科研进展 二价 表观 基因
华为开发者大会2023：云空间筑牢鸿蒙生态“云基因”
8月4日，华为开发者大会2023在东莞·松山湖举办，众多开发者及合作伙伴共赴盛会，见证鸿蒙生态的最新进展。在本届大会的HarmonyOS应用开发（端云能力）分论坛上，华为Drive Kit生态架构技术总监官宣云空间服务升级，赋能开发者高效开发，为鸿蒙生态应用注入“云基因”。 的概念，指整个物种基因组序列的非冗余集合，其中包括存在于该物种几乎所有个体中的核心基因组(core genome)和仅在部分个体中存在的可变基因组(accessory/variable/dispens ......
易基因：ChIP-seq等揭示转录因子NRF1调控原始生殖细胞发育、增殖和存活的表观遗传机制
大家好，这里是专注表观组学十余年，领跑多组学科研服务的易基因。 原始生殖细胞（Primordial germ cell，PGC）是生殖细胞前体，可以产生卵母细胞和精子，确保生命延续。尽管PGC特化（PGC specification）得到广泛研究，但PGC种群在出生前迁移到胚胎性腺后如何维持和扩大仍 ......
基因测序技术 一二三代
开通黄钻 基因测序技术 基因测序技术 基因测序技术的发展前景非常可观，目前为止共出现了三代测序技术，第一代测序技术以Sanger为主；第二代测序是以Illumina为代表的一系列技术；第三代是以Pacific Biosciences[4]公司和 Nanopore[5]公司的单分子测序为代表的测序技术 ......
三代测序数据从碱基识别、基因组组装、变异检测和甲基化修饰检测等方面的内容
王院长的报告涵盖了针对三代测序数据从碱基识别、基因组组装、变异检测和甲基化修饰检测等方面的内容。 在基因组组装算法方面，王院长分享了其团队在二代和三代测序数据基因组组装算法设计与分析方面的成果和突破。其中，针对长读长测序的高错误率以及错误分布不均匀等问题，王院长介绍了团队设计的一系列基因组组装和po ......
关于基因组选择（GS）中准确性（accuracy）和预测能力（prediction ability）的区别？
在基因组选择领域，"准确性"（Accuracy）和"预测能力"（Prediction Ability）是两个常用的评价指标，用于衡量基因组选择模型的性能。 在学术研究中，两者都有用到，但没有明显区分，容易出现混用情况。 以下是一篇文章中的定义： https://bmcgenomics.biomedc ......
猎人基因: ADHD的另一面
我在科学的海洋中探索，期待着每一个未知的发现。然而，人类的大脑仍然是一个充满神秘和奥秘的领域。在这一次的探索之旅中，我将带你一起研究一种被称为注意力缺陷多动障碍（Attention Deficit Hyperactivity Disorder，简称ADHD）的情况。一些人称之为“猎人基因”，但这是否 ......
金融科技与现代开源技术结合的进展超前到你无法想象！
想要了解最新的金融科技进展吗？ 渴望与其他技术爱好者交流，并扩展您在金融科技行业中的人脉关系吗？ 那么请参加我们即将举行的 Meetup，本次活动由 Apache DolphinScheduler 社区和 OceanBase 技术社区共同举办，聚焦金融科技进展，线上&线下同步，欢迎关注并预约直播。在 ......
易基因：m5C RNA甲基转移酶及其在癌症中的潜在作用机制｜深度综述
大家好，这里是专注表观组学十余年，领跑多组学科研服务的易基因。 近年来，5-甲基胞嘧啶（m5C）RNA修饰已成为通过编码和非编码RNA调控RNA代谢和功能的关键参与者。越来越多的证据表明，m5C可以调控RNA稳定性、翻译、转录、出核和切割，以及介导细胞增殖、分化、凋亡、应激反应和其他生物学功能。人的 ......
易基因：RNA-BS揭示叶酸调控神经干细胞m5C修饰和mRNA翻译机制｜科研速递
大家好，这里是专注表观组学十余年，领跑多组学科研服务的易基因。 叶酸作为一种必需B族维生素，是一种具有重要生物学功能（包括DNA甲基化调控）的甲基供体。正常的神经发育和生理对细胞叶酸水平很敏感，而叶酸缺乏或过量都可能导致神经系统疾病。最近已有研究表明叶酸与哺乳动物线粒体中tRNA m5C修饰和翻译有 ......
P4795 [BalticOI 2018] 基因工程 题解
题目传送门：[Click](https://www.luogu.com.cn/problem/P4795)。 蒟蒻看见这道题，想了足足一个小时，过后顿有所悟，故作此篇。 首先，看到题目，光是数据就已经达到了 $\operatorname{O}(nm)$ 的级别，再看一看数据范围：$3 \leq n, ......
科研统计图汇总
一、常用统计图 常用统计图的适用情况和举例说明如下： 比如：散点图适用于展示两个变量之间的关系情况；直方图适用于展示连续变量的分布情况，判断是否符合正态分布等；箱线图展示一组数据的中位数、四分位数、最大值、最小值等信息，可以用于分析数据分布情况或者是否存在异常值等等。 二、作图思路 首先区分数据类型 ......
易基因：单细胞DNA甲基化与转录组分析揭示猪生发泡卵母细胞成熟的关键调控机制｜项目文章
大家好，这里是专注表观组学十余年，领跑多组学科研服务的易基因。 在哺乳动物中，窦卵泡内的生发泡(germinal vesicle，GV) 卵母细胞可以保持数月或数年的静止状态。促黄体生成素(luteinizing hormone，LH)激增促进了减数分裂（meiosis）恢复，使卵母细胞获得受精后和 ......
泛基因组组装方法分类
001、迭代组装； 个体测序数据和参考基因组比对，提取未比对到参考基因组的序列，组装为contig，和参考基因组合并构成泛基因组。（依赖参考基因组） 002、map-to-pan； 个体测序数据组装成contig，然后和参考基因组比对，提取未比对到参考基因组的序列， 和参考基因组合并构成泛基因组。（ ......
使用 ARACNE 方法和合成数据集重建基因调控网络
在生物信息学中，基因调控网络的重建是一个重要的研究领域。这种网络可以揭示基因之间的相互作用，帮助我们理解生物系统的复杂性。在本文中，我将介绍如何使用 ARACNE 方法和合成数据集来重建基因调控网络。 ## ARACNE 方法 ARACNE（Algorithm for the Reconstruct ......
科研入门 | 用心做学术
修改论文工具： latexdiff；文献管理软件：Zotero/Endnote；知识管理软件： Obsisdan 很好用； 另外，在修改论文时，为了提高效率，不妨考虑使用在线版本控制软件：Overleaf或腾讯文档。（前者更适用于用LaTex写的文章，后者适合用其他办公软件写的文章。） ......
易基因：m6A-seq等揭示RBM33参与调控m6A去甲基化酶ALKBH5活性及其底物选择性
大家好，这里是专注表观组学十余年，领跑多组学科研服务的易基因。 RNA结合蛋白（RNA-binding protein，RBP）是一类结构和功能多样化的蛋白质，参与多种生物过程。越来越多的证据表明，RBP通过调控编码或非编码RNA的可变剪接、转运、稳定性、降解和翻译，在基因表达的转录后调控中发挥着关 ......
科研论文阅读方法
一、如何有效阅读论文？ 1、整理相关领域资源 2、略读收集的文章，从中快速挑出重点文章来仔细阅读（阅读5-20篇文章可以对一个领域有一个basic understanding，阅读50-100篇文章，可以对一个领域有good understanding） 二、如何阅读一篇论文？ 1.首先阅读标题、摘 ......
基于 Graviton2处理器构建容器化基因分析工作负载
概述 相对于基于传统 x86架构的处理器来说，Amazon 设计的基于 ARM 架构的 Graviton 处理器为 EC2中运行的云工作负载提供了更佳的性价比。基于 Graviton2 的实例支持广泛的通用型、突发型、计算优化型、内存优化型、存储优化型和加速计算型工作负载，包括应用程序服务器、微服务 ......
易基因8种表观转录组m6A MeRIP-seq的差异甲基化区域（DMR）分析软件比较 | 生信专区
大家好，这里是专注表观组学十余年，领跑多组学科研服务的易基因。 RNA甲基化是近年来研究基因表达调控转录后变化的重要研究领域，包括N6-甲基腺苷（m6A）在内的各种类型RNA甲基化参与人类疾病发展。MeRIP-seq作为一种新兴的在转录组范围内定量检测m6A水平的测序技术，拓展了RNA表观遗传学研究 ......
易基因：ChIP-seq等揭示H3K4me1修饰在蜜蜂级型分化中的表观遗传调控机制｜科研进展
大家好，这里是专注表观组学十余年，领跑多组学科研服务的易基因。 蜜蜂是一种真社会性昆虫，是研究社会性昆虫级型发育和级型分化的重要模式生物，其分工主要基于级型分化（蜂王(queen)和工蜂(worker)）。分化后，尽管基因组相同，但蜂王和工蜂具有不同的形态、生理、行为和寿命相关特征，级型分化的背后机 ......
生成式对抗网络在宏基因组研究中的应用
生成式对抗网络（GAN）在宏基因组研究中也有一些应用，以下是一些具体的应用领域： 宏基因组数据生成：宏基因组研究中，往往需要大规模的微生物组成和功能数据。使用GAN可以生成逼真的宏基因组数据，包括微生物的相对丰度、基因功能注释等，从而扩充数据集的规模和多样性。 数据降噪与去偏：宏基因组数据中存在大量 ......
生成式对抗网络与基因表达模拟
假设我们想要利用深度学习技术来进行基因表达模拟，主要目标是通过模型学习基因表达的规律，并生成合成的基因表达数据。以下是一个通俗易懂的举例： 假设我们有一个基因表达数据集，其中包含了许多基因的表达水平数据。我们想要训练一个深度学习模型，能够学习到这些基因表达数据的分布和规律，并且能够生成与之类似的合成 ......
知识蒸馏最新进展
前言 本文聚焦于知识蒸馏的近期进展。 本文转载自北邮 GAMMA Lab 作者 | 郭雨心 仅用于学术分享，若侵权请联系删除 欢迎关注公众号CV技术指南，专注于计算机视觉的技术总结、最新技术跟踪、经典论文解读、CV招聘信息。 CV各大方向专栏与各个部署框架最全教程整理 【CV技术指南】CV全栈指导班 ......
基因与基因型的关系
基因（gene）是能够编码蛋白质或者RNA等具有特定功能产物的/负载遗传信息的基本单位，即有遗传效应的DNA片段 一个基因上有很多个位点，即碱基对ATGC，有某些位点杂合或纯合会导致不同的蛋白功能，从而变现出不一样的表型或症状，杂合或纯合就是不同的基因型 ......
金融时间序列预测方法合集：CNN、LSTM、随机森林、ARMA预测股票价格（适用于时序问题）、相似度计算、各类评判指标绘图（数学建模科研适用）
金融时间序列预测方法合集：CNN、LSTM、随机森林、ARMA预测股票价格（适用于时序问题）、相似度计算、各类评判指标绘图（数学建模科研适用） ......
每周工作小进展
2023-05-26 所做工作及结果 将半径改为自适应计算，每个子空间的半径通过子空间的密度和knn来确定，结果如下【limit=1000, r=10】recall@100 = 0.34426R@1 = 0.52160R@10 = 0.53650R@100 = 0.53650构建时间:3763.29 ......