工具集 Milo Differential abundance testing on ......
关于基因组选择（GS）中准确性（accuracy）和预测能力（prediction ability）的区别？
在基因组选择领域，"准确性"（Accuracy）和"预测能力"（Prediction Ability）是两个常用的评价指标，用于衡量基因组选择模型的性能。 在学术研究中，两者都有用到，但没有明显区分，容易出现混用情况。 以下是一篇文章中的定义： https://bmcgenomics.biomedc ......
猎人基因: ADHD的另一面
我在科学的海洋中探索，期待着每一个未知的发现。然而，人类的大脑仍然是一个充满神秘和奥秘的领域。在这一次的探索之旅中，我将带你一起研究一种被称为注意力缺陷多动障碍（Attention Deficit Hyperactivity Disorder，简称ADHD）的情况。一些人称之为“猎人基因”，但这是否 ......
易基因：m5C RNA甲基转移酶及其在癌症中的潜在作用机制｜深度综述
大家好，这里是专注表观组学十余年，领跑多组学科研服务的易基因。 近年来，5-甲基胞嘧啶（m5C）RNA修饰已成为通过编码和非编码RNA调控RNA代谢和功能的关键参与者。越来越多的证据表明，m5C可以调控RNA稳定性、翻译、转录、出核和切割，以及介导细胞增殖、分化、凋亡、应激反应和其他生物学功能。人的 ......
易基因：RNA-BS揭示叶酸调控神经干细胞m5C修饰和mRNA翻译机制｜科研速递
大家好，这里是专注表观组学十余年，领跑多组学科研服务的易基因。 叶酸作为一种必需B族维生素，是一种具有重要生物学功能（包括DNA甲基化调控）的甲基供体。正常的神经发育和生理对细胞叶酸水平很敏感，而叶酸缺乏或过量都可能导致神经系统疾病。最近已有研究表明叶酸与哺乳动物线粒体中tRNA m5C修饰和翻译有 ......
P4795 [BalticOI 2018] 基因工程 题解
题目传送门：[Click](https://www.luogu.com.cn/problem/P4795)。 蒟蒻看见这道题，想了足足一个小时，过后顿有所悟，故作此篇。 首先，看到题目，光是数据就已经达到了 $\operatorname{O}(nm)$ 的级别，再看一看数据范围：$3 \leq n, ......
有限域上多项式因子分解的 Cantor–Zassenhaus 过程以及 Kedlaya–Umans 优化
首先让我们明确计算时间的记号. 我们接下来用 $\tilde O(\bullet)$ 表示忽略 $\log n$ 和 $\log \log q$ 的因子. 因为在计算机代数中考虑的有限域 $\mathbb F_q$ 有可能 $q$ 是非常大的数, 所以计算的过程关于 $\log q$ 的次数也是需要 ......
单细胞实战(1)数据下载-数据读取-seurat对象创建
这篇文章我们将介绍从geo数据库下载单细胞测序数据后，多种数据格式多样本情况下，如何读取数据并创建seurat对象。 本文主要结构： 一、数据下载 二、数据读取与seurat对象创建 - 单样本情况下各种格式数据的读取，读取后seurat对象的创建 - 多样本情况下各种格式数据的读取，读取后seur ......
易基因：单细胞DNA甲基化与转录组分析揭示猪生发泡卵母细胞成熟的关键调控机制｜项目文章
大家好，这里是专注表观组学十余年，领跑多组学科研服务的易基因。 在哺乳动物中，窦卵泡内的生发泡(germinal vesicle，GV) 卵母细胞可以保持数月或数年的静止状态。促黄体生成素(luteinizing hormone，LH)激增促进了减数分裂（meiosis）恢复，使卵母细胞获得受精后和 ......
泛基因组组装方法分类
001、迭代组装； 个体测序数据和参考基因组比对，提取未比对到参考基因组的序列，组装为contig，和参考基因组合并构成泛基因组。（依赖参考基因组） 002、map-to-pan； 个体测序数据组装成contig，然后和参考基因组比对，提取未比对到参考基因组的序列， 和参考基因组合并构成泛基因组。（ ......
使用 ARACNE 方法和合成数据集重建基因调控网络
在生物信息学中，基因调控网络的重建是一个重要的研究领域。这种网络可以揭示基因之间的相互作用，帮助我们理解生物系统的复杂性。在本文中，我将介绍如何使用 ARACNE 方法和合成数据集来重建基因调控网络。 ## ARACNE 方法 ARACNE（Algorithm for the Reconstruct ......
02.FreeIPA、FreeRadius双因子认证
## 一、安装先决条件 1. Rocky 8 （2G内存以上，30G硬盘，镜像源修改为阿里云） ## 二、安装FreeIPA 修改SeLinux、关闭防火墙、更新系统： ```shell timedatectl set-timezone Asia/Shanghai setenforce 0 syst ......
因子分解机介绍和PyTorch代码实现
因子分解机（Factorization Machines，简称FM）是一种用于解决推荐系统、回归和分类等机器学习任务的模型。它由Steffen Rendle于2010年提出，是一种基于线性模型的扩展方法，能够有效地处理高维稀疏数据，并且在处理特征组合时表现出色。它是推荐系统的经典模型之一，并且模型简 ......
关于CA-CFAR中标称化因子（又叫阈值因子或者门限因子）的两种不同结果的推导步骤
前段时间，在自己以前的博客有位网友说程序中的CA-CFAR的门限因子公式求错了，本来想按照网友给的公式直接修改。但又一想还是再找找看吧。看看资料上是怎么说的，在网上找了很多材料，对于CA-CFAR的阈值因子大都是给一个公式，并未给出详细的推导过程；后面又在书上找了相关的资料，但书上给出的都是下面的第 ......
易基因：m6A-seq等揭示RBM33参与调控m6A去甲基化酶ALKBH5活性及其底物选择性
大家好，这里是专注表观组学十余年，领跑多组学科研服务的易基因。 RNA结合蛋白（RNA-binding protein，RBP）是一类结构和功能多样化的蛋白质，参与多种生物过程。越来越多的证据表明，RBP通过调控编码或非编码RNA的可变剪接、转运、稳定性、降解和翻译，在基因表达的转录后调控中发挥着关 ......
keycloak~MFA多因子认证
# MFA多因子认证配置 Keycloak 是一个开源的身份和访问管理解决方案，支持多因素认证（MFA）的配置非常灵活。下面是一些涉及Keycloak MFA相关的配置和步骤： 1. **启用MFA**： - 登录到Keycloak管理控制台。 - 找到您的Realm（领域）并进入Realm设置。 ......
R语言气象模型集成预报：神经网络、回归、svm、决策树用环流因子预测降雨降水数据|附代码数据
全文链接：http://tecdat.cn/?p=31664 我们被客户要求撰写关于气象集成预报技术的研究报告，包括一些图形和统计输出。 随着天气预报技术的发展，数值预报产品日益丰富，预报方法多种多样 （ 点击文末“阅读原文”获取完整代码数据******** ）。 在实际应用中，对每个具体的问题，各 ......
烧死10亿脑细胞的SQL长啥样？
## 1 前言 今天在生产中碰到了一个让我十分费解的 SQL，十分有趣。 ## 2 现象 SQL 很好复现，就是逻辑看起来有点唬人 ``` postgres=# create table test(id1 int,id2 int); CREATE TABLE postgres=# insert in ......
细胞（bfs）
#include<bits/stdc++.h> using namespace std; int dx[4]={1,-1,0,0}, dy[4]={0,0,1,-1}; int bz[100][100]={1},num=0; char s[100][100],ch; bool vis[100][10 ......
基于 Graviton2处理器构建容器化基因分析工作负载
概述 相对于基于传统 x86架构的处理器来说，Amazon 设计的基于 ARM 架构的 Graviton 处理器为 EC2中运行的云工作负载提供了更佳的性价比。基于 Graviton2 的实例支持广泛的通用型、突发型、计算优化型、内存优化型、存储优化型和加速计算型工作负载，包括应用程序服务器、微服务 ......
易基因8种表观转录组m6A MeRIP-seq的差异甲基化区域（DMR）分析软件比较 | 生信专区
大家好，这里是专注表观组学十余年，领跑多组学科研服务的易基因。 RNA甲基化是近年来研究基因表达调控转录后变化的重要研究领域，包括N6-甲基腺苷（m6A）在内的各种类型RNA甲基化参与人类疾病发展。MeRIP-seq作为一种新兴的在转录组范围内定量检测m6A水平的测序技术，拓展了RNA表观遗传学研究 ......
流式细胞术做细胞周期分析 | Cell Cycle Analysis by Flow Cytometry
属于几大functional assays中的一个： Negative-selection competition assay CTG - proliferation colony formation assay cell cycle xenograft 如果你要深入研究一个oncogene或者TS ......
噪声系数测试之Y因子（二）
文章目录 前言一、噪声源ENR二、 Y因子三、测试步骤1、校准（a）2、测量(b)：将DUT接入噪声源和仪器之间 未完待续，下期说说测试过程中的注意事项！ 前言 如何通过测试得到接收机的噪声系数呢？噪声系数分析仪/频谱仪都采用Y因子测试法。那么什么是Y因子呢？如何通过它进行测量呢？我们先来说说噪声源 ......
易基因：ChIP-seq等揭示H3K4me1修饰在蜜蜂级型分化中的表观遗传调控机制｜科研进展
大家好，这里是专注表观组学十余年，领跑多组学科研服务的易基因。 蜜蜂是一种真社会性昆虫，是研究社会性昆虫级型发育和级型分化的重要模式生物，其分工主要基于级型分化（蜂王(queen)和工蜂(worker)）。分化后，尽管基因组相同，但蜂王和工蜂具有不同的形态、生理、行为和寿命相关特征，级型分化的背后机 ......
生成式对抗网络在宏基因组研究中的应用
生成式对抗网络（GAN）在宏基因组研究中也有一些应用，以下是一些具体的应用领域： 宏基因组数据生成：宏基因组研究中，往往需要大规模的微生物组成和功能数据。使用GAN可以生成逼真的宏基因组数据，包括微生物的相对丰度、基因功能注释等，从而扩充数据集的规模和多样性。 数据降噪与去偏：宏基因组数据中存在大量 ......
生成式对抗网络与基因表达模拟
假设我们想要利用深度学习技术来进行基因表达模拟，主要目标是通过模型学习基因表达的规律，并生成合成的基因表达数据。以下是一个通俗易懂的举例： 假设我们有一个基因表达数据集，其中包含了许多基因的表达水平数据。我们想要训练一个深度学习模型，能够学习到这些基因表达数据的分布和规律，并且能够生成与之类似的合成 ......
关于AWS-阿里-堡垒机Console界面-登录-多因子MFA-认证的动态口令生成的python实现
对于很多公司来说、都会要求在登录云平台，如AWS云，阿里云，或者堡垒机Console ，甚至操作系统时，都会要求登录时，进行二次认证 也即是多因素，多因子，MFA认证，关于多因素认证、一般有短信验证码，软件生成code，或者邮件接收Code，都可以实现 今天笔者主要讲述，如何通过python代码进行 ......
Pollard_Rho（大数分解质因子）
###例题：[P4718](https://www.luogu.com.cn/problem/solution/P4718) ###题意： T组数据，输入T个数，对于每个数 n 判断是不是素数，如果是素数输出："Prim",否则输出他的最大质因子。（1 #define IOS ios::sync_w ......